src/jalview/schemabinding/version2/SequenceType.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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  17  *******************************************************************************/
  18 /*
  19  * This class was automatically generated with
  20  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  21  * Schema.
  22  * $Id$
  23  */
  24
  25 package jalview.schemabinding.version2;
  26
  27   //---------------------------------/
  28  //- Imported classes and packages -/
  29 //---------------------------------/
  30
  31 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  32 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  33
  34 /**
  35  * Class SequenceType.
  36  *
  37  * @version $Revision$ $Date$
  38  */
  39 public class SequenceType implements java.io.Serializable {
  40
  41
  42       //--------------------------/
  43      //- Class/Member Variables -/
  44     //--------------------------/
  45
  46     /**
  47      * Field _id.
  48      */
  49     private java.lang.String _id;
  50
  51     /**
  52      * Field _description.
  53      */
  54     private java.lang.String _description;
  55
  56     /**
  57      * Field _sequence.
  58      */
  59     private java.lang.String _sequence;
  60
  61     /**
  62      * Field _name.
  63      */
  64     private java.lang.String _name;
  65
  66
  67       //----------------/
  68      //- Constructors -/
  69     //----------------/
  70
  71     public SequenceType() {
  72         super();
  73     }
  74
  75
  76       //-----------/
  77      //- Methods -/
  78     //-----------/
  79
  80     /**
  81      * Returns the value of field 'description'.
  82      *
  83      * @return the value of field 'Description'.
  84      */
  85     public java.lang.String getDescription(
  86     ) {
  87         return this._description;
  88     }
  89
  90     /**
  91      * Returns the value of field 'id'.
  92      *
  93      * @return the value of field 'Id'.
  94      */
  95     public java.lang.String getId(
  96     ) {
  97         return this._id;
  98     }
  99
 100     /**
 101      * Returns the value of field 'name'.
 102      *
 103      * @return the value of field 'Name'.
 104      */
 105     public java.lang.String getName(
 106     ) {
 107         return this._name;
 108     }
 109
 110     /**
 111      * Returns the value of field 'sequence'.
 112      *
 113      * @return the value of field 'Sequence'.
 114      */
 115     public java.lang.String getSequence(
 116     ) {
 117         return this._sequence;
 118     }
 119
 120     /**
 121      * Method isValid.
 122      *
 123      * @return true if this object is valid according to the schema
 124      */
 125     public boolean isValid(
 126     ) {
 127         try {
 128             validate();
 129         } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {
 130             return false;
 131         }
 132         return true;
 133     }
 134
 135     /**
 136      *
 137      *
 138      * @param out
 139      * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is
 140      * null or if any SAXException is thrown during marshaling
 141      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 142      * object is an invalid instance according to the schema
 143      */
 144     public void marshal(
 145             final java.io.Writer out)
 146     throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 147         Marshaller.marshal(this, out);
 148     }
 149
 150     /**
 151      *
 152      *
 153      * @param handler
 154      * @throws java.io.IOException if an IOException occurs during
 155      * marshaling
 156      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 157      * object is an invalid instance according to the schema
 158      * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is
 159      * null or if any SAXException is thrown during marshaling
 160      */
 161     public void marshal(
 162             final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 163     throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 164         Marshaller.marshal(this, handler);
 165     }
 166
 167     /**
 168      * Sets the value of field 'description'.
 169      *
 170      * @param description the value of field 'description'.
 171      */
 172     public void setDescription(
 173             final java.lang.String description) {
 174         this._description = description;
 175     }
 176
 177     /**
 178      * Sets the value of field 'id'.
 179      *
 180      * @param id the value of field 'id'.
 181      */
 182     public void setId(
 183             final java.lang.String id) {
 184         this._id = id;
 185     }
 186
 187     /**
 188      * Sets the value of field 'name'.
 189      *
 190      * @param name the value of field 'name'.
 191      */
 192     public void setName(
 193             final java.lang.String name) {
 194         this._name = name;
 195     }
 196
 197     /**
 198      * Sets the value of field 'sequence'.
 199      *
 200      * @param sequence the value of field 'sequence'.
 201      */
 202     public void setSequence(
 203             final java.lang.String sequence) {
 204         this._sequence = sequence;
 205     }
 206
 207     /**
 208      * Method unmarshal.
 209      *
 210      * @param reader
 211      * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is
 212      * null or if any SAXException is thrown during marshaling
 213      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 214      * object is an invalid instance according to the schema
 215      * @return the unmarshaled
 216      * jalview.schemabinding.version2.SequenceType
 217      */
 218     public static jalview.schemabinding.version2.SequenceType unmarshal(
 219             final java.io.Reader reader)
 220     throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 221         return (jalview.schemabinding.version2.SequenceType) Unmarshaller.unmarshal(jalview.schemabinding.version2.SequenceType.class, reader);
 222     }
 223
 224     /**
 225      *
 226      *
 227      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 228      * object is an invalid instance according to the schema
 229      */
 230     public void validate(
 231     )
 232     throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 233         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 234         validator.validate(this);
 235     }
 236
 237 }