src/jalview/jbgui/GDesktop.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.jbgui;
  22
  23 import jalview.api.AlignmentViewPanel;
  24 import jalview.io.FileFormatException;
  25 import jalview.util.MessageManager;
  26 import jalview.util.Platform;
  27
  28 import java.awt.FlowLayout;
  29 import java.awt.Toolkit;
  30 import java.awt.event.ActionEvent;
  31 import java.awt.event.ActionListener;
  32
  33 import javax.swing.JCheckBoxMenuItem;
  34 import javax.swing.JFrame;
  35 import javax.swing.JMenu;
  36 import javax.swing.JMenuBar;
  37 import javax.swing.JMenuItem;
  38
  39 /**
  40  * DOCUMENT ME!
  41  *
  42  * @author $author$
  43  * @version $Revision$
  44  */
  45 public class GDesktop extends JFrame
  46 {
  47   protected static JMenu windowMenu = new JMenu();
  48
  49   JMenuBar desktopMenubar = new JMenuBar();
  50
  51   JMenu FileMenu = new JMenu();
  52
  53   JMenu HelpMenu = new JMenu();
  54
  55   protected JMenu VamsasMenu = new JMenu();
  56
  57   protected JMenu VamsasStMenu = new JMenu();
  58
  59   JMenuItem inputLocalFileMenuItem = new JMenuItem();
  60
  61   JMenuItem inputURLMenuItem = new JMenuItem();
  62
  63   JMenuItem inputTextboxMenuItem = new JMenuItem();
  64
  65   JMenuItem quit = new JMenuItem();
  66
  67   JMenuItem aboutMenuItem = new JMenuItem();
  68
  69   JMenuItem documentationMenuItem = new JMenuItem();
  70
  71   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();
  72
  73   protected JMenu toolsMenu = new JMenu();
  74
  75   JMenuItem preferences = new JMenuItem();
  76
  77   JMenuItem saveState = new JMenuItem();
  78
  79   JMenuItem saveAsState = new JMenuItem();
  80
  81   JMenuItem loadState = new JMenuItem();
  82
  83   JMenu inputMenu = new JMenu();
  84
  85   protected JMenuItem vamsasStart = new JMenuItem();
  86
  87   protected JMenuItem vamsasImport = new JMenuItem();
  88
  89   protected JMenuItem vamsasSave = new JMenuItem();
  90
  91   JMenuItem inputSequence = new JMenuItem();
  92
  93   protected JMenuItem vamsasStop = new JMenuItem();
  94
  95   JMenuItem closeAll = new JMenuItem();
  96
  97   JMenuItem raiseRelated = new JMenuItem();
  98
  99   JMenuItem minimizeAssociated = new JMenuItem();
 100
 101   protected JCheckBoxMenuItem showMemusage = new JCheckBoxMenuItem();
 102
 103   JMenuItem garbageCollect = new JMenuItem();
 104
 105   protected JMenuItem groovyShell;
 106
 107   protected JCheckBoxMenuItem experimentalFeatures;
 108
 109   protected JCheckBoxMenuItem showConsole = new JCheckBoxMenuItem();
 110
 111   protected JCheckBoxMenuItem showNews = new JCheckBoxMenuItem();
 112
 113   protected JMenuItem snapShotWindow = new JMenuItem();
 114
 115   /**
 116    * Creates a new GDesktop object.
 117    */
 118   public GDesktop()
 119   {
 120     try
 121     {
 122       jbInit();
 123       this.setJMenuBar(desktopMenubar);
 124     } catch (Exception e)
 125     {
 126       e.printStackTrace();
 127     }
 128
 129     if (!Platform.isAMac())
 130     {
 131       FileMenu.setMnemonic('F');
 132       inputLocalFileMenuItem.setMnemonic('L');
 133       VamsasMenu.setMnemonic('V');
 134       inputURLMenuItem.setMnemonic('U');
 135       inputTextboxMenuItem.setMnemonic('C');
 136       quit.setMnemonic('Q');
 137       saveState.setMnemonic('S');
 138       loadState.setMnemonic('L');
 139       inputMenu.setMnemonic('I');
 140     }
 141   }
 142
 143   /**
 144    * DOCUMENT ME!
 145    *
 146    * @throws Exception
 147    *           DOCUMENT ME!
 148    */
 149   private void jbInit() throws Exception
 150   {
 151
 152     FileMenu.setText(MessageManager.getString("action.file"));
 153     HelpMenu.setText(MessageManager.getString("action.help"));
 154     VamsasMenu.setText("Vamsas");
 155     VamsasMenu.setToolTipText(MessageManager
 156             .getString("label.share_data_vamsas_applications"));
 157     VamsasStMenu.setText(MessageManager.getString("label.connect_to"));
 158     VamsasStMenu.setToolTipText(
 159             MessageManager.getString("label.join_existing_vamsas_session"));
 160     inputLocalFileMenuItem
 161             .setText(MessageManager.getString("label.load_tree_from_file"));
 162     inputLocalFileMenuItem.setAccelerator(
 163             javax.swing.KeyStroke.getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_O,
 164                     Toolkit.getDefaultToolkit().getMenuShortcutKeyMaskEx(),
 165                     false));
 166     inputLocalFileMenuItem
 167             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 168             {
 169               @Override
 170               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 171               {
 172                 inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(null);
 173               }
 174             });
 175     inputURLMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.from_url"));
 176     inputURLMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 177     {
 178       @Override
 179       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 180       {
 181         try
 182         {
 183           inputURLMenuItem_actionPerformed(null);
 184         } catch (FileFormatException e1)
 185         {
 186           System.err.println("Error loading from URL: " + e1.getMessage());
 187         }
 188       }
 189     });
 190     inputTextboxMenuItem
 191             .setText(MessageManager.getString("label.from_textbox"));
 192     inputTextboxMenuItem
 193             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 194             {
 195               @Override
 196               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 197               {
 198                 inputTextboxMenuItem_actionPerformed(null);
 199               }
 200             });
 201     quit.setText(MessageManager.getString("action.quit"));
 202     quit.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 203     {
 204       @Override
 205       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 206       {
 207         quit();
 208       }
 209     });
 210     aboutMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.about"));
 211     aboutMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 212     {
 213       @Override
 214       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 215       {
 216         aboutMenuItem_actionPerformed(e);
 217       }
 218     });
 219     documentationMenuItem
 220             .setText(MessageManager.getString("label.documentation"));
 221     documentationMenuItem.setAccelerator(javax.swing.KeyStroke
 222             .getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_F1, 0, false));
 223     documentationMenuItem
 224             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 225             {
 226               @Override
 227               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 228               {
 229                 documentationMenuItem_actionPerformed(e);
 230               }
 231             });
 232     this.getContentPane().setLayout(flowLayout1);
 233     windowMenu.setText(MessageManager.getString("label.window"));
 234     preferences.setText(MessageManager.getString("label.preferences"));
 235     preferences.addActionListener(new ActionListener()
 236     {
 237       @Override
 238       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 239       {
 240         preferences_actionPerformed(e);
 241       }
 242     });
 243     toolsMenu.setText(MessageManager.getString("label.tools"));
 244     saveState.setText(MessageManager.getString("action.save_project"));
 245     saveState.addActionListener(new ActionListener()
 246     {
 247       @Override
 248       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 249       {
 250         saveState_actionPerformed();
 251       }
 252     });
 253     saveAsState.setText(MessageManager.getString("action.save_project_as"));
 254     saveAsState.addActionListener(new ActionListener()
 255     {
 256       @Override
 257       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 258       {
 259         saveAsState_actionPerformed(e);
 260       }
 261     });
 262     loadState.setText(MessageManager.getString("action.load_project"));
 263     loadState.addActionListener(new ActionListener()
 264     {
 265       @Override
 266       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 267       {
 268         loadState_actionPerformed();
 269       }
 270     });
 271     inputMenu.setText(MessageManager.getString("label.input_alignment"));
 272     vamsasStart
 273             .setText(MessageManager.getString("label.new_vamsas_session"));
 274     vamsasStart.setVisible(false);
 275     vamsasStart.addActionListener(new ActionListener()
 276     {
 277       @Override
 278       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 279       {
 280         vamsasStart_actionPerformed(e);
 281       }
 282     });
 283     vamsasImport.setText(
 284             MessageManager.getString("action.load_vamsas_session"));
 285     vamsasImport.setVisible(false);
 286     vamsasImport.addActionListener(new ActionListener()
 287     {
 288       @Override
 289       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 290       {
 291         vamsasImport_actionPerformed(e);
 292       }
 293     });
 294     vamsasSave.setText(
 295             MessageManager.getString("action.save_vamsas_session"));
 296     vamsasSave.setVisible(false);
 297     vamsasSave.addActionListener(new ActionListener()
 298     {
 299       @Override
 300       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 301       {
 302         vamsasSave_actionPerformed(e);
 303       }
 304     });
 305     inputSequence
 306             .setText(MessageManager.getString("action.fetch_sequences"));
 307     inputSequence.addActionListener(new ActionListener()
 308     {
 309       @Override
 310       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 311       {
 312         inputSequence_actionPerformed(e);
 313       }
 314     });
 315     vamsasStop
 316             .setText(MessageManager.getString("label.stop_vamsas_session"));
 317     vamsasStop.setVisible(false);
 318     vamsasStop.addActionListener(new ActionListener()
 319     {
 320       @Override
 321       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 322       {
 323         vamsasStop_actionPerformed(e);
 324       }
 325     });
 326     closeAll.setText(MessageManager.getString("action.close_all"));
 327     closeAll.addActionListener(new ActionListener()
 328     {
 329       @Override
 330       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 331       {
 332         closeAll_actionPerformed(e);
 333       }
 334     });
 335     raiseRelated.setText(
 336             MessageManager.getString("action.raise_associated_windows"));
 337     raiseRelated.addActionListener(new ActionListener()
 338     {
 339       @Override
 340       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 341       {
 342         raiseRelated_actionPerformed(e);
 343       }
 344     });
 345     minimizeAssociated.setText(
 346             MessageManager.getString("action.minimize_associated_windows"));
 347     minimizeAssociated.addActionListener(new ActionListener()
 348     {
 349       @Override
 350       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 351       {
 352         minimizeAssociated_actionPerformed(e);
 353       }
 354     });
 355     garbageCollect
 356             .setText(MessageManager.getString("label.collect_garbage"));
 357     garbageCollect.addActionListener(new ActionListener()
 358     {
 359       @Override
 360       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 361       {
 362         garbageCollect_actionPerformed(e);
 363       }
 364     });
 365     showMemusage
 366             .setText(MessageManager.getString("label.show_memory_usage"));
 367     showMemusage.addActionListener(new ActionListener()
 368     {
 369       @Override
 370       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 371       {
 372         showMemusage_actionPerformed(e);
 373       }
 374     });
 375     showConsole
 376             .setText(MessageManager.getString("label.show_java_console"));
 377     showConsole.addActionListener(new ActionListener()
 378     {
 379       @Override
 380       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 381       {
 382         showConsole_actionPerformed(e);
 383       }
 384     });
 385     showNews.setText(MessageManager.getString("label.show_jalview_news"));
 386     showNews.addActionListener(new ActionListener()
 387     {
 388       @Override
 389       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 390       {
 391         showNews_actionPerformed(e);
 392       }
 393     });
 394     groovyShell = new JMenuItem();
 395     groovyShell.setText(MessageManager.getString("label.groovy_console"));
 396     groovyShell.addActionListener(new ActionListener()
 397     {
 398       @Override
 399       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 400       {
 401         groovyShell_actionPerformed();
 402       }
 403     });
 404     experimentalFeatures = new JCheckBoxMenuItem();
 405     experimentalFeatures
 406             .setText(MessageManager.getString("label.show_experimental"));
 407     experimentalFeatures.setToolTipText(
 408             MessageManager.getString("label.show_experimental_tip"));
 409     experimentalFeatures.addActionListener(new ActionListener()
 410     {
 411       @Override
 412       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 413       {
 414         showExperimental_actionPerformed(experimentalFeatures.isSelected());
 415       }
 416     });
 417
 418     snapShotWindow.setText(MessageManager.getString("label.take_snapshot"));
 419     snapShotWindow.addActionListener(new ActionListener()
 420     {
 421       @Override
 422       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 423       {
 424         snapShotWindow_actionPerformed(e);
 425       }
 426     });
 427
 428     desktopMenubar.add(FileMenu);
 429     desktopMenubar.add(toolsMenu);
 430     VamsasMenu.setVisible(false);
 431     desktopMenubar.add(VamsasMenu);
 432     desktopMenubar.add(HelpMenu);
 433     desktopMenubar.add(windowMenu);
 434     FileMenu.add(inputMenu);
 435     FileMenu.add(inputSequence);
 436     FileMenu.addSeparator();
 437     FileMenu.add(saveState);
 438     FileMenu.add(saveAsState);
 439     FileMenu.add(loadState);
 440     FileMenu.addSeparator();
 441     FileMenu.add(quit);
 442     HelpMenu.add(aboutMenuItem);
 443     HelpMenu.add(documentationMenuItem);
 444     VamsasMenu.add(VamsasStMenu);
 445     VamsasStMenu.setVisible(false);
 446     VamsasMenu.add(vamsasStart);
 447     VamsasMenu.add(vamsasImport);
 448     VamsasMenu.add(vamsasSave);
 449     VamsasMenu.add(vamsasStop);
 450     if (!Platform.isAMac())
 451     {
 452       toolsMenu.add(preferences);
 453     }
 454     toolsMenu.add(showMemusage);
 455     toolsMenu.add(showConsole);
 456     toolsMenu.add(showNews);
 457     toolsMenu.add(garbageCollect);
 458     toolsMenu.add(groovyShell);
 459     toolsMenu.add(experimentalFeatures);
 460     // toolsMenu.add(snapShotWindow);
 461     inputMenu.add(inputLocalFileMenuItem);
 462     inputMenu.add(inputURLMenuItem);
 463     inputMenu.add(inputTextboxMenuItem);
 464     windowMenu.add(closeAll);
 465     windowMenu.add(raiseRelated);
 466     windowMenu.add(minimizeAssociated);
 467     windowMenu.addSeparator();
 468     // inputMenu.add(vamsasLoad);
 469   }
 470
 471   protected void showExperimental_actionPerformed(boolean selected)
 472   {
 473   }
 474
 475   protected void groovyShell_actionPerformed()
 476   {
 477   }
 478
 479   protected void snapShotWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
 480   {
 481     // TODO Auto-generated method stub
 482
 483   }
 484
 485   protected void showConsole_actionPerformed(ActionEvent e)
 486   {
 487     // TODO Auto-generated method stub
 488
 489   }
 490
 491   protected void showNews_actionPerformed(ActionEvent e)
 492   {
 493     // TODO Auto-generated method stub
 494
 495   }
 496
 497   protected void showMemusage_actionPerformed(ActionEvent e)
 498   {
 499     // TODO Auto-generated method stub
 500
 501   }
 502
 503   protected void garbageCollect_actionPerformed(ActionEvent e)
 504   {
 505     // TODO Auto-generated method stub
 506
 507   }
 508
 509   protected void vamsasStMenu_actionPerformed()
 510   {
 511   }
 512
 513   public void vamsasSave_actionPerformed(ActionEvent e)
 514   {
 515   }
 516
 517   /**
 518    * DOCUMENT ME!
 519    *
 520    * @param e
 521    *          DOCUMENT ME!
 522    */
 523   protected void inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(
 524           jalview.gui.AlignViewport av)
 525   {
 526   }
 527
 528   /**
 529    * DOCUMENT ME!
 530    *
 531    * @param e
 532    *          DOCUMENT ME!
 533    * @throws FileFormatException
 534    */
 535   protected void inputURLMenuItem_actionPerformed(
 536           jalview.gui.AlignViewport av) throws FileFormatException
 537   {
 538   }
 539
 540   /**
 541    * DOCUMENT ME!
 542    *
 543    * @param e
 544    *          DOCUMENT ME!
 545    */
 546   protected void inputTextboxMenuItem_actionPerformed(
 547           AlignmentViewPanel avp)
 548   {
 549   }
 550
 551   /**
 552    * DOCUMENT ME!
 553    */
 554   protected void quit()
 555   {
 556     //System.out.println("********** GDesktop.quit()");
 557   }
 558
 559   /**
 560    * DOCUMENT ME!
 561    *
 562    * @param e
 563    *          DOCUMENT ME!
 564    */
 565   protected void aboutMenuItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 566   {
 567   }
 568
 569   /**
 570    * DOCUMENT ME!
 571    *
 572    * @param e
 573    *          DOCUMENT ME!
 574    */
 575   protected void documentationMenuItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 576   {
 577   }
 578
 579   /**
 580    * DOCUMENT ME!
 581    *
 582    * @param e
 583    *          DOCUMENT ME!
 584    */
 585   protected void preferences_actionPerformed(ActionEvent e)
 586   {
 587   }
 588
 589   /**
 590    * DOCUMENT ME!
 591    *
 592    * @param e
 593    *          DOCUMENT ME!
 594    */
 595   public void saveState_actionPerformed()
 596   {
 597   }
 598
 599   public void saveAsState_actionPerformed(ActionEvent e)
 600   {
 601   }
 602
 603   /**
 604    * DOCUMENT ME!
 605    *
 606    * @param e
 607    *          DOCUMENT ME!
 608    */
 609   public void loadState_actionPerformed()
 610   {
 611   }
 612
 613   /**
 614    * DOCUMENT ME!
 615    *
 616    * @param e
 617    *          DOCUMENT ME!
 618    */
 619   public void loadJalviewAlign_actionPerformed(ActionEvent e)
 620   {
 621   }
 622
 623   public void vamsasStart_actionPerformed(ActionEvent e)
 624   {
 625
 626   }
 627
 628   public void inputSequence_actionPerformed(ActionEvent e)
 629   {
 630
 631   }
 632
 633   public void vamsasStop_actionPerformed(ActionEvent e)
 634   {
 635
 636   }
 637
 638   public void closeAll_actionPerformed(ActionEvent e)
 639   {
 640
 641   }
 642
 643   public void raiseRelated_actionPerformed(ActionEvent e)
 644   {
 645
 646   }
 647
 648   public void minimizeAssociated_actionPerformed(ActionEvent e)
 649   {
 650
 651   }
 652
 653   public void vamsasImport_actionPerformed(ActionEvent e)
 654   {
 655   }
 656 }