src/jalview/jbgui/GPCAPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.jbgui;
  22
  23 import jalview.util.ImageMaker.TYPE;
  24 import jalview.util.MessageManager;
  25
  26 import java.awt.BorderLayout;
  27 import java.awt.Color;
  28 import java.awt.FlowLayout;
  29 import java.awt.Font;
  30 import java.awt.GridLayout;
  31 import java.awt.event.ActionEvent;
  32 import java.awt.event.ActionListener;
  33
  34 import javax.swing.JButton;
  35 import javax.swing.JCheckBoxMenuItem;
  36 import javax.swing.JComboBox;
  37 import javax.swing.JInternalFrame;
  38 import javax.swing.JLabel;
  39 import javax.swing.JMenu;
  40 import javax.swing.JMenuBar;
  41 import javax.swing.JMenuItem;
  42 import javax.swing.JPanel;
  43 import javax.swing.event.MenuEvent;
  44 import javax.swing.event.MenuListener;
  45
  46 public class GPCAPanel extends JInternalFrame
  47 {
  48   private static final Font VERDANA_12 = new Font("Verdana", 0, 12);
  49
  50   protected JComboBox<String> xCombobox = new JComboBox<>();
  51
  52   protected JComboBox<String> yCombobox = new JComboBox<>();
  53
  54   protected JComboBox<String> zCombobox = new JComboBox<>();
  55
  56   protected JMenu viewMenu = new JMenu();
  57
  58   protected JCheckBoxMenuItem showLabels = new JCheckBoxMenuItem();
  59
  60   protected JMenu associateViewsMenu = new JMenu();
  61
  62   protected JLabel statusBar = new JLabel();
  63
  64   protected JPanel statusPanel = new JPanel();
  65
  66   protected JMenuItem originalSeqData;
  67
  68   /**
  69    * Constructor
  70    */
  71   public GPCAPanel()
  72   {
  73     try
  74     {
  75       jbInit();
  76     } catch (Exception e)
  77     {
  78       e.printStackTrace();
  79     }
  80
  81     for (int i = 1; i < 8; i++)
  82     {
  83       xCombobox.addItem("dim " + i);
  84       yCombobox.addItem("dim " + i);
  85       zCombobox.addItem("dim " + i);
  86     }
  87   }
  88
  89   private void jbInit() throws Exception
  90   {
  91     setName("jalview-pca");
  92     this.getContentPane().setLayout(new BorderLayout());
  93     JPanel jPanel2 = new JPanel();
  94     jPanel2.setLayout(new FlowLayout());
  95     JLabel jLabel1 = new JLabel();
  96     jLabel1.setFont(VERDANA_12);
  97     jLabel1.setText("x=");
  98     JLabel jLabel2 = new JLabel();
  99     jLabel2.setFont(VERDANA_12);
 100     jLabel2.setText("y=");
 101     JLabel jLabel3 = new JLabel();
 102     jLabel3.setFont(VERDANA_12);
 103     jLabel3.setText("z=");
 104     jPanel2.setBackground(Color.white);
 105     jPanel2.setBorder(null);
 106     zCombobox.setFont(VERDANA_12);
 107     zCombobox.addActionListener(new ActionListener()
 108     {
 109       @Override
 110       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 111       {
 112         doDimensionChange();
 113       }
 114     });
 115     yCombobox.setFont(VERDANA_12);
 116     yCombobox.addActionListener(new ActionListener()
 117     {
 118       @Override
 119       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 120       {
 121         doDimensionChange();
 122       }
 123     });
 124     xCombobox.setFont(VERDANA_12);
 125     xCombobox.addActionListener(new ActionListener()
 126     {
 127       @Override
 128       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 129       {
 130         doDimensionChange();
 131       }
 132     });
 133     JButton resetButton = new JButton();
 134     resetButton.setFont(VERDANA_12);
 135     resetButton.setText(MessageManager.getString("action.reset"));
 136     resetButton.addActionListener(new ActionListener()
 137     {
 138       @Override
 139       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 140       {
 141         resetButton_actionPerformed();
 142       }
 143     });
 144     JMenu fileMenu = new JMenu();
 145     fileMenu.setText(MessageManager.getString("action.file"));
 146     JMenu saveMenu = new JMenu();
 147     saveMenu.setText(MessageManager.getString("action.save_as"));
 148     JMenuItem eps = new JMenuItem("EPS");
 149     eps.addActionListener(new ActionListener()
 150     {
 151       @Override
 152       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 153       {
 154         makePCAImage(TYPE.EPS);
 155       }
 156     });
 157     JMenuItem png = new JMenuItem("PNG");
 158     png.addActionListener(new ActionListener()
 159     {
 160       @Override
 161       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 162       {
 163         makePCAImage(TYPE.PNG);
 164       }
 165     });
 166     JMenuItem outputValues = new JMenuItem();
 167     outputValues.setText(MessageManager.getString("label.output_values"));
 168     outputValues.addActionListener(new ActionListener()
 169     {
 170       @Override
 171       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 172       {
 173         outputValues_actionPerformed();
 174       }
 175     });
 176     JMenuItem outputPoints = new JMenuItem();
 177     outputPoints.setText(MessageManager.getString("label.output_points"));
 178     outputPoints.addActionListener(new ActionListener()
 179     {
 180       @Override
 181       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 182       {
 183         outputPoints_actionPerformed();
 184       }
 185     });
 186     JMenuItem outputProjPoints = new JMenuItem();
 187     outputProjPoints.setText(
 188             MessageManager.getString("label.output_transformed_points"));
 189     outputProjPoints.addActionListener(new ActionListener()
 190     {
 191       @Override
 192       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 193       {
 194         outputProjPoints_actionPerformed();
 195       }
 196     });
 197     JMenuItem print = new JMenuItem();
 198     print.setText(MessageManager.getString("action.print"));
 199     print.addActionListener(new ActionListener()
 200     {
 201       @Override
 202       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 203       {
 204         print_actionPerformed();
 205       }
 206     });
 207     viewMenu.setText(MessageManager.getString("action.view"));
 208     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()
 209     {
 210       @Override
 211       public void menuSelected(MenuEvent e)
 212       {
 213         viewMenu_menuSelected();
 214       }
 215
 216       @Override
 217       public void menuDeselected(MenuEvent e)
 218       {
 219       }
 220
 221       @Override
 222       public void menuCanceled(MenuEvent e)
 223       {
 224       }
 225     });
 226     showLabels.setText(MessageManager.getString("label.show_labels"));
 227     showLabels.addActionListener(new ActionListener()
 228     {
 229       @Override
 230       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 231       {
 232         showLabels_actionPerformed();
 233       }
 234     });
 235     JMenuItem bgcolour = new JMenuItem();
 236     bgcolour.setText(MessageManager.getString("action.background_colour"));
 237     bgcolour.addActionListener(new ActionListener()
 238     {
 239       @Override
 240       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 241       {
 242         bgcolour_actionPerformed();
 243       }
 244     });
 245     originalSeqData = new JMenuItem();
 246     originalSeqData.setText(MessageManager.getString("label.input_data"));
 247     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()
 248     {
 249       @Override
 250       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 251       {
 252         originalSeqData_actionPerformed();
 253       }
 254     });
 255     associateViewsMenu.setText(
 256             MessageManager.getString("label.associate_nodes_with"));
 257
 258     statusPanel.setLayout(new GridLayout());
 259     statusBar.setFont(VERDANA_12);
 260     // statusPanel.setBackground(Color.lightGray);
 261     // statusBar.setBackground(Color.lightGray);
 262     // statusPanel.add(statusBar, null);
 263     JPanel panelBar = new JPanel(new BorderLayout());
 264     panelBar.add(jPanel2, BorderLayout.NORTH);
 265     panelBar.add(statusPanel, BorderLayout.SOUTH);
 266     this.getContentPane().add(panelBar, BorderLayout.SOUTH);
 267     jPanel2.add(jLabel1, null);
 268     jPanel2.add(xCombobox, null);
 269     jPanel2.add(jLabel2, null);
 270     jPanel2.add(yCombobox, null);
 271     jPanel2.add(jLabel3, null);
 272     jPanel2.add(zCombobox, null);
 273     jPanel2.add(resetButton, null);
 274
 275     JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();
 276     jMenuBar1.add(fileMenu);
 277     jMenuBar1.add(viewMenu);
 278     setJMenuBar(jMenuBar1);
 279     fileMenu.add(saveMenu);
 280     fileMenu.add(outputValues);
 281     fileMenu.add(print);
 282     fileMenu.add(originalSeqData);
 283     fileMenu.add(outputPoints);
 284     fileMenu.add(outputProjPoints);
 285     saveMenu.add(eps);
 286     saveMenu.add(png);
 287     viewMenu.add(showLabels);
 288     viewMenu.add(bgcolour);
 289     viewMenu.add(associateViewsMenu);
 290   }
 291
 292   protected void resetButton_actionPerformed()
 293   {
 294   }
 295
 296   protected void outputPoints_actionPerformed()
 297   {
 298   }
 299
 300   protected void outputProjPoints_actionPerformed()
 301   {
 302   }
 303
 304   public void makePCAImage(TYPE imageType)
 305   {
 306   }
 307
 308   protected void outputValues_actionPerformed()
 309   {
 310   }
 311
 312   protected void print_actionPerformed()
 313   {
 314   }
 315
 316   protected void showLabels_actionPerformed()
 317   {
 318   }
 319
 320   protected void bgcolour_actionPerformed()
 321   {
 322   }
 323
 324   protected void originalSeqData_actionPerformed()
 325   {
 326   }
 327
 328   protected void viewMenu_menuSelected()
 329   {
 330   }
 331
 332   protected void doDimensionChange()
 333   {
 334   }
 335 }