src/jalview/json/binding/v1/SequencePojo.java

   1 package jalview.json.binding.v1;
   2
   3
   4
   5 public class SequencePojo
   6 {
   7   private String seq;
   8
   9   private String name;
  10
  11   private String id;
  12
  13   private int order;
  14
  15   private int start;
  16
  17   private int end;
  18
  19   // private ArrayList<SequenceFeaturesPojo> features = new
  20   // ArrayList<SequenceFeaturesPojo>();
  21
  22   public SequencePojo()
  23   {
  24   }
  25
  26   public SequencePojo(int start, int end, String id, String name, String seq)
  27   {
  28     this.id = id;
  29     this.name = name;
  30     this.seq = seq;
  31   }
  32   public String getSeq()
  33   {
  34     return seq;
  35   }
  36
  37   public void setSeq(String seq)
  38   {
  39     this.seq = seq;
  40   }
  41
  42   public String getName()
  43   {
  44
  45     return name;
  46   }
  47
  48   public void setName(String name)
  49   {
  50     this.name = name;
  51   }
  52
  53   public String getId()
  54   {
  55     return id;
  56   }
  57
  58   public void setId(String id)
  59   {
  60     this.id = id;
  61   }
  62
  63   public int getStart()
  64   {
  65     return start;
  66   }
  67
  68   public void setStart(int start)
  69   {
  70     this.start = start;
  71   }
  72
  73   public int getEnd()
  74   {
  75     return end;
  76   }
  77
  78   public void setEnd(int end)
  79   {
  80     this.end = end;
  81   }
  82
  83   // public ArrayList<SequenceFeaturesPojo> getFeatures()
  84   // {
  85   // return features;
  86   // }
  87   //
  88   // public void setFeatures(ArrayList<SequenceFeaturesPojo> features)
  89   // {
  90   // this.features = features;
  91   // }
  92
  93   public int getOrder()
  94   {
  95     return order;
  96   }
  97
  98   public void setOrder(int order)
  99   {
 100     this.order = order;
 101   }
 102 }