src/jalview/jbgui/GTreePanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.jbgui;
  20
  21 import java.awt.*;
  22 import java.awt.event.*;
  23 import javax.swing.*;
  24 import javax.swing.event.*;
  25
  26 public class GTreePanel extends JInternalFrame
  27 {
  28   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();
  29
  30   public JScrollPane scrollPane = new JScrollPane();
  31
  32   JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();
  33
  34   JMenu fileMenu = new JMenu();
  35
  36   JMenuItem saveAsNewick = new JMenuItem();
  37
  38   JMenuItem printMenu = new JMenuItem();
  39
  40   protected JMenu viewMenu = new JMenu();
  41
  42   public JMenuItem font = new JMenuItem();
  43
  44   public JCheckBoxMenuItem bootstrapMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  45
  46   public JCheckBoxMenuItem distanceMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  47
  48   public JCheckBoxMenuItem fitToWindow = new JCheckBoxMenuItem();
  49
  50   public JCheckBoxMenuItem placeholdersMenu = new JCheckBoxMenuItem();
  51
  52   JMenuItem pngTree = new JMenuItem();
  53
  54   JMenuItem epsTree = new JMenuItem();
  55
  56   JMenu saveAsMenu = new JMenu();
  57
  58   JMenuItem textbox = new JMenuItem();
  59
  60   public JMenuItem originalSeqData = new JMenuItem();
  61
  62   protected JMenu associateLeavesMenu = new JMenu();
  63
  64   public GTreePanel()
  65   {
  66     try
  67     {
  68       jbInit();
  69       this.setJMenuBar(jMenuBar1);
  70     } catch (Exception e)
  71     {
  72       e.printStackTrace();
  73     }
  74   }
  75
  76   private void jbInit() throws Exception
  77   {
  78     this.getContentPane().setLayout(borderLayout1);
  79     this.setBackground(Color.white);
  80     this.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
  81     scrollPane.setOpaque(false);
  82     fileMenu.setText("File");
  83     saveAsNewick.setText("Newick Format");
  84     saveAsNewick.addActionListener(new ActionListener()
  85     {
  86       public void actionPerformed(ActionEvent e)
  87       {
  88         saveAsNewick_actionPerformed(e);
  89       }
  90     });
  91     printMenu.setText("Print");
  92     printMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
  93     {
  94       public void actionPerformed(ActionEvent e)
  95       {
  96         printMenu_actionPerformed(e);
  97       }
  98     });
  99     viewMenu.setText("View");
 100     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()
 101     {
 102       public void menuSelected(MenuEvent e)
 103       {
 104         viewMenu_menuSelected();
 105       }
 106
 107       public void menuDeselected(MenuEvent e)
 108       {
 109       }
 110
 111       public void menuCanceled(MenuEvent e)
 112       {
 113       }
 114     });
 115     font.setText("Font...");
 116     font.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 117     {
 118       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 119       {
 120         font_actionPerformed(e);
 121       }
 122     });
 123     bootstrapMenu.setText("Show Bootstrap Values");
 124     bootstrapMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 125     {
 126       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 127       {
 128         bootstrapMenu_actionPerformed(e);
 129       }
 130     });
 131     distanceMenu.setText("Show Distances");
 132     distanceMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 133     {
 134       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 135       {
 136         distanceMenu_actionPerformed(e);
 137       }
 138     });
 139     fitToWindow.setSelected(true);
 140     fitToWindow.setText("Fit To Window");
 141     fitToWindow.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 142     {
 143       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 144       {
 145         fitToWindow_actionPerformed(e);
 146       }
 147     });
 148     epsTree.setText("EPS");
 149     epsTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 150     {
 151       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 152       {
 153         epsTree_actionPerformed(e);
 154       }
 155     });
 156     pngTree.setText("PNG");
 157     pngTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 158     {
 159       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 160       {
 161         pngTree_actionPerformed(e);
 162       }
 163     });
 164     saveAsMenu.setText("Save as");
 165     placeholdersMenu
 166             .setToolTipText("Marks leaves of tree not associated with a sequence");
 167     placeholdersMenu.setText("Mark Unlinked Leaves");
 168     placeholdersMenu.addActionListener(new ActionListener()
 169     {
 170       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 171       {
 172         placeholdersMenu_actionPerformed(e);
 173       }
 174     });
 175     textbox.setText("Output to Textbox...");
 176     textbox.addActionListener(new ActionListener()
 177     {
 178       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 179       {
 180         textbox_actionPerformed(e);
 181       }
 182     });
 183     originalSeqData.setText("Input Data...");
 184     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()
 185     {
 186       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 187       {
 188         originalSeqData_actionPerformed(e);
 189       }
 190     });
 191     associateLeavesMenu.setText("Associate Leaves With");
 192     this.getContentPane().add(scrollPane, BorderLayout.CENTER);
 193     jMenuBar1.add(fileMenu);
 194     jMenuBar1.add(viewMenu);
 195     fileMenu.add(saveAsMenu);
 196     fileMenu.add(textbox);
 197     fileMenu.add(printMenu);
 198     fileMenu.add(originalSeqData);
 199     viewMenu.add(fitToWindow);
 200     viewMenu.add(font);
 201     viewMenu.add(distanceMenu);
 202     viewMenu.add(bootstrapMenu);
 203     viewMenu.add(placeholdersMenu);
 204     viewMenu.add(associateLeavesMenu);
 205     saveAsMenu.add(saveAsNewick);
 206     saveAsMenu.add(epsTree);
 207     saveAsMenu.add(pngTree);
 208   }
 209
 210   public void printMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 211   {
 212   }
 213
 214   public void font_actionPerformed(ActionEvent e)
 215   {
 216   }
 217
 218   public void distanceMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 219   {
 220   }
 221
 222   public void bootstrapMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 223   {
 224   }
 225
 226   public void fitToWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
 227   {
 228   }
 229
 230   public void pngTree_actionPerformed(ActionEvent e)
 231   {
 232   }
 233
 234   public void epsTree_actionPerformed(ActionEvent e)
 235   {
 236   }
 237
 238   public void saveAsNewick_actionPerformed(ActionEvent e)
 239   {
 240   }
 241
 242   public void placeholdersMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 243   {
 244   }
 245
 246   public void textbox_actionPerformed(ActionEvent e)
 247   {
 248   }
 249
 250   public void fullid_actionPerformed(ActionEvent e)
 251   {
 252
 253   }
 254
 255   public void originalSeqData_actionPerformed(ActionEvent e)
 256   {
 257
 258   }
 259
 260   public void viewMenu_menuSelected()
 261   {
 262   }
 263 }