src/jalview/schemabinding/version2/SequenceType.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
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  19  ******************************************************************************/
  20 /*
  21  * This class was automatically generated with
  22  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  23  * Schema.
  24  * $Id$
  25  */
  26
  27 package jalview.schemabinding.version2;
  28
  29 //---------------------------------/
  30 //- Imported classes and packages -/
  31 //---------------------------------/
  32
  33 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  34 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  35
  36 /**
  37  * Class SequenceType.
  38  *
  39  * @version $Revision$ $Date$
  40  */
  41 public class SequenceType implements java.io.Serializable
  42 {
  43
  44   // --------------------------/
  45   // - Class/Member Variables -/
  46   // --------------------------/
  47
  48   /**
  49    * Field _id.
  50    */
  51   private java.lang.String _id;
  52
  53   /**
  54    * Field _description.
  55    */
  56   private java.lang.String _description;
  57
  58   /**
  59    * Field _sequence.
  60    */
  61   private java.lang.String _sequence;
  62
  63   /**
  64    * Field _name.
  65    */
  66   private java.lang.String _name;
  67
  68   // ----------------/
  69   // - Constructors -/
  70   // ----------------/
  71
  72   public SequenceType()
  73   {
  74     super();
  75   }
  76
  77   // -----------/
  78   // - Methods -/
  79   // -----------/
  80
  81   /**
  82    * Returns the value of field 'description'.
  83    *
  84    * @return the value of field 'Description'.
  85    */
  86   public java.lang.String getDescription()
  87   {
  88     return this._description;
  89   }
  90
  91   /**
  92    * Returns the value of field 'id'.
  93    *
  94    * @return the value of field 'Id'.
  95    */
  96   public java.lang.String getId()
  97   {
  98     return this._id;
  99   }
 100
 101   /**
 102    * Returns the value of field 'name'.
 103    *
 104    * @return the value of field 'Name'.
 105    */
 106   public java.lang.String getName()
 107   {
 108     return this._name;
 109   }
 110
 111   /**
 112    * Returns the value of field 'sequence'.
 113    *
 114    * @return the value of field 'Sequence'.
 115    */
 116   public java.lang.String getSequence()
 117   {
 118     return this._sequence;
 119   }
 120
 121   /**
 122    * Method isValid.
 123    *
 124    * @return true if this object is valid according to the schema
 125    */
 126   public boolean isValid()
 127   {
 128     try
 129     {
 130       validate();
 131     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
 132     {
 133       return false;
 134     }
 135     return true;
 136   }
 137
 138   /**
 139    *
 140    *
 141    * @param out
 142    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 143    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 144    *           marshaling
 145    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 146    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 147    */
 148   public void marshal(final java.io.Writer out)
 149           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 150           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 151   {
 152     Marshaller.marshal(this, out);
 153   }
 154
 155   /**
 156    *
 157    *
 158    * @param handler
 159    * @throws java.io.IOException
 160    *           if an IOException occurs during marshaling
 161    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 162    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 163    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 164    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 165    *           marshaling
 166    */
 167   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 168           throws java.io.IOException,
 169           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 170           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 171   {
 172     Marshaller.marshal(this, handler);
 173   }
 174
 175   /**
 176    * Sets the value of field 'description'.
 177    *
 178    * @param description
 179    *          the value of field 'description'.
 180    */
 181   public void setDescription(final java.lang.String description)
 182   {
 183     this._description = description;
 184   }
 185
 186   /**
 187    * Sets the value of field 'id'.
 188    *
 189    * @param id
 190    *          the value of field 'id'.
 191    */
 192   public void setId(final java.lang.String id)
 193   {
 194     this._id = id;
 195   }
 196
 197   /**
 198    * Sets the value of field 'name'.
 199    *
 200    * @param name
 201    *          the value of field 'name'.
 202    */
 203   public void setName(final java.lang.String name)
 204   {
 205     this._name = name;
 206   }
 207
 208   /**
 209    * Sets the value of field 'sequence'.
 210    *
 211    * @param sequence
 212    *          the value of field 'sequence'.
 213    */
 214   public void setSequence(final java.lang.String sequence)
 215   {
 216     this._sequence = sequence;
 217   }
 218
 219   /**
 220    * Method unmarshal.
 221    *
 222    * @param reader
 223    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 224    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 225    *           marshaling
 226    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 227    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 228    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.SequenceType
 229    */
 230   public static jalview.schemabinding.version2.SequenceType unmarshal(
 231           final java.io.Reader reader)
 232           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 233           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 234   {
 235     return (jalview.schemabinding.version2.SequenceType) Unmarshaller
 236             .unmarshal(jalview.schemabinding.version2.SequenceType.class,
 237                     reader);
 238   }
 239
 240   /**
 241    *
 242    *
 243    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 244    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 245    */
 246   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 247   {
 248     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 249     validator.validate(this);
 250   }
 251
 252 }