src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodMapDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21 // ---------------------------------/\r
  22 // - Imported classes and packages -/\r
  23 // ---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.AlcodMap;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class AlcodMapDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class AlcodMapDescriptor extends\r
  33         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  34 {\r
  35 \r
  36   // --------------------------/\r
  37   // - Class/Member Variables -/\r
  38   // --------------------------/\r
  39 \r
  40   /**\r
  41    * Field _elementDefinition.\r
  42    */\r
  43   private boolean _elementDefinition;\r
  44 \r
  45   /**\r
  46    * Field _nsPrefix.\r
  47    */\r
  48   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  49 \r
  50   /**\r
  51    * Field _nsURI.\r
  52    */\r
  53   private java.lang.String _nsURI;\r
  54 \r
  55   /**\r
  56    * Field _xmlName.\r
  57    */\r
  58   private java.lang.String _xmlName;\r
  59 \r
  60   // ----------------/\r
  61   // - Constructors -/\r
  62   // ----------------/\r
  63 \r
  64   public AlcodMapDescriptor()\r
  65   {\r
  66     super();\r
  67     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  68     _xmlName = "alcodMap";\r
  69     _elementDefinition = true;\r
  70 \r
  71     // -- set grouping compositor\r
  72     setCompositorAsSequence();\r
  73     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  74     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  75     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  76     // -- initialize attribute descriptors\r
  77 \r
  78     // -- _dnasq\r
  79     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  80             java.lang.String.class, "_dnasq", "dnasq",\r
  81             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  82     desc.setImmutable(true);\r
  83     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  84     {\r
  85       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  86               throws IllegalStateException\r
  87       {\r
  88         AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
  89         return target.getDnasq();\r
  90       }\r
  91 \r
  92       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  93               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  94       {\r
  95         try\r
  96         {\r
  97           AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
  98           target.setDnasq((java.lang.String) value);\r
  99         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 100         {\r
 101           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 102         }\r
 103       }\r
 104 \r
 105       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 106       {\r
 107         return null;\r
 108       }\r
 109     };\r
 110     desc.setHandler(handler);\r
 111     desc.setRequired(true);\r
 112     desc.setMultivalued(false);\r
 113     addFieldDescriptor(desc);\r
 114 \r
 115     // -- validation code for: _dnasq\r
 116     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 117     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 118     { // -- local scope\r
 119       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 120       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 121       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 122       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 123     }\r
 124     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 125     // -- initialize element descriptors\r
 126 \r
 127     // -- _mapping\r
 128     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 129             jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, "_mapping",\r
 130             "Mapping", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 131     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 132     {\r
 133       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 134               throws IllegalStateException\r
 135       {\r
 136         AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
 137         return target.getMapping();\r
 138       }\r
 139 \r
 140       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 141               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 142       {\r
 143         try\r
 144         {\r
 145           AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
 146           target.setMapping((jalview.schemabinding.version2.Mapping) value);\r
 147         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 148         {\r
 149           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 150         }\r
 151       }\r
 152 \r
 153       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 154       {\r
 155         return new jalview.schemabinding.version2.Mapping();\r
 156       }\r
 157     };\r
 158     desc.setHandler(handler);\r
 159     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 160     desc.setRequired(true);\r
 161     desc.setMultivalued(false);\r
 162     addFieldDescriptor(desc);\r
 163 \r
 164     // -- validation code for: _mapping\r
 165     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 166     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 167     { // -- local scope\r
 168     }\r
 169     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 170   }\r
 171 \r
 172   // -----------/\r
 173   // - Methods -/\r
 174   // -----------/\r
 175 \r
 176   /**\r
 177    * Method getAccessMode.\r
 178    * \r
 179    * @return the access mode specified for this class.\r
 180    */\r
 181   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 182   {\r
 183     return null;\r
 184   }\r
 185 \r
 186   /**\r
 187    * Method getIdentity.\r
 188    * \r
 189    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 190    */\r
 191   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 192   {\r
 193     return super.getIdentity();\r
 194   }\r
 195 \r
 196   /**\r
 197    * Method getJavaClass.\r
 198    * \r
 199    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 200    */\r
 201   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 202   {\r
 203     return jalview.schemabinding.version2.AlcodMap.class;\r
 204   }\r
 205 \r
 206   /**\r
 207    * Method getNameSpacePrefix.\r
 208    * \r
 209    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 210    */\r
 211   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 212   {\r
 213     return _nsPrefix;\r
 214   }\r
 215 \r
 216   /**\r
 217    * Method getNameSpaceURI.\r
 218    * \r
 219    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 220    */\r
 221   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 222   {\r
 223     return _nsURI;\r
 224   }\r
 225 \r
 226   /**\r
 227    * Method getValidator.\r
 228    * \r
 229    * @return a specific validator for the class described by this\r
 230    *         ClassDescriptor.\r
 231    */\r
 232   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 233   {\r
 234     return this;\r
 235   }\r
 236 \r
 237   /**\r
 238    * Method getXMLName.\r
 239    * \r
 240    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 241    */\r
 242   public java.lang.String getXMLName()\r
 243   {\r
 244     return _xmlName;\r
 245   }\r
 246 \r
 247   /**\r
 248    * Method isElementDefinition.\r
 249    * \r
 250    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 251    *         element or element with anonymous type definition.\r
 252    */\r
 253   public boolean isElementDefinition()\r
 254   {\r
 255     return _elementDefinition;\r
 256   }\r
 257 \r
 258 }\r