src/jalview/schemabinding/version2/JalviewModel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  17  */
  18 package jalview.schemabinding.version2;
  19
  20 //---------------------------------/
  21 //- Imported classes and packages -/
  22 //---------------------------------/
  23
  24 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  25 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  26
  27 /**
  28  * Class JalviewModel.
  29  *
  30  * @version $Revision$ $Date$
  31  */
  32 public class JalviewModel implements java.io.Serializable
  33 {
  34
  35   // --------------------------/
  36   // - Class/Member Variables -/
  37   // --------------------------/
  38
  39   /**
  40    * Field _creationDate.
  41    */
  42   private java.util.Date _creationDate;
  43
  44   /**
  45    * Field _version.
  46    */
  47   private java.lang.String _version;
  48
  49   /**
  50    * Field _vamsasModel.
  51    */
  52   private jalview.schemabinding.version2.VamsasModel _vamsasModel;
  53
  54   /**
  55    * Field _jalviewModelSequence.
  56    */
  57   private jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence _jalviewModelSequence;
  58
  59   // ----------------/
  60   // - Constructors -/
  61   // ----------------/
  62
  63   public JalviewModel()
  64   {
  65     super();
  66   }
  67
  68   // -----------/
  69   // - Methods -/
  70   // -----------/
  71
  72   /**
  73    * Returns the value of field 'creationDate'.
  74    *
  75    * @return the value of field 'CreationDate'.
  76    */
  77   public java.util.Date getCreationDate()
  78   {
  79     return this._creationDate;
  80   }
  81
  82   /**
  83    * Returns the value of field 'jalviewModelSequence'.
  84    *
  85    * @return the value of field 'JalviewModelSequence'.
  86    */
  87   public jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence()
  88   {
  89     return this._jalviewModelSequence;
  90   }
  91
  92   /**
  93    * Returns the value of field 'vamsasModel'.
  94    *
  95    * @return the value of field 'VamsasModel'.
  96    */
  97   public jalview.schemabinding.version2.VamsasModel getVamsasModel()
  98   {
  99     return this._vamsasModel;
 100   }
 101
 102   /**
 103    * Returns the value of field 'version'.
 104    *
 105    * @return the value of field 'Version'.
 106    */
 107   public java.lang.String getVersion()
 108   {
 109     return this._version;
 110   }
 111
 112   /**
 113    * Method isValid.
 114    *
 115    * @return true if this object is valid according to the schema
 116    */
 117   public boolean isValid()
 118   {
 119     try
 120     {
 121       validate();
 122     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
 123     {
 124       return false;
 125     }
 126     return true;
 127   }
 128
 129   /**
 130    *
 131    *
 132    * @param out
 133    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 134    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 135    *           marshaling
 136    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 137    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 138    */
 139   public void marshal(final java.io.Writer out)
 140           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 141           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 142   {
 143     Marshaller.marshal(this, out);
 144   }
 145
 146   /**
 147    *
 148    *
 149    * @param handler
 150    * @throws java.io.IOException
 151    *           if an IOException occurs during marshaling
 152    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 153    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 154    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 155    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 156    *           marshaling
 157    */
 158   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 159           throws java.io.IOException,
 160           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 161           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 162   {
 163     Marshaller.marshal(this, handler);
 164   }
 165
 166   /**
 167    * Sets the value of field 'creationDate'.
 168    *
 169    * @param creationDate
 170    *          the value of field 'creationDate'.
 171    */
 172   public void setCreationDate(final java.util.Date creationDate)
 173   {
 174     this._creationDate = creationDate;
 175   }
 176
 177   /**
 178    * Sets the value of field 'jalviewModelSequence'.
 179    *
 180    * @param jalviewModelSequence
 181    *          the value of field 'jalviewModelSequence'.
 182    */
 183   public void setJalviewModelSequence(
 184           final jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence jalviewModelSequence)
 185   {
 186     this._jalviewModelSequence = jalviewModelSequence;
 187   }
 188
 189   /**
 190    * Sets the value of field 'vamsasModel'.
 191    *
 192    * @param vamsasModel
 193    *          the value of field 'vamsasModel'.
 194    */
 195   public void setVamsasModel(
 196           final jalview.schemabinding.version2.VamsasModel vamsasModel)
 197   {
 198     this._vamsasModel = vamsasModel;
 199   }
 200
 201   /**
 202    * Sets the value of field 'version'.
 203    *
 204    * @param version
 205    *          the value of field 'version'.
 206    */
 207   public void setVersion(final java.lang.String version)
 208   {
 209     this._version = version;
 210   }
 211
 212   /**
 213    * Method unmarshal.
 214    *
 215    * @param reader
 216    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 217    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 218    *           marshaling
 219    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 220    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 221    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.JalviewModel
 222    */
 223   public static jalview.schemabinding.version2.JalviewModel unmarshal(
 224           final java.io.Reader reader)
 225           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 226           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 227   {
 228     return (jalview.schemabinding.version2.JalviewModel) Unmarshaller
 229             .unmarshal(jalview.schemabinding.version2.JalviewModel.class,
 230                     reader);
 231   }
 232
 233   /**
 234    *
 235    *
 236    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 237    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 238    */
 239   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 240   {
 241     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 242     validator.validate(this);
 243   }
 244
 245 }