src/jalview/jbgui/GPCAPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package jalview.jbgui;
  20
  21 import java.awt.*;
  22 import java.awt.event.*;
  23
  24 import javax.swing.*;
  25 import javax.swing.event.*;
  26
  27 public class GPCAPanel extends JInternalFrame
  28 {
  29   JPanel jPanel2 = new JPanel();
  30
  31   JLabel jLabel1 = new JLabel();
  32
  33   JLabel jLabel2 = new JLabel();
  34
  35   JLabel jLabel3 = new JLabel();
  36
  37   protected JComboBox xCombobox = new JComboBox();
  38
  39   protected JComboBox yCombobox = new JComboBox();
  40
  41   protected JComboBox zCombobox = new JComboBox();
  42
  43   protected JButton resetButton = new JButton();
  44
  45   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();
  46
  47   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();
  48
  49   JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();
  50
  51   JMenu fileMenu = new JMenu();
  52
  53   JMenu saveMenu = new JMenu();
  54
  55   JMenuItem eps = new JMenuItem();
  56
  57   JMenuItem png = new JMenuItem();
  58
  59   JMenuItem print = new JMenuItem();
  60
  61   JMenuItem outputValues = new JMenuItem();
  62
  63   JMenuItem outputPoints = new JMenuItem();
  64
  65   JMenuItem outputProjPoints = new JMenuItem();
  66
  67   protected JMenu viewMenu = new JMenu();
  68
  69   protected JCheckBoxMenuItem showLabels = new JCheckBoxMenuItem();
  70
  71   JMenuItem bgcolour = new JMenuItem();
  72
  73   JMenuItem originalSeqData = new JMenuItem();
  74
  75   protected JMenu associateViewsMenu = new JMenu();
  76
  77   protected JMenu calcSettings = new JMenu();
  78
  79   protected JCheckBoxMenuItem nuclSetting = new JCheckBoxMenuItem();
  80
  81   protected JCheckBoxMenuItem protSetting = new JCheckBoxMenuItem();
  82
  83   protected JCheckBoxMenuItem jvVersionSetting = new JCheckBoxMenuItem();
  84
  85   protected JLabel statusBar = new JLabel();
  86
  87   protected GridLayout statusPanelLayout = new GridLayout();
  88
  89   protected JPanel statusPanel = new JPanel();
  90
  91   public GPCAPanel()
  92   {
  93     try
  94     {
  95       jbInit();
  96     } catch (Exception e)
  97     {
  98       e.printStackTrace();
  99     }
 100
 101     for (int i = 1; i < 8; i++)
 102     {
 103       xCombobox.addItem("dim " + i);
 104       yCombobox.addItem("dim " + i);
 105       zCombobox.addItem("dim " + i);
 106     }
 107
 108     setJMenuBar(jMenuBar1);
 109   }
 110
 111   private void jbInit() throws Exception
 112   {
 113     this.getContentPane().setLayout(borderLayout1);
 114     jPanel2.setLayout(flowLayout1);
 115     jLabel1.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 116     jLabel1.setText("x=");
 117     jLabel2.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 118     jLabel2.setText("y=");
 119     jLabel3.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 120     jLabel3.setText("z=");
 121     jPanel2.setBackground(Color.white);
 122     jPanel2.setBorder(null);
 123     zCombobox.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 124     zCombobox.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 125     {
 126       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 127       {
 128         zCombobox_actionPerformed(e);
 129       }
 130     });
 131     yCombobox.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 132     yCombobox.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 133     {
 134       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 135       {
 136         yCombobox_actionPerformed(e);
 137       }
 138     });
 139     xCombobox.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 140     xCombobox.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 141     {
 142       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 143       {
 144         xCombobox_actionPerformed(e);
 145       }
 146     });
 147     resetButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 148     resetButton.setText("Reset");
 149     resetButton.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 150     {
 151       @Override
 152       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 153       {
 154         resetButton_actionPerformed(e);
 155       }
 156     });
 157     fileMenu.setText("File");
 158     saveMenu.setText("Save as");
 159     eps.setText("EPS");
 160     eps.addActionListener(new ActionListener()
 161     {
 162       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 163       {
 164         eps_actionPerformed(e);
 165       }
 166     });
 167     png.setText("PNG");
 168     png.addActionListener(new ActionListener()
 169     {
 170       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 171       {
 172         png_actionPerformed(e);
 173       }
 174     });
 175     outputValues.setText("Output Values...");
 176     outputValues.addActionListener(new ActionListener()
 177     {
 178       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 179       {
 180         outputValues_actionPerformed(e);
 181       }
 182     });
 183     outputPoints.setText("Output points...");
 184     outputPoints.addActionListener(new ActionListener()
 185     {
 186       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 187       {
 188         outputPoints_actionPerformed(e);
 189       }
 190     });
 191     outputProjPoints.setText("Output transformed points...");
 192     outputProjPoints.addActionListener(new ActionListener()
 193     {
 194       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 195       {
 196         outputProjPoints_actionPerformed(e);
 197       }
 198     });
 199     print.addActionListener(new ActionListener()
 200     {
 201       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 202       {
 203         print_actionPerformed(e);
 204       }
 205     });
 206     viewMenu.setText("View");
 207     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()
 208     {
 209       public void menuSelected(MenuEvent e)
 210       {
 211         viewMenu_menuSelected();
 212       }
 213
 214       public void menuDeselected(MenuEvent e)
 215       {
 216       }
 217
 218       public void menuCanceled(MenuEvent e)
 219       {
 220       }
 221     });
 222     showLabels.setText("Show Labels");
 223     showLabels.addActionListener(new ActionListener()
 224     {
 225       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 226       {
 227         showLabels_actionPerformed(e);
 228       }
 229     });
 230     print.setText("Print");
 231     bgcolour.setText("Background Colour...");
 232     bgcolour.addActionListener(new ActionListener()
 233     {
 234       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 235       {
 236         bgcolour_actionPerformed(e);
 237       }
 238     });
 239     originalSeqData.setText("Input Data...");
 240     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()
 241     {
 242       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 243       {
 244         originalSeqData_actionPerformed(e);
 245       }
 246     });
 247     associateViewsMenu.setText("Associate Nodes With");
 248     calcSettings.setText("Change Parameters");
 249     nuclSetting.setText("Nucleotide matrix");
 250     protSetting.setText("Protein matrix");
 251     nuclSetting.addActionListener(new ActionListener()
 252     {
 253
 254       @Override
 255       public void actionPerformed(ActionEvent arg0)
 256       {
 257         nuclSetting_actionPerfomed(arg0);
 258       }
 259     });
 260     protSetting.addActionListener(new ActionListener()
 261     {
 262
 263       @Override
 264       public void actionPerformed(ActionEvent arg0)
 265       {
 266         protSetting_actionPerfomed(arg0);
 267       }
 268     });
 269     jvVersionSetting.setText("Jalview PCA Calculation");
 270     jvVersionSetting.addActionListener(new ActionListener()
 271     {
 272       @Override
 273       public void actionPerformed(ActionEvent arg0)
 274       {
 275         jvVersionSetting_actionPerfomed(arg0);
 276       }
 277     });
 278     calcSettings.add(jvVersionSetting);
 279     calcSettings.add(nuclSetting);
 280     calcSettings.add(protSetting);
 281     statusPanel.setLayout(statusPanelLayout);
 282     statusBar.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 283     // statusPanel.setBackground(Color.lightGray);
 284     // statusBar.setBackground(Color.lightGray);
 285     // statusPanel.add(statusBar, null);
 286     JPanel panelBar = new JPanel(new BorderLayout());
 287     panelBar.add(jPanel2, BorderLayout.NORTH);
 288     panelBar.add(statusPanel, BorderLayout.SOUTH);
 289     this.getContentPane().add(panelBar, BorderLayout.SOUTH);
 290     jPanel2.add(jLabel1, null);
 291     jPanel2.add(xCombobox, null);
 292     jPanel2.add(jLabel2, null);
 293     jPanel2.add(yCombobox, null);
 294     jPanel2.add(jLabel3, null);
 295     jPanel2.add(zCombobox, null);
 296     jPanel2.add(resetButton, null);
 297     jMenuBar1.add(fileMenu);
 298     jMenuBar1.add(viewMenu);
 299     jMenuBar1.add(calcSettings);
 300     fileMenu.add(saveMenu);
 301     fileMenu.add(outputValues);
 302     fileMenu.add(print);
 303     fileMenu.add(originalSeqData);
 304     fileMenu.add(outputPoints);
 305     fileMenu.add(outputProjPoints);
 306     saveMenu.add(eps);
 307     saveMenu.add(png);
 308     viewMenu.add(showLabels);
 309     viewMenu.add(bgcolour);
 310     viewMenu.add(associateViewsMenu);
 311   }
 312
 313   protected void resetButton_actionPerformed(ActionEvent e)
 314   {
 315     // TODO Auto-generated method stub
 316
 317   }
 318
 319   protected void protSetting_actionPerfomed(ActionEvent arg0)
 320   {
 321     // TODO Auto-generated method stub
 322
 323   }
 324
 325   protected void nuclSetting_actionPerfomed(ActionEvent arg0)
 326   {
 327     // TODO Auto-generated method stub
 328
 329   }
 330
 331   protected void outputPoints_actionPerformed(ActionEvent e)
 332   {
 333     // TODO Auto-generated method stub
 334
 335   }
 336
 337   protected void outputProjPoints_actionPerformed(ActionEvent e)
 338   {
 339     // TODO Auto-generated method stub
 340
 341   }
 342
 343   protected void xCombobox_actionPerformed(ActionEvent e)
 344   {
 345   }
 346
 347   protected void yCombobox_actionPerformed(ActionEvent e)
 348   {
 349   }
 350
 351   protected void zCombobox_actionPerformed(ActionEvent e)
 352   {
 353   }
 354
 355   public void eps_actionPerformed(ActionEvent e)
 356   {
 357
 358   }
 359
 360   public void png_actionPerformed(ActionEvent e)
 361   {
 362
 363   }
 364
 365   public void outputValues_actionPerformed(ActionEvent e)
 366   {
 367
 368   }
 369
 370   public void print_actionPerformed(ActionEvent e)
 371   {
 372
 373   }
 374
 375   public void showLabels_actionPerformed(ActionEvent e)
 376   {
 377
 378   }
 379
 380   public void bgcolour_actionPerformed(ActionEvent e)
 381   {
 382
 383   }
 384
 385   public void originalSeqData_actionPerformed(ActionEvent e)
 386   {
 387
 388   }
 389
 390   public void viewMenu_menuSelected()
 391   {
 392
 393   }
 394
 395   protected void jvVersionSetting_actionPerfomed(ActionEvent arg0)
 396   {
 397     // TODO Auto-generated method stub
 398
 399   }
 400 }