src/jalview/jbgui/GTreePanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.jbgui;
  19
  20 import java.awt.*;
  21 import java.awt.event.*;
  22 import javax.swing.*;
  23 import javax.swing.event.*;
  24
  25 public class GTreePanel extends JInternalFrame
  26 {
  27   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();
  28
  29   public JScrollPane scrollPane = new JScrollPane();
  30
  31   JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();
  32
  33   JMenu fileMenu = new JMenu();
  34
  35   JMenuItem saveAsNewick = new JMenuItem();
  36
  37   JMenuItem printMenu = new JMenuItem();
  38
  39   protected JMenu viewMenu = new JMenu();
  40
  41   public JMenuItem font = new JMenuItem();
  42
  43   public JCheckBoxMenuItem bootstrapMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  44
  45   public JCheckBoxMenuItem distanceMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  46
  47   public JCheckBoxMenuItem fitToWindow = new JCheckBoxMenuItem();
  48
  49   public JCheckBoxMenuItem placeholdersMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  50
  51   JMenuItem pngTree = new JMenuItem();
  52
  53   JMenuItem epsTree = new JMenuItem();
  54
  55   JMenu saveAsMenu = new JMenu();
  56
  57   JMenuItem textbox = new JMenuItem();
  58
  59   public JMenuItem originalSeqData = new JMenuItem();
  60
  61   protected JMenu associateLeavesMenu = new JMenu();
  62
  63   public GTreePanel()
  64   {
  65     try
  66     {
  67       jbInit();
  68       this.setJMenuBar(jMenuBar1);
  69     } catch (Exception e)
  70     {
  71       e.printStackTrace();
  72     }
  73   }
  74
  75   private void jbInit() throws Exception
  76   {
  77     this.getContentPane().setLayout(borderLayout1);
  78     this.setBackground(Color.white);
  79     this.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
  80     scrollPane.setOpaque(false);
  81     fileMenu.setText("File");
  82     saveAsNewick.setText("Newick Format");
  83     saveAsNewick.addActionListener(new ActionListener()
  84     {
  85       public void actionPerformed(ActionEvent e)
  86       {
  87         saveAsNewick_actionPerformed(e);
  88       }
  89     });
  90     printMenu.setText("Print");
  91     printMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
  92     {
  93       public void actionPerformed(ActionEvent e)
  94       {
  95         printMenu_actionPerformed(e);
  96       }
  97     });
  98     viewMenu.setText("View");
  99     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()
 100     {
 101       public void menuSelected(MenuEvent e)
 102       {
 103         viewMenu_menuSelected();
 104       }
 105
 106       public void menuDeselected(MenuEvent e)
 107       {
 108       }
 109
 110       public void menuCanceled(MenuEvent e)
 111       {
 112       }
 113     });
 114     font.setText("Font...");
 115     font.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 116     {
 117       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 118       {
 119         font_actionPerformed(e);
 120       }
 121     });
 122     bootstrapMenu.setText("Show Bootstrap Values");
 123     bootstrapMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 124     {
 125       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 126       {
 127         bootstrapMenu_actionPerformed(e);
 128       }
 129     });
 130     distanceMenu.setText("Show Distances");
 131     distanceMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 132     {
 133       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 134       {
 135         distanceMenu_actionPerformed(e);
 136       }
 137     });
 138     fitToWindow.setSelected(true);
 139     fitToWindow.setText("Fit To Window");
 140     fitToWindow.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 141     {
 142       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 143       {
 144         fitToWindow_actionPerformed(e);
 145       }
 146     });
 147     epsTree.setText("EPS");
 148     epsTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 149     {
 150       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 151       {
 152         epsTree_actionPerformed(e);
 153       }
 154     });
 155     pngTree.setText("PNG");
 156     pngTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 157     {
 158       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 159       {
 160         pngTree_actionPerformed(e);
 161       }
 162     });
 163     saveAsMenu.setText("Save as");
 164     placeholdersMenu
 165             .setToolTipText("Marks leaves of tree not associated with a sequence");
 166     placeholdersMenu.setText("Mark Unlinked Leaves");
 167     placeholdersMenu.addActionListener(new ActionListener()
 168     {
 169       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 170       {
 171         placeholdersMenu_actionPerformed(e);
 172       }
 173     });
 174     textbox.setText("Output to Textbox...");
 175     textbox.addActionListener(new ActionListener()
 176     {
 177       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 178       {
 179         textbox_actionPerformed(e);
 180       }
 181     });
 182     originalSeqData.setText("Input Data...");
 183     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()
 184     {
 185       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 186       {
 187         originalSeqData_actionPerformed(e);
 188       }
 189     });
 190     associateLeavesMenu.setText("Associate Leaves With");
 191     this.getContentPane().add(scrollPane, BorderLayout.CENTER);
 192     jMenuBar1.add(fileMenu);
 193     jMenuBar1.add(viewMenu);
 194     fileMenu.add(saveAsMenu);
 195     fileMenu.add(textbox);
 196     fileMenu.add(printMenu);
 197     fileMenu.add(originalSeqData);
 198     viewMenu.add(fitToWindow);
 199     viewMenu.add(font);
 200     viewMenu.add(distanceMenu);
 201     viewMenu.add(bootstrapMenu);
 202     viewMenu.add(placeholdersMenu);
 203     viewMenu.add(associateLeavesMenu);
 204     saveAsMenu.add(saveAsNewick);
 205     saveAsMenu.add(epsTree);
 206     saveAsMenu.add(pngTree);
 207   }
 208
 209   public void printMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 210   {
 211   }
 212
 213   public void font_actionPerformed(ActionEvent e)
 214   {
 215   }
 216
 217   public void distanceMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 218   {
 219   }
 220
 221   public void bootstrapMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 222   {
 223   }
 224
 225   public void fitToWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
 226   {
 227   }
 228
 229   public void pngTree_actionPerformed(ActionEvent e)
 230   {
 231   }
 232
 233   public void epsTree_actionPerformed(ActionEvent e)
 234   {
 235   }
 236
 237   public void saveAsNewick_actionPerformed(ActionEvent e)
 238   {
 239   }
 240
 241   public void placeholdersMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 242   {
 243   }
 244
 245   public void textbox_actionPerformed(ActionEvent e)
 246   {
 247   }
 248
 249   public void fullid_actionPerformed(ActionEvent e)
 250   {
 251
 252   }
 253
 254   public void originalSeqData_actionPerformed(ActionEvent e)
 255   {
 256
 257   }
 258
 259   public void viewMenu_menuSelected()
 260   {
 261   }
 262 }