src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonDescriptor.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
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  17  */
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  19
  20 //---------------------------------/
  21 //- Imported classes and packages -/
  22 //---------------------------------/
  23
  24 import jalview.schemabinding.version2.Alcodon;
  25
  26 /**
  27  * Class AlcodonDescriptor.
  28  *
  29  * @version $Revision$ $Date$
  30  */
  31 public class AlcodonDescriptor extends
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  33 {
  34
  35   // --------------------------/
  36   // - Class/Member Variables -/
  37   // --------------------------/
  38
  39   /**
  40    * Field _elementDefinition.
  41    */
  42   private boolean _elementDefinition;
  43
  44   /**
  45    * Field _nsPrefix.
  46    */
  47   private java.lang.String _nsPrefix;
  48
  49   /**
  50    * Field _nsURI.
  51    */
  52   private java.lang.String _nsURI;
  53
  54   /**
  55    * Field _xmlName.
  56    */
  57   private java.lang.String _xmlName;
  58
  59   // ----------------/
  60   // - Constructors -/
  61   // ----------------/
  62
  63   public AlcodonDescriptor()
  64   {
  65     super();
  66     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  67     _xmlName = "alcodon";
  68     _elementDefinition = true;
  69     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  70     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  71     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  72     // -- initialize attribute descriptors
  73
  74     // -- _pos1
  75     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  76             java.lang.Long.TYPE, "_pos1", "pos1",
  77             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  78     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  79     {
  80       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  81               throws IllegalStateException
  82       {
  83         Alcodon target = (Alcodon) object;
  84         if (!target.hasPos1())
  85         {
  86           return null;
  87         }
  88         return new java.lang.Long(target.getPos1());
  89       }
  90
  91       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  92               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  93       {
  94         try
  95         {
  96           Alcodon target = (Alcodon) object;
  97           // if null, use delete method for optional primitives
  98           if (value == null)
  99           {
 100             target.deletePos1();
 101             return;
 102           }
 103           target.setPos1(((java.lang.Long) value).longValue());
 104         } catch (java.lang.Exception ex)
 105         {
 106           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 107         }
 108       }
 109
 110       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 111       {
 112         return null;
 113       }
 114     };
 115     desc.setHandler(handler);
 116     desc.setMultivalued(false);
 117     addFieldDescriptor(desc);
 118
 119     // -- validation code for: _pos1
 120     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 121     { // -- local scope
 122       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;
 123       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();
 124       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 125     }
 126     desc.setValidator(fieldValidator);
 127     // -- _pos2
 128     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 129             java.lang.Long.TYPE, "_pos2", "pos2",
 130             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 131     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 132     {
 133       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 134               throws IllegalStateException
 135       {
 136         Alcodon target = (Alcodon) object;
 137         if (!target.hasPos2())
 138         {
 139           return null;
 140         }
 141         return new java.lang.Long(target.getPos2());
 142       }
 143
 144       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 145               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 146       {
 147         try
 148         {
 149           Alcodon target = (Alcodon) object;
 150           // if null, use delete method for optional primitives
 151           if (value == null)
 152           {
 153             target.deletePos2();
 154             return;
 155           }
 156           target.setPos2(((java.lang.Long) value).longValue());
 157         } catch (java.lang.Exception ex)
 158         {
 159           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 160         }
 161       }
 162
 163       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 164       {
 165         return null;
 166       }
 167     };
 168     desc.setHandler(handler);
 169     desc.setMultivalued(false);
 170     addFieldDescriptor(desc);
 171
 172     // -- validation code for: _pos2
 173     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 174     { // -- local scope
 175       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;
 176       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();
 177       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 178     }
 179     desc.setValidator(fieldValidator);
 180     // -- _pos3
 181     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 182             java.lang.Long.TYPE, "_pos3", "pos3",
 183             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 184     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 185     {
 186       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 187               throws IllegalStateException
 188       {
 189         Alcodon target = (Alcodon) object;
 190         if (!target.hasPos3())
 191         {
 192           return null;
 193         }
 194         return new java.lang.Long(target.getPos3());
 195       }
 196
 197       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 198               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 199       {
 200         try
 201         {
 202           Alcodon target = (Alcodon) object;
 203           // if null, use delete method for optional primitives
 204           if (value == null)
 205           {
 206             target.deletePos3();
 207             return;
 208           }
 209           target.setPos3(((java.lang.Long) value).longValue());
 210         } catch (java.lang.Exception ex)
 211         {
 212           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 213         }
 214       }
 215
 216       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 217       {
 218         return null;
 219       }
 220     };
 221     desc.setHandler(handler);
 222     desc.setMultivalued(false);
 223     addFieldDescriptor(desc);
 224
 225     // -- validation code for: _pos3
 226     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 227     { // -- local scope
 228       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;
 229       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();
 230       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 231     }
 232     desc.setValidator(fieldValidator);
 233     // -- initialize element descriptors
 234
 235   }
 236
 237   // -----------/
 238   // - Methods -/
 239   // -----------/
 240
 241   /**
 242    * Method getAccessMode.
 243    *
 244    * @return the access mode specified for this class.
 245    */
 246   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 247   {
 248     return null;
 249   }
 250
 251   /**
 252    * Method getIdentity.
 253    *
 254    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 255    */
 256   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 257   {
 258     return super.getIdentity();
 259   }
 260
 261   /**
 262    * Method getJavaClass.
 263    *
 264    * @return the Java class represented by this descriptor.
 265    */
 266   public java.lang.Class getJavaClass()
 267   {
 268     return jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class;
 269   }
 270
 271   /**
 272    * Method getNameSpacePrefix.
 273    *
 274    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 275    */
 276   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 277   {
 278     return _nsPrefix;
 279   }
 280
 281   /**
 282    * Method getNameSpaceURI.
 283    *
 284    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 285    */
 286   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 287   {
 288     return _nsURI;
 289   }
 290
 291   /**
 292    * Method getValidator.
 293    *
 294    * @return a specific validator for the class described by this
 295    *         ClassDescriptor.
 296    */
 297   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 298   {
 299     return this;
 300   }
 301
 302   /**
 303    * Method getXMLName.
 304    *
 305    * @return the XML Name for the Class being described.
 306    */
 307   public java.lang.String getXMLName()
 308   {
 309     return _xmlName;
 310   }
 311
 312   /**
 313    * Method isElementDefinition.
 314    *
 315    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 316    *         element or element with anonymous type definition.
 317    */
 318   public boolean isElementDefinition()
 319   {
 320     return _elementDefinition;
 321   }
 322
 323 }