src/jalview/jbgui/GDesktop.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.jbgui;
  22
  23 import jalview.api.AlignmentViewPanel;
  24 import jalview.io.FileFormatException;
  25 import jalview.util.MessageManager;
  26 import jalview.util.Platform;
  27
  28 import java.awt.FlowLayout;
  29 import java.awt.Toolkit;
  30 import java.awt.event.ActionEvent;
  31 import java.awt.event.ActionListener;
  32
  33 import javax.swing.JCheckBoxMenuItem;
  34 import javax.swing.JFrame;
  35 import javax.swing.JMenu;
  36 import javax.swing.JMenuBar;
  37 import javax.swing.JMenuItem;
  38
  39 /**
  40  * DOCUMENT ME!
  41  *
  42  * @author $author$
  43  * @version $Revision$
  44  */
  45 public class GDesktop extends JFrame
  46 {
  47
  48   public static javax.swing.JTabbedPane createTabbedPane()
  49   {
  50     // now just always return JTabbedPane
  51    return new javax.swing.JTabbedPane();
  52 //    // BH 2018 coercing jalview.jbgui.swing.JTabbedPane() for now
  53 //    if (/** @j2sNative false && */
  54 //    true)
  55 //    {
  56 //      // Java
  57 //      return new javax.swing.JTabbedPane();
  58 //    }
  59 //    // JavaScript
  60 //    return (javax.swing.JTabbedPane) (Object) new jalview.jbgui.swing.JTabbedPane();
  61   }
  62
  63
  64   protected static JMenu windowMenu = new JMenu();
  65
  66   JMenuBar desktopMenubar = new JMenuBar();
  67
  68   JMenu FileMenu = new JMenu();
  69
  70   JMenu HelpMenu = new JMenu();
  71
  72   protected JMenu VamsasMenu = new JMenu();
  73
  74   protected JMenu VamsasStMenu = new JMenu();
  75
  76   JMenuItem inputLocalFileMenuItem = new JMenuItem();
  77
  78   JMenuItem inputURLMenuItem = new JMenuItem();
  79
  80   JMenuItem inputTextboxMenuItem = new JMenuItem();
  81
  82   JMenuItem quit = new JMenuItem();
  83
  84   JMenuItem aboutMenuItem = new JMenuItem();
  85
  86   JMenuItem documentationMenuItem = new JMenuItem();
  87
  88   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();
  89
  90   protected JMenu toolsMenu = new JMenu();
  91
  92   JMenuItem preferences = new JMenuItem();
  93
  94   JMenuItem saveState = new JMenuItem();
  95
  96   JMenuItem loadState = new JMenuItem();
  97
  98   JMenu inputMenu = new JMenu();
  99
 100   protected JMenuItem vamsasStart = new JMenuItem();
 101
 102   protected JMenuItem vamsasImport = new JMenuItem();
 103
 104   protected JMenuItem vamsasSave = new JMenuItem();
 105
 106   JMenuItem inputSequence = new JMenuItem();
 107
 108   protected JMenuItem vamsasStop = new JMenuItem();
 109
 110   JMenuItem closeAll = new JMenuItem();
 111
 112   JMenuItem raiseRelated = new JMenuItem();
 113
 114   JMenuItem minimizeAssociated = new JMenuItem();
 115
 116   protected JCheckBoxMenuItem showMemusage = new JCheckBoxMenuItem();
 117
 118   JMenuItem garbageCollect = new JMenuItem();
 119
 120   protected JMenuItem groovyShell;
 121
 122   protected JCheckBoxMenuItem experimentalFeatures;
 123
 124   protected JCheckBoxMenuItem showConsole = new JCheckBoxMenuItem();
 125
 126   protected JCheckBoxMenuItem showNews = new JCheckBoxMenuItem();
 127
 128   protected JMenuItem snapShotWindow = new JMenuItem();
 129
 130   /**
 131    * Creates a new GDesktop object.
 132    */
 133   public GDesktop()
 134   {
 135     super();
 136     try
 137     {
 138       jbInit();
 139       this.setJMenuBar(desktopMenubar);
 140     } catch (Exception e)
 141     {
 142       e.printStackTrace();
 143     }
 144
 145     if (Platform.allowMnemonics())
 146     {
 147         //BH was !Platform.isAMacAndNotJS()) i.e. "JS or not Mac"
 148         // but here we want just not a Mac, period, right?
 149       FileMenu.setMnemonic('F');
 150       inputLocalFileMenuItem.setMnemonic('L');
 151       VamsasMenu.setMnemonic('V');
 152       inputURLMenuItem.setMnemonic('U');
 153       inputTextboxMenuItem.setMnemonic('C');
 154       quit.setMnemonic('Q');
 155       saveState.setMnemonic('S');
 156       loadState.setMnemonic('L');
 157       inputMenu.setMnemonic('I');
 158     }
 159   }
 160
 161   /**
 162    * DOCUMENT ME!
 163    *
 164    * @throws Exception
 165    *           DOCUMENT ME!
 166    */
 167   private void jbInit() throws Exception
 168   {
 169
 170     FileMenu.setText(MessageManager.getString("action.file"));
 171     HelpMenu.setText(MessageManager.getString("action.help"));
 172     VamsasMenu.setText("Vamsas");
 173     VamsasMenu.setToolTipText(MessageManager
 174             .getString("label.share_data_vamsas_applications"));
 175     VamsasStMenu.setText(MessageManager.getString("label.connect_to"));
 176     VamsasStMenu.setToolTipText(
 177             MessageManager.getString("label.join_existing_vamsas_session"));
 178     inputLocalFileMenuItem
 179             .setText(MessageManager.getString("label.load_tree_from_file"));
 180     inputLocalFileMenuItem.setAccelerator(
 181             javax.swing.KeyStroke.getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_O,
 182                     Toolkit.getDefaultToolkit().getMenuShortcutKeyMask(),
 183                     false));
 184     inputLocalFileMenuItem
 185             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 186             {
 187               @Override
 188               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 189               {
 190                 inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(null);
 191               }
 192             });
 193     inputURLMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.from_url"));
 194     inputURLMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 195     {
 196       @Override
 197       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 198       {
 199         try
 200         {
 201           inputURLMenuItem_actionPerformed(null);
 202         } catch (FileFormatException e1)
 203         {
 204           System.err.println("Error loading from URL: " + e1.getMessage());
 205         }
 206       }
 207     });
 208     inputTextboxMenuItem
 209             .setText(MessageManager.getString("label.from_textbox"));
 210     inputTextboxMenuItem
 211             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 212             {
 213               @Override
 214               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 215               {
 216                 inputTextboxMenuItem_actionPerformed(null);
 217               }
 218             });
 219     quit.setText(MessageManager.getString("action.quit"));
 220     quit.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 221     {
 222       @Override
 223       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 224       {
 225         quit();
 226       }
 227     });
 228     aboutMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.about"));
 229     aboutMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 230     {
 231       @Override
 232       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 233       {
 234         aboutMenuItem_actionPerformed(e);
 235       }
 236     });
 237     documentationMenuItem
 238             .setText(MessageManager.getString("label.documentation"));
 239     documentationMenuItem.setAccelerator(javax.swing.KeyStroke
 240             .getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_F1, 0, false));
 241     documentationMenuItem
 242             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 243             {
 244               @Override
 245               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 246               {
 247                 documentationMenuItem_actionPerformed();
 248               }
 249             });
 250     this.getContentPane().setLayout(flowLayout1);
 251     windowMenu.setText(MessageManager.getString("label.window"));
 252     preferences.setText(MessageManager.getString("label.preferences"));
 253     preferences.addActionListener(new ActionListener()
 254     {
 255       @Override
 256       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 257       {
 258         preferences_actionPerformed(e);
 259       }
 260     });
 261     toolsMenu.setText(MessageManager.getString("label.tools"));
 262     saveState.setText(MessageManager.getString("action.save_project"));
 263     saveState.addActionListener(new ActionListener()
 264     {
 265       @Override
 266       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 267       {
 268         saveState_actionPerformed(true);
 269       }
 270     });
 271     JMenuItem saveAsJaxb = new JMenuItem("Save Project as JAXB");
 272     saveAsJaxb.addActionListener(new ActionListener()
 273     {
 274       @Override
 275       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 276       {
 277         saveState_actionPerformed(false);
 278       }
 279     });
 280     loadState.setText(MessageManager.getString("action.load_project"));
 281     loadState.addActionListener(new ActionListener()
 282     {
 283       @Override
 284       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 285       {
 286         loadState_actionPerformed(true);
 287       }
 288     });
 289     JMenuItem loadAsJaxb = new JMenuItem("Load Project as JAXB");
 290     loadAsJaxb.addActionListener(new ActionListener()
 291     {
 292       @Override
 293       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 294       {
 295         loadState_actionPerformed(false);
 296       }
 297     });
 298     inputMenu.setText(MessageManager.getString("label.input_alignment"));
 299     vamsasStart
 300             .setText(MessageManager.getString("label.new_vamsas_session"));
 301     vamsasStart.setVisible(false);
 302     vamsasStart.addActionListener(new ActionListener()
 303     {
 304       @Override
 305       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 306       {
 307         vamsasStart_actionPerformed(e);
 308       }
 309     });
 310     vamsasImport.setText(
 311             MessageManager.getString("action.load_vamsas_session"));
 312     vamsasImport.setVisible(false);
 313     vamsasImport.addActionListener(new ActionListener()
 314     {
 315       @Override
 316       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 317       {
 318         vamsasImport_actionPerformed(e);
 319       }
 320     });
 321     vamsasSave.setText(
 322             MessageManager.getString("action.save_vamsas_session"));
 323     vamsasSave.setVisible(false);
 324     vamsasSave.addActionListener(new ActionListener()
 325     {
 326       @Override
 327       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 328       {
 329         vamsasSave_actionPerformed(e);
 330       }
 331     });
 332     inputSequence
 333             .setText(MessageManager.getString("action.fetch_sequences"));
 334     inputSequence.addActionListener(new ActionListener()
 335     {
 336       @Override
 337       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 338       {
 339         inputSequence_actionPerformed(e);
 340       }
 341     });
 342     vamsasStop
 343             .setText(MessageManager.getString("label.stop_vamsas_session"));
 344     vamsasStop.setVisible(false);
 345     vamsasStop.addActionListener(new ActionListener()
 346     {
 347       @Override
 348       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 349       {
 350         vamsasStop_actionPerformed(e);
 351       }
 352     });
 353     closeAll.setText(MessageManager.getString("action.close_all"));
 354     closeAll.addActionListener(new ActionListener()
 355     {
 356       @Override
 357       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 358       {
 359         closeAll_actionPerformed(e);
 360       }
 361     });
 362     raiseRelated.setText(
 363             MessageManager.getString("action.raise_associated_windows"));
 364     raiseRelated.addActionListener(new ActionListener()
 365     {
 366       @Override
 367       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 368       {
 369         raiseRelated_actionPerformed(e);
 370       }
 371     });
 372     minimizeAssociated.setText(
 373             MessageManager.getString("action.minimize_associated_windows"));
 374     minimizeAssociated.addActionListener(new ActionListener()
 375     {
 376       @Override
 377       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 378       {
 379         minimizeAssociated_actionPerformed(e);
 380       }
 381     });
 382     garbageCollect
 383             .setText(MessageManager.getString("label.collect_garbage"));
 384     garbageCollect.addActionListener(new ActionListener()
 385     {
 386       @Override
 387       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 388       {
 389         garbageCollect_actionPerformed(e);
 390       }
 391     });
 392     showMemusage
 393             .setText(MessageManager.getString("label.show_memory_usage"));
 394     showMemusage.addActionListener(new ActionListener()
 395     {
 396       @Override
 397       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 398       {
 399         showMemusage_actionPerformed(e);
 400       }
 401     });
 402     showConsole
 403             .setText(MessageManager.getString("label.show_java_console"));
 404     showConsole.addActionListener(new ActionListener()
 405     {
 406       @Override
 407       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 408       {
 409         showConsole_actionPerformed(e);
 410       }
 411     });
 412     showNews.setText(MessageManager.getString("label.show_jalview_news"));
 413     showNews.addActionListener(new ActionListener()
 414     {
 415       @Override
 416       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 417       {
 418         showNews_actionPerformed(e);
 419       }
 420     });
 421     groovyShell = new JMenuItem();
 422     groovyShell.setText(MessageManager.getString("label.groovy_console"));
 423     groovyShell.addActionListener(new ActionListener()
 424     {
 425       @Override
 426       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 427       {
 428         groovyShell_actionPerformed();
 429       }
 430     });
 431     experimentalFeatures = new JCheckBoxMenuItem();
 432     experimentalFeatures
 433             .setText(MessageManager.getString("label.show_experimental"));
 434     experimentalFeatures.setToolTipText(
 435             MessageManager.getString("label.show_experimental_tip"));
 436     experimentalFeatures.addActionListener(new ActionListener()
 437     {
 438       @Override
 439       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 440       {
 441         showExperimental_actionPerformed(experimentalFeatures.isSelected());
 442       }
 443     });
 444
 445     snapShotWindow.setText(MessageManager.getString("label.take_snapshot"));
 446     snapShotWindow.addActionListener(new ActionListener()
 447     {
 448       @Override
 449       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 450       {
 451         snapShotWindow_actionPerformed(e);
 452       }
 453     });
 454
 455     desktopMenubar.add(FileMenu);
 456     desktopMenubar.add(toolsMenu);
 457     VamsasMenu.setVisible(false);
 458     desktopMenubar.add(VamsasMenu);
 459     desktopMenubar.add(HelpMenu);
 460     desktopMenubar.add(windowMenu);
 461     FileMenu.add(inputMenu);
 462     FileMenu.add(inputSequence);
 463     FileMenu.addSeparator();
 464     FileMenu.add(saveAsJaxb);
 465     FileMenu.add(loadAsJaxb);
 466     if (!Platform.isJS())
 467     {
 468       FileMenu.add(saveState);
 469       FileMenu.add(loadState);
 470     }
 471     FileMenu.addSeparator();
 472     FileMenu.add(quit);
 473     HelpMenu.add(aboutMenuItem);
 474     HelpMenu.add(documentationMenuItem);
 475     VamsasMenu.add(VamsasStMenu);
 476     VamsasStMenu.setVisible(false);
 477     VamsasMenu.add(vamsasStart);
 478     VamsasMenu.add(vamsasImport);
 479     VamsasMenu.add(vamsasSave);
 480     VamsasMenu.add(vamsasStop);
 481     toolsMenu.add(preferences);
 482     if (!Platform.isJS())
 483     {
 484       toolsMenu.add(showMemusage);
 485       toolsMenu.add(showConsole);
 486     }
 487     if (!Platform.isJS())
 488     {
 489       toolsMenu.add(showNews);
 490       toolsMenu.add(garbageCollect);
 491       toolsMenu.add(groovyShell);
 492     }
 493     toolsMenu.add(experimentalFeatures);
 494     // toolsMenu.add(snapShotWindow);
 495     inputMenu.add(inputLocalFileMenuItem);
 496     inputMenu.add(inputURLMenuItem);
 497     inputMenu.add(inputTextboxMenuItem);
 498     windowMenu.add(closeAll);
 499     windowMenu.add(raiseRelated);
 500     windowMenu.add(minimizeAssociated);
 501     windowMenu.addSeparator();
 502     // inputMenu.add(vamsasLoad);
 503   }
 504
 505   protected void showExperimental_actionPerformed(boolean selected)
 506   {
 507   }
 508
 509   protected void groovyShell_actionPerformed()
 510   {
 511   }
 512
 513   protected void snapShotWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
 514   {
 515     // TODO Auto-generated method stub
 516
 517   }
 518
 519   protected void showConsole_actionPerformed(ActionEvent e)
 520   {
 521     // TODO Auto-generated method stub
 522
 523   }
 524
 525   protected void showNews_actionPerformed(ActionEvent e)
 526   {
 527     // TODO Auto-generated method stub
 528
 529   }
 530
 531   protected void showMemusage_actionPerformed(ActionEvent e)
 532   {
 533     // TODO Auto-generated method stub
 534
 535   }
 536
 537   protected void garbageCollect_actionPerformed(ActionEvent e)
 538   {
 539     // TODO Auto-generated method stub
 540
 541   }
 542
 543   protected void vamsasStMenu_actionPerformed()
 544   {
 545   }
 546
 547   public void vamsasSave_actionPerformed(ActionEvent e)
 548   {
 549   }
 550
 551   /**
 552    * DOCUMENT ME!
 553    *
 554    * @param e
 555    *          DOCUMENT ME!
 556    */
 557   protected void inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(
 558           jalview.gui.AlignViewport av)
 559   {
 560   }
 561
 562   /**
 563    * DOCUMENT ME!
 564    *
 565    * @param e
 566    *          DOCUMENT ME!
 567    * @throws FileFormatException
 568    */
 569   protected void inputURLMenuItem_actionPerformed(
 570           jalview.gui.AlignViewport av) throws FileFormatException
 571   {
 572   }
 573
 574   /**
 575    * DOCUMENT ME!
 576    *
 577    * @param e
 578    *          DOCUMENT ME!
 579    */
 580   protected void inputTextboxMenuItem_actionPerformed(
 581           AlignmentViewPanel avp)
 582   {
 583   }
 584
 585   /**
 586    * DOCUMENT ME!
 587    */
 588   protected void quit()
 589   {
 590   }
 591
 592   /**
 593    * DOCUMENT ME!
 594    *
 595    * @param e
 596    *          DOCUMENT ME!
 597    */
 598   protected void aboutMenuItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 599   {
 600   }
 601
 602   protected void documentationMenuItem_actionPerformed()
 603   {
 604   }
 605
 606   /**
 607    * DOCUMENT ME!
 608    *
 609    * @param e
 610    *          DOCUMENT ME!
 611    */
 612   public void SaveState_actionPerformed(ActionEvent e)
 613   {
 614   }
 615
 616   /**
 617    * DOCUMENT ME!
 618    *
 619    * @param e
 620    *          DOCUMENT ME!
 621    */
 622   protected void preferences_actionPerformed(ActionEvent e)
 623   {
 624   }
 625
 626   /**
 627    * DOCUMENT ME!
 628    *
 629    * @param e
 630    *          DOCUMENT ME!
 631    */
 632   public void saveState_actionPerformed(boolean asCastor)
 633   {
 634   }
 635
 636   /**
 637    * DOCUMENT ME!
 638    *
 639    * @param e
 640    *          DOCUMENT ME!
 641    */
 642   public void loadState_actionPerformed(boolean asCastor)
 643   {
 644   }
 645
 646   /**
 647    * DOCUMENT ME!
 648    *
 649    * @param e
 650    *          DOCUMENT ME!
 651    */
 652   public void loadJalviewAlign_actionPerformed(ActionEvent e)
 653   {
 654   }
 655
 656   public void vamsasStart_actionPerformed(ActionEvent e)
 657   {
 658
 659   }
 660
 661   public void inputSequence_actionPerformed(ActionEvent e)
 662   {
 663
 664   }
 665
 666   public void vamsasStop_actionPerformed(ActionEvent e)
 667   {
 668
 669   }
 670
 671   public void closeAll_actionPerformed(ActionEvent e)
 672   {
 673
 674   }
 675
 676   public void raiseRelated_actionPerformed(ActionEvent e)
 677   {
 678
 679   }
 680
 681   public void minimizeAssociated_actionPerformed(ActionEvent e)
 682   {
 683
 684   }
 685
 686   public void vamsasImport_actionPerformed(ActionEvent e)
 687   {
 688   }
 689 }