src/jalview/jbgui/GTreePanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package jalview.jbgui;
  20
  21 import java.awt.*;
  22 import java.awt.event.*;
  23 import javax.swing.*;
  24 import javax.swing.event.*;
  25
  26 public class GTreePanel extends JInternalFrame
  27 {
  28   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();
  29
  30   public JScrollPane scrollPane = new JScrollPane();
  31
  32   JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();
  33
  34   JMenu fileMenu = new JMenu();
  35
  36   JMenuItem saveAsNewick = new JMenuItem();
  37
  38   JMenuItem printMenu = new JMenuItem();
  39
  40   protected JMenu viewMenu = new JMenu();
  41
  42   public JMenuItem font = new JMenuItem();
  43
  44   public JMenuItem sortAssocViews = new JMenuItem();
  45
  46   public JCheckBoxMenuItem bootstrapMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  47
  48   public JCheckBoxMenuItem distanceMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  49
  50   public JCheckBoxMenuItem fitToWindow = new JCheckBoxMenuItem();
  51
  52   public JCheckBoxMenuItem placeholdersMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  53
  54   JMenuItem pngTree = new JMenuItem();
  55
  56   JMenuItem epsTree = new JMenuItem();
  57
  58   JMenu saveAsMenu = new JMenu();
  59
  60   JMenuItem textbox = new JMenuItem();
  61
  62   public JMenuItem originalSeqData = new JMenuItem();
  63
  64   protected JMenu associateLeavesMenu = new JMenu();
  65
  66   public GTreePanel()
  67   {
  68     try
  69     {
  70       jbInit();
  71       this.setJMenuBar(jMenuBar1);
  72     } catch (Exception e)
  73     {
  74       e.printStackTrace();
  75     }
  76   }
  77
  78   private void jbInit() throws Exception
  79   {
  80     this.getContentPane().setLayout(borderLayout1);
  81     this.setBackground(Color.white);
  82     this.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
  83     scrollPane.setOpaque(false);
  84     fileMenu.setText("File");
  85     saveAsNewick.setText("Newick Format");
  86     saveAsNewick.addActionListener(new ActionListener()
  87     {
  88       public void actionPerformed(ActionEvent e)
  89       {
  90         saveAsNewick_actionPerformed(e);
  91       }
  92     });
  93     printMenu.setText("Print");
  94     printMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
  95     {
  96       public void actionPerformed(ActionEvent e)
  97       {
  98         printMenu_actionPerformed(e);
  99       }
 100     });
 101     viewMenu.setText("View");
 102     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()
 103     {
 104       public void menuSelected(MenuEvent e)
 105       {
 106         viewMenu_menuSelected();
 107       }
 108
 109       public void menuDeselected(MenuEvent e)
 110       {
 111       }
 112
 113       public void menuCanceled(MenuEvent e)
 114       {
 115       }
 116     });
 117     sortAssocViews.setText("Sort Alignment By Tree");
 118     sortAssocViews.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 119     {
 120       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 121       {
 122         sortByTree_actionPerformed(e);
 123       }
 124     });
 125     font.setText("Font...");
 126     font.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 127     {
 128       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 129       {
 130         font_actionPerformed(e);
 131       }
 132     });
 133     bootstrapMenu.setText("Show Bootstrap Values");
 134     bootstrapMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 135     {
 136       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 137       {
 138         bootstrapMenu_actionPerformed(e);
 139       }
 140     });
 141     distanceMenu.setText("Show Distances");
 142     distanceMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 143     {
 144       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 145       {
 146         distanceMenu_actionPerformed(e);
 147       }
 148     });
 149     fitToWindow.setSelected(true);
 150     fitToWindow.setText("Fit To Window");
 151     fitToWindow.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 152     {
 153       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 154       {
 155         fitToWindow_actionPerformed(e);
 156       }
 157     });
 158     epsTree.setText("EPS");
 159     epsTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 160     {
 161       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 162       {
 163         epsTree_actionPerformed(e);
 164       }
 165     });
 166     pngTree.setText("PNG");
 167     pngTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 168     {
 169       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 170       {
 171         pngTree_actionPerformed(e);
 172       }
 173     });
 174     saveAsMenu.setText("Save as");
 175     placeholdersMenu
 176             .setToolTipText("Marks leaves of tree not associated with a sequence");
 177     placeholdersMenu.setText("Mark Unlinked Leaves");
 178     placeholdersMenu.addActionListener(new ActionListener()
 179     {
 180       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 181       {
 182         placeholdersMenu_actionPerformed(e);
 183       }
 184     });
 185     textbox.setText("Output to Textbox...");
 186     textbox.addActionListener(new ActionListener()
 187     {
 188       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 189       {
 190         textbox_actionPerformed(e);
 191       }
 192     });
 193     originalSeqData.setText("Input Data...");
 194     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()
 195     {
 196       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 197       {
 198         originalSeqData_actionPerformed(e);
 199       }
 200     });
 201     associateLeavesMenu.setText("Associate Leaves With");
 202     this.getContentPane().add(scrollPane, BorderLayout.CENTER);
 203     jMenuBar1.add(fileMenu);
 204     jMenuBar1.add(viewMenu);
 205     fileMenu.add(saveAsMenu);
 206     fileMenu.add(textbox);
 207     fileMenu.add(printMenu);
 208     fileMenu.add(originalSeqData);
 209     viewMenu.add(fitToWindow);
 210     viewMenu.add(font);
 211     viewMenu.add(distanceMenu);
 212     viewMenu.add(bootstrapMenu);
 213     viewMenu.add(placeholdersMenu);
 214     viewMenu.add(sortAssocViews);
 215     viewMenu.add(associateLeavesMenu);
 216     saveAsMenu.add(saveAsNewick);
 217     saveAsMenu.add(epsTree);
 218     saveAsMenu.add(pngTree);
 219   }
 220
 221   public void printMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 222   {
 223   }
 224
 225   public void font_actionPerformed(ActionEvent e)
 226   {
 227   }
 228
 229   public void distanceMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 230   {
 231   }
 232
 233   public void bootstrapMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 234   {
 235   }
 236
 237   public void fitToWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
 238   {
 239   }
 240
 241   public void pngTree_actionPerformed(ActionEvent e)
 242   {
 243   }
 244
 245   public void epsTree_actionPerformed(ActionEvent e)
 246   {
 247   }
 248
 249   public void saveAsNewick_actionPerformed(ActionEvent e)
 250   {
 251   }
 252
 253   public void placeholdersMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 254   {
 255   }
 256
 257   public void textbox_actionPerformed(ActionEvent e)
 258   {
 259   }
 260
 261   public void fullid_actionPerformed(ActionEvent e)
 262   {
 263
 264   }
 265
 266   public void originalSeqData_actionPerformed(ActionEvent e)
 267   {
 268
 269   }
 270
 271   public void viewMenu_menuSelected()
 272   {
 273   }
 274
 275   public void sortByTree_actionPerformed(ActionEvent e)
 276   {
 277
 278   }
 279
 280 }