src/jalview/schemabinding/version2/MappingChoice.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
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  17  */
  18 package jalview.schemabinding.version2;
  19
  20 //---------------------------------/
  21 //- Imported classes and packages -/
  22 //---------------------------------/
  23
  24 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  25 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  26
  27 /**
  28  * Class MappingChoice.
  29  *
  30  * @version $Revision$ $Date$
  31  */
  32 public class MappingChoice implements java.io.Serializable
  33 {
  34
  35   // --------------------------/
  36   // - Class/Member Variables -/
  37   // --------------------------/
  38
  39   /**
  40    * Field _sequence.
  41    */
  42   private jalview.schemabinding.version2.Sequence _sequence;
  43
  44   /**
  45    * Field _dseqFor.
  46    */
  47   private java.lang.String _dseqFor;
  48
  49   // ----------------/
  50   // - Constructors -/
  51   // ----------------/
  52
  53   public MappingChoice()
  54   {
  55     super();
  56   }
  57
  58   // -----------/
  59   // - Methods -/
  60   // -----------/
  61
  62   /**
  63    * Returns the value of field 'dseqFor'.
  64    *
  65    * @return the value of field 'DseqFor'.
  66    */
  67   public java.lang.String getDseqFor()
  68   {
  69     return this._dseqFor;
  70   }
  71
  72   /**
  73    * Returns the value of field 'sequence'.
  74    *
  75    * @return the value of field 'Sequence'.
  76    */
  77   public jalview.schemabinding.version2.Sequence getSequence()
  78   {
  79     return this._sequence;
  80   }
  81
  82   /**
  83    * Method isValid.
  84    *
  85    * @return true if this object is valid according to the schema
  86    */
  87   public boolean isValid()
  88   {
  89     try
  90     {
  91       validate();
  92     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
  93     {
  94       return false;
  95     }
  96     return true;
  97   }
  98
  99   /**
 100    *
 101    *
 102    * @param out
 103    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 104    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 105    *           marshaling
 106    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 107    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 108    */
 109   public void marshal(final java.io.Writer out)
 110           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 111           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 112   {
 113     Marshaller.marshal(this, out);
 114   }
 115
 116   /**
 117    *
 118    *
 119    * @param handler
 120    * @throws java.io.IOException
 121    *           if an IOException occurs during marshaling
 122    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 123    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 124    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 125    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 126    *           marshaling
 127    */
 128   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 129           throws java.io.IOException,
 130           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 131           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 132   {
 133     Marshaller.marshal(this, handler);
 134   }
 135
 136   /**
 137    * Sets the value of field 'dseqFor'.
 138    *
 139    * @param dseqFor
 140    *          the value of field 'dseqFor'.
 141    */
 142   public void setDseqFor(final java.lang.String dseqFor)
 143   {
 144     this._dseqFor = dseqFor;
 145   }
 146
 147   /**
 148    * Sets the value of field 'sequence'.
 149    *
 150    * @param sequence
 151    *          the value of field 'sequence'.
 152    */
 153   public void setSequence(
 154           final jalview.schemabinding.version2.Sequence sequence)
 155   {
 156     this._sequence = sequence;
 157   }
 158
 159   /**
 160    * Method unmarshal.
 161    *
 162    * @param reader
 163    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 164    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 165    *           marshaling
 166    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 167    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 168    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.MappingChoice
 169    */
 170   public static jalview.schemabinding.version2.MappingChoice unmarshal(
 171           final java.io.Reader reader)
 172           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 173           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 174   {
 175     return (jalview.schemabinding.version2.MappingChoice) Unmarshaller
 176             .unmarshal(jalview.schemabinding.version2.MappingChoice.class,
 177                     reader);
 178   }
 179
 180   /**
 181    *
 182    *
 183    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 184    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 185    */
 186   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 187   {
 188     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 189     validator.validate(this);
 190   }
 191
 192 }