src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  19 \r
  20 //---------------------------------/\r
  21 //- Imported classes and packages -/\r
  22 //---------------------------------/\r
  23 \r
  24 import jalview.schemabinding.version2.Alcodon;\r
  25 \r
  26 /**\r
  27  * Class AlcodonDescriptor.\r
  28  * \r
  29  * @version $Revision$ $Date$\r
  30  */\r
  31 public class AlcodonDescriptor extends\r
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  33 {\r
  34 \r
  35   // --------------------------/\r
  36   // - Class/Member Variables -/\r
  37   // --------------------------/\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field _elementDefinition.\r
  41    */\r
  42   private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field _nsPrefix.\r
  46    */\r
  47   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49   /**\r
  50    * Field _nsURI.\r
  51    */\r
  52   private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54   /**\r
  55    * Field _xmlName.\r
  56    */\r
  57   private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59   // ----------------/\r
  60   // - Constructors -/\r
  61   // ----------------/\r
  62 \r
  63   public AlcodonDescriptor()\r
  64   {\r
  65     super();\r
  66     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  67     _xmlName = "alcodon";\r
  68     _elementDefinition = true;\r
  69     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  70     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  71     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  72     // -- initialize attribute descriptors\r
  73 \r
  74     // -- _pos1\r
  75     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  76             java.lang.Long.TYPE, "_pos1", "pos1",\r
  77             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  78     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  79     {\r
  80       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  81               throws IllegalStateException\r
  82       {\r
  83         Alcodon target = (Alcodon) object;\r
  84         if (!target.hasPos1())\r
  85         {\r
  86           return null;\r
  87         }\r
  88         return new java.lang.Long(target.getPos1());\r
  89       }\r
  90 \r
  91       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  92               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  93       {\r
  94         try\r
  95         {\r
  96           Alcodon target = (Alcodon) object;\r
  97           // if null, use delete method for optional primitives\r
  98           if (value == null)\r
  99           {\r
 100             target.deletePos1();\r
 101             return;\r
 102           }\r
 103           target.setPos1(((java.lang.Long) value).longValue());\r
 104         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 105         {\r
 106           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 107         }\r
 108       }\r
 109 \r
 110       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 111       {\r
 112         return null;\r
 113       }\r
 114     };\r
 115     desc.setHandler(handler);\r
 116     desc.setMultivalued(false);\r
 117     addFieldDescriptor(desc);\r
 118 \r
 119     // -- validation code for: _pos1\r
 120     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 121     { // -- local scope\r
 122       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 123       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 124       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 125     }\r
 126     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 127     // -- _pos2\r
 128     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 129             java.lang.Long.TYPE, "_pos2", "pos2",\r
 130             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 131     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 132     {\r
 133       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 134               throws IllegalStateException\r
 135       {\r
 136         Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 137         if (!target.hasPos2())\r
 138         {\r
 139           return null;\r
 140         }\r
 141         return new java.lang.Long(target.getPos2());\r
 142       }\r
 143 \r
 144       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 145               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 146       {\r
 147         try\r
 148         {\r
 149           Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 150           // if null, use delete method for optional primitives\r
 151           if (value == null)\r
 152           {\r
 153             target.deletePos2();\r
 154             return;\r
 155           }\r
 156           target.setPos2(((java.lang.Long) value).longValue());\r
 157         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 158         {\r
 159           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 160         }\r
 161       }\r
 162 \r
 163       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 164       {\r
 165         return null;\r
 166       }\r
 167     };\r
 168     desc.setHandler(handler);\r
 169     desc.setMultivalued(false);\r
 170     addFieldDescriptor(desc);\r
 171 \r
 172     // -- validation code for: _pos2\r
 173     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 174     { // -- local scope\r
 175       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 176       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 177       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 178     }\r
 179     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 180     // -- _pos3\r
 181     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 182             java.lang.Long.TYPE, "_pos3", "pos3",\r
 183             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 184     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 185     {\r
 186       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 187               throws IllegalStateException\r
 188       {\r
 189         Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 190         if (!target.hasPos3())\r
 191         {\r
 192           return null;\r
 193         }\r
 194         return new java.lang.Long(target.getPos3());\r
 195       }\r
 196 \r
 197       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 198               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 199       {\r
 200         try\r
 201         {\r
 202           Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 203           // if null, use delete method for optional primitives\r
 204           if (value == null)\r
 205           {\r
 206             target.deletePos3();\r
 207             return;\r
 208           }\r
 209           target.setPos3(((java.lang.Long) value).longValue());\r
 210         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 211         {\r
 212           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 213         }\r
 214       }\r
 215 \r
 216       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 217       {\r
 218         return null;\r
 219       }\r
 220     };\r
 221     desc.setHandler(handler);\r
 222     desc.setMultivalued(false);\r
 223     addFieldDescriptor(desc);\r
 224 \r
 225     // -- validation code for: _pos3\r
 226     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 227     { // -- local scope\r
 228       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 229       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 230       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 231     }\r
 232     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 233     // -- initialize element descriptors\r
 234 \r
 235   }\r
 236 \r
 237   // -----------/\r
 238   // - Methods -/\r
 239   // -----------/\r
 240 \r
 241   /**\r
 242    * Method getAccessMode.\r
 243    * \r
 244    * @return the access mode specified for this class.\r
 245    */\r
 246   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 247   {\r
 248     return null;\r
 249   }\r
 250 \r
 251   /**\r
 252    * Method getIdentity.\r
 253    * \r
 254    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 255    */\r
 256   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 257   {\r
 258     return super.getIdentity();\r
 259   }\r
 260 \r
 261   /**\r
 262    * Method getJavaClass.\r
 263    * \r
 264    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 265    */\r
 266   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 267   {\r
 268     return jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class;\r
 269   }\r
 270 \r
 271   /**\r
 272    * Method getNameSpacePrefix.\r
 273    * \r
 274    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 275    */\r
 276   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 277   {\r
 278     return _nsPrefix;\r
 279   }\r
 280 \r
 281   /**\r
 282    * Method getNameSpaceURI.\r
 283    * \r
 284    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 285    */\r
 286   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 287   {\r
 288     return _nsURI;\r
 289   }\r
 290 \r
 291   /**\r
 292    * Method getValidator.\r
 293    * \r
 294    * @return a specific validator for the class described by this\r
 295    *         ClassDescriptor.\r
 296    */\r
 297   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 298   {\r
 299     return this;\r
 300   }\r
 301 \r
 302   /**\r
 303    * Method getXMLName.\r
 304    * \r
 305    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 306    */\r
 307   public java.lang.String getXMLName()\r
 308   {\r
 309     return _xmlName;\r
 310   }\r
 311 \r
 312   /**\r
 313    * Method isElementDefinition.\r
 314    * \r
 315    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 316    *         element or element with anonymous type definition.\r
 317    */\r
 318   public boolean isElementDefinition()\r
 319   {\r
 320     return _elementDefinition;\r
 321   }\r
 322 \r
 323 }\r