src/jalview/jbgui/GDesktop.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.jbgui;
  22
  23 import jalview.api.AlignmentViewPanel;
  24 import jalview.bin.Jalview;
  25 import jalview.io.FileFormatException;
  26 import jalview.util.MessageManager;
  27 import jalview.util.Platform;
  28
  29 import java.awt.FlowLayout;
  30 import java.awt.Toolkit;
  31 import java.awt.event.ActionEvent;
  32 import java.awt.event.ActionListener;
  33
  34 import javax.swing.JCheckBoxMenuItem;
  35 import javax.swing.JFrame;
  36 import javax.swing.JMenu;
  37 import javax.swing.JMenuBar;
  38 import javax.swing.JMenuItem;
  39
  40 /**
  41  * DOCUMENT ME!
  42  *
  43  * @author $author$
  44  * @version $Revision$
  45  */
  46 public class GDesktop extends JFrame
  47 {
  48
  49   public static javax.swing.JTabbedPane createTabbedPane()
  50   {
  51     // now just always return JTabbedPane
  52    return new javax.swing.JTabbedPane();
  53 //    // BH 2018 coercing jalview.jbgui.swing.JTabbedPane() for now
  54 //    if (/** @j2sNative false && */
  55 //    true)
  56 //    {
  57 //      // Java
  58 //      return new javax.swing.JTabbedPane();
  59 //    }
  60 //    // JavaScript
  61 //    return (javax.swing.JTabbedPane) (Object) new jalview.jbgui.swing.JTabbedPane();
  62   }
  63
  64
  65   protected static JMenu windowMenu = new JMenu();
  66
  67   JMenuBar desktopMenubar = new JMenuBar();
  68
  69   JMenu FileMenu = new JMenu();
  70
  71   JMenu HelpMenu = new JMenu();
  72
  73   protected JMenu VamsasMenu = new JMenu();
  74
  75   protected JMenu VamsasStMenu = new JMenu();
  76
  77   JMenuItem inputLocalFileMenuItem = new JMenuItem();
  78
  79   JMenuItem inputURLMenuItem = new JMenuItem();
  80
  81   JMenuItem inputTextboxMenuItem = new JMenuItem();
  82
  83   JMenuItem quit = new JMenuItem();
  84
  85   JMenuItem aboutMenuItem = new JMenuItem();
  86
  87   JMenuItem documentationMenuItem = new JMenuItem();
  88
  89   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();
  90
  91   protected JMenu toolsMenu = new JMenu();
  92
  93   JMenuItem preferences = new JMenuItem();
  94
  95   JMenuItem saveState = new JMenuItem();
  96
  97   JMenuItem loadState = new JMenuItem();
  98
  99   JMenu inputMenu = new JMenu();
 100
 101   protected JMenuItem vamsasStart = new JMenuItem();
 102
 103   protected JMenuItem vamsasImport = new JMenuItem();
 104
 105   protected JMenuItem vamsasSave = new JMenuItem();
 106
 107   JMenuItem inputSequence = new JMenuItem();
 108
 109   protected JMenuItem vamsasStop = new JMenuItem();
 110
 111   JMenuItem closeAll = new JMenuItem();
 112
 113   JMenuItem raiseRelated = new JMenuItem();
 114
 115   JMenuItem minimizeAssociated = new JMenuItem();
 116
 117   protected JCheckBoxMenuItem showMemusage = new JCheckBoxMenuItem();
 118
 119   JMenuItem garbageCollect = new JMenuItem();
 120
 121   protected JMenuItem groovyShell;
 122
 123   protected JCheckBoxMenuItem experimentalFeatures;
 124
 125   protected JCheckBoxMenuItem showConsole = new JCheckBoxMenuItem();
 126
 127   protected JCheckBoxMenuItem showNews = new JCheckBoxMenuItem();
 128
 129   protected JMenuItem snapShotWindow = new JMenuItem();
 130
 131   /**
 132    * Creates a new GDesktop object.
 133    */
 134   public GDesktop()
 135   {
 136     super();
 137     try
 138     {
 139       jbInit();
 140       this.setJMenuBar(desktopMenubar);
 141     } catch (Exception e)
 142     {
 143       e.printStackTrace();
 144     }
 145
 146     if (!Platform.isAMacAndNotJS())
 147     {
 148       FileMenu.setMnemonic('F');
 149       inputLocalFileMenuItem.setMnemonic('L');
 150       VamsasMenu.setMnemonic('V');
 151       inputURLMenuItem.setMnemonic('U');
 152       inputTextboxMenuItem.setMnemonic('C');
 153       quit.setMnemonic('Q');
 154       saveState.setMnemonic('S');
 155       loadState.setMnemonic('L');
 156       inputMenu.setMnemonic('I');
 157     }
 158   }
 159
 160   /**
 161    * DOCUMENT ME!
 162    *
 163    * @throws Exception
 164    *           DOCUMENT ME!
 165    */
 166   private void jbInit() throws Exception
 167   {
 168
 169     FileMenu.setText(MessageManager.getString("action.file"));
 170     HelpMenu.setText(MessageManager.getString("action.help"));
 171     VamsasMenu.setText("Vamsas");
 172     VamsasMenu.setToolTipText(MessageManager
 173             .getString("label.share_data_vamsas_applications"));
 174     VamsasStMenu.setText(MessageManager.getString("label.connect_to"));
 175     VamsasStMenu.setToolTipText(
 176             MessageManager.getString("label.join_existing_vamsas_session"));
 177     inputLocalFileMenuItem
 178             .setText(MessageManager.getString("label.load_tree_from_file"));
 179     inputLocalFileMenuItem.setAccelerator(
 180             javax.swing.KeyStroke.getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_O,
 181                     Toolkit.getDefaultToolkit().getMenuShortcutKeyMask(),
 182                     false));
 183     inputLocalFileMenuItem
 184             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 185             {
 186               @Override
 187               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 188               {
 189                 inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(null);
 190               }
 191             });
 192     inputURLMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.from_url"));
 193     inputURLMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 194     {
 195       @Override
 196       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 197       {
 198         try
 199         {
 200           inputURLMenuItem_actionPerformed(null);
 201         } catch (FileFormatException e1)
 202         {
 203           System.err.println("Error loading from URL: " + e1.getMessage());
 204         }
 205       }
 206     });
 207     inputTextboxMenuItem
 208             .setText(MessageManager.getString("label.from_textbox"));
 209     inputTextboxMenuItem
 210             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 211             {
 212               @Override
 213               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 214               {
 215                 inputTextboxMenuItem_actionPerformed(null);
 216               }
 217             });
 218     quit.setText(MessageManager.getString("action.quit"));
 219     quit.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 220     {
 221       @Override
 222       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 223       {
 224         quit();
 225       }
 226     });
 227     aboutMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.about"));
 228     aboutMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 229     {
 230       @Override
 231       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 232       {
 233         aboutMenuItem_actionPerformed(e);
 234       }
 235     });
 236     documentationMenuItem
 237             .setText(MessageManager.getString("label.documentation"));
 238     documentationMenuItem.setAccelerator(javax.swing.KeyStroke
 239             .getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_F1, 0, false));
 240     documentationMenuItem
 241             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 242             {
 243               @Override
 244               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 245               {
 246                 documentationMenuItem_actionPerformed();
 247               }
 248             });
 249     this.getContentPane().setLayout(flowLayout1);
 250     windowMenu.setText(MessageManager.getString("label.window"));
 251     preferences.setText(MessageManager.getString("label.preferences"));
 252     preferences.addActionListener(new ActionListener()
 253     {
 254       @Override
 255       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 256       {
 257         preferences_actionPerformed(e);
 258       }
 259     });
 260     toolsMenu.setText(MessageManager.getString("label.tools"));
 261     saveState.setText(MessageManager.getString("action.save_project"));
 262     saveState.addActionListener(new ActionListener()
 263     {
 264       @Override
 265       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 266       {
 267         saveState_actionPerformed(true);
 268       }
 269     });
 270     JMenuItem saveAsJaxb = new JMenuItem("Save Project as JAXB");
 271     saveAsJaxb.addActionListener(new ActionListener()
 272     {
 273       @Override
 274       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 275       {
 276         saveState_actionPerformed(false);
 277       }
 278     });
 279     loadState.setText(MessageManager.getString("action.load_project"));
 280     loadState.addActionListener(new ActionListener()
 281     {
 282       @Override
 283       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 284       {
 285         loadState_actionPerformed(true);
 286       }
 287     });
 288     JMenuItem loadAsJaxb = new JMenuItem("Load Project as JAXB");
 289     loadAsJaxb.addActionListener(new ActionListener()
 290     {
 291       @Override
 292       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 293       {
 294         loadState_actionPerformed(false);
 295       }
 296     });
 297     inputMenu.setText(MessageManager.getString("label.input_alignment"));
 298     vamsasStart
 299             .setText(MessageManager.getString("label.new_vamsas_session"));
 300     vamsasStart.setVisible(false);
 301     vamsasStart.addActionListener(new ActionListener()
 302     {
 303       @Override
 304       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 305       {
 306         vamsasStart_actionPerformed(e);
 307       }
 308     });
 309     vamsasImport.setText(
 310             MessageManager.getString("action.load_vamsas_session"));
 311     vamsasImport.setVisible(false);
 312     vamsasImport.addActionListener(new ActionListener()
 313     {
 314       @Override
 315       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 316       {
 317         vamsasImport_actionPerformed(e);
 318       }
 319     });
 320     vamsasSave.setText(
 321             MessageManager.getString("action.save_vamsas_session"));
 322     vamsasSave.setVisible(false);
 323     vamsasSave.addActionListener(new ActionListener()
 324     {
 325       @Override
 326       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 327       {
 328         vamsasSave_actionPerformed(e);
 329       }
 330     });
 331     inputSequence
 332             .setText(MessageManager.getString("action.fetch_sequences"));
 333     inputSequence.addActionListener(new ActionListener()
 334     {
 335       @Override
 336       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 337       {
 338         inputSequence_actionPerformed(e);
 339       }
 340     });
 341     vamsasStop
 342             .setText(MessageManager.getString("label.stop_vamsas_session"));
 343     vamsasStop.setVisible(false);
 344     vamsasStop.addActionListener(new ActionListener()
 345     {
 346       @Override
 347       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 348       {
 349         vamsasStop_actionPerformed(e);
 350       }
 351     });
 352     closeAll.setText(MessageManager.getString("action.close_all"));
 353     closeAll.addActionListener(new ActionListener()
 354     {
 355       @Override
 356       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 357       {
 358         closeAll_actionPerformed(e);
 359       }
 360     });
 361     raiseRelated.setText(
 362             MessageManager.getString("action.raise_associated_windows"));
 363     raiseRelated.addActionListener(new ActionListener()
 364     {
 365       @Override
 366       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 367       {
 368         raiseRelated_actionPerformed(e);
 369       }
 370     });
 371     minimizeAssociated.setText(
 372             MessageManager.getString("action.minimize_associated_windows"));
 373     minimizeAssociated.addActionListener(new ActionListener()
 374     {
 375       @Override
 376       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 377       {
 378         minimizeAssociated_actionPerformed(e);
 379       }
 380     });
 381     garbageCollect
 382             .setText(MessageManager.getString("label.collect_garbage"));
 383     garbageCollect.addActionListener(new ActionListener()
 384     {
 385       @Override
 386       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 387       {
 388         garbageCollect_actionPerformed(e);
 389       }
 390     });
 391     showMemusage
 392             .setText(MessageManager.getString("label.show_memory_usage"));
 393     showMemusage.addActionListener(new ActionListener()
 394     {
 395       @Override
 396       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 397       {
 398         showMemusage_actionPerformed(e);
 399       }
 400     });
 401     showConsole
 402             .setText(MessageManager.getString("label.show_java_console"));
 403     showConsole.addActionListener(new ActionListener()
 404     {
 405       @Override
 406       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 407       {
 408         showConsole_actionPerformed(e);
 409       }
 410     });
 411     showNews.setText(MessageManager.getString("label.show_jalview_news"));
 412     showNews.addActionListener(new ActionListener()
 413     {
 414       @Override
 415       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 416       {
 417         showNews_actionPerformed(e);
 418       }
 419     });
 420     groovyShell = new JMenuItem();
 421     groovyShell.setText(MessageManager.getString("label.groovy_console"));
 422     groovyShell.addActionListener(new ActionListener()
 423     {
 424       @Override
 425       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 426       {
 427         groovyShell_actionPerformed();
 428       }
 429     });
 430     experimentalFeatures = new JCheckBoxMenuItem();
 431     experimentalFeatures
 432             .setText(MessageManager.getString("label.show_experimental"));
 433     experimentalFeatures.setToolTipText(
 434             MessageManager.getString("label.show_experimental_tip"));
 435     experimentalFeatures.addActionListener(new ActionListener()
 436     {
 437       @Override
 438       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 439       {
 440         showExperimental_actionPerformed(experimentalFeatures.isSelected());
 441       }
 442     });
 443
 444     snapShotWindow.setText(MessageManager.getString("label.take_snapshot"));
 445     snapShotWindow.addActionListener(new ActionListener()
 446     {
 447       @Override
 448       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 449       {
 450         snapShotWindow_actionPerformed(e);
 451       }
 452     });
 453
 454     desktopMenubar.add(FileMenu);
 455     desktopMenubar.add(toolsMenu);
 456     VamsasMenu.setVisible(false);
 457     desktopMenubar.add(VamsasMenu);
 458     desktopMenubar.add(HelpMenu);
 459     desktopMenubar.add(windowMenu);
 460     FileMenu.add(inputMenu);
 461     FileMenu.add(inputSequence);
 462     FileMenu.addSeparator();
 463     FileMenu.add(saveAsJaxb);
 464     FileMenu.add(loadAsJaxb);
 465     if (!Jalview.isJS())
 466     {
 467       FileMenu.add(saveState);
 468       FileMenu.add(loadState);
 469     }
 470     FileMenu.addSeparator();
 471     FileMenu.add(quit);
 472     HelpMenu.add(aboutMenuItem);
 473     HelpMenu.add(documentationMenuItem);
 474     VamsasMenu.add(VamsasStMenu);
 475     VamsasStMenu.setVisible(false);
 476     VamsasMenu.add(vamsasStart);
 477     VamsasMenu.add(vamsasImport);
 478     VamsasMenu.add(vamsasSave);
 479     VamsasMenu.add(vamsasStop);
 480     toolsMenu.add(preferences);
 481     if (!Jalview.isJS())
 482     {
 483       toolsMenu.add(showMemusage);
 484       toolsMenu.add(showConsole);
 485     }
 486     if (!Jalview.isJS())
 487     {
 488       toolsMenu.add(showNews);
 489       toolsMenu.add(garbageCollect);
 490       toolsMenu.add(groovyShell);
 491     }
 492     toolsMenu.add(experimentalFeatures);
 493     // toolsMenu.add(snapShotWindow);
 494     inputMenu.add(inputLocalFileMenuItem);
 495     inputMenu.add(inputURLMenuItem);
 496     inputMenu.add(inputTextboxMenuItem);
 497     windowMenu.add(closeAll);
 498     windowMenu.add(raiseRelated);
 499     windowMenu.add(minimizeAssociated);
 500     windowMenu.addSeparator();
 501     // inputMenu.add(vamsasLoad);
 502   }
 503
 504   protected void showExperimental_actionPerformed(boolean selected)
 505   {
 506   }
 507
 508   protected void groovyShell_actionPerformed()
 509   {
 510   }
 511
 512   protected void snapShotWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
 513   {
 514     // TODO Auto-generated method stub
 515
 516   }
 517
 518   protected void showConsole_actionPerformed(ActionEvent e)
 519   {
 520     // TODO Auto-generated method stub
 521
 522   }
 523
 524   protected void showNews_actionPerformed(ActionEvent e)
 525   {
 526     // TODO Auto-generated method stub
 527
 528   }
 529
 530   protected void showMemusage_actionPerformed(ActionEvent e)
 531   {
 532     // TODO Auto-generated method stub
 533
 534   }
 535
 536   protected void garbageCollect_actionPerformed(ActionEvent e)
 537   {
 538     // TODO Auto-generated method stub
 539
 540   }
 541
 542   protected void vamsasStMenu_actionPerformed()
 543   {
 544   }
 545
 546   public void vamsasSave_actionPerformed(ActionEvent e)
 547   {
 548   }
 549
 550   /**
 551    * DOCUMENT ME!
 552    *
 553    * @param e
 554    *          DOCUMENT ME!
 555    */
 556   protected void inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(
 557           jalview.gui.AlignViewport av)
 558   {
 559   }
 560
 561   /**
 562    * DOCUMENT ME!
 563    *
 564    * @param e
 565    *          DOCUMENT ME!
 566    * @throws FileFormatException
 567    */
 568   protected void inputURLMenuItem_actionPerformed(
 569           jalview.gui.AlignViewport av) throws FileFormatException
 570   {
 571   }
 572
 573   /**
 574    * DOCUMENT ME!
 575    *
 576    * @param e
 577    *          DOCUMENT ME!
 578    */
 579   protected void inputTextboxMenuItem_actionPerformed(
 580           AlignmentViewPanel avp)
 581   {
 582   }
 583
 584   /**
 585    * DOCUMENT ME!
 586    */
 587   protected void quit()
 588   {
 589   }
 590
 591   /**
 592    * DOCUMENT ME!
 593    *
 594    * @param e
 595    *          DOCUMENT ME!
 596    */
 597   protected void aboutMenuItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 598   {
 599   }
 600
 601   protected void documentationMenuItem_actionPerformed()
 602   {
 603   }
 604
 605   /**
 606    * DOCUMENT ME!
 607    *
 608    * @param e
 609    *          DOCUMENT ME!
 610    */
 611   public void SaveState_actionPerformed(ActionEvent e)
 612   {
 613   }
 614
 615   /**
 616    * DOCUMENT ME!
 617    *
 618    * @param e
 619    *          DOCUMENT ME!
 620    */
 621   protected void preferences_actionPerformed(ActionEvent e)
 622   {
 623   }
 624
 625   /**
 626    * DOCUMENT ME!
 627    *
 628    * @param e
 629    *          DOCUMENT ME!
 630    */
 631   public void saveState_actionPerformed(boolean asCastor)
 632   {
 633   }
 634
 635   /**
 636    * DOCUMENT ME!
 637    *
 638    * @param e
 639    *          DOCUMENT ME!
 640    */
 641   public void loadState_actionPerformed(boolean asCastor)
 642   {
 643   }
 644
 645   /**
 646    * DOCUMENT ME!
 647    *
 648    * @param e
 649    *          DOCUMENT ME!
 650    */
 651   public void loadJalviewAlign_actionPerformed(ActionEvent e)
 652   {
 653   }
 654
 655   public void vamsasStart_actionPerformed(ActionEvent e)
 656   {
 657
 658   }
 659
 660   public void inputSequence_actionPerformed(ActionEvent e)
 661   {
 662
 663   }
 664
 665   public void vamsasStop_actionPerformed(ActionEvent e)
 666   {
 667
 668   }
 669
 670   public void closeAll_actionPerformed(ActionEvent e)
 671   {
 672
 673   }
 674
 675   public void raiseRelated_actionPerformed(ActionEvent e)
 676   {
 677
 678   }
 679
 680   public void minimizeAssociated_actionPerformed(ActionEvent e)
 681   {
 682
 683   }
 684
 685   public void vamsasImport_actionPerformed(ActionEvent e)
 686   {
 687   }
 688 }