src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonFrameDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  19 \r
  20 //---------------------------------/\r
  21 //- Imported classes and packages -/\r
  22 //---------------------------------/\r
  23 \r
  24 import jalview.schemabinding.version2.AlcodonFrame;\r
  25 \r
  26 /**\r
  27  * Class AlcodonFrameDescriptor.\r
  28  * \r
  29  * @version $Revision$ $Date$\r
  30  */\r
  31 public class AlcodonFrameDescriptor extends\r
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  33 {\r
  34 \r
  35   // --------------------------/\r
  36   // - Class/Member Variables -/\r
  37   // --------------------------/\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field _elementDefinition.\r
  41    */\r
  42   private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field _nsPrefix.\r
  46    */\r
  47   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49   /**\r
  50    * Field _nsURI.\r
  51    */\r
  52   private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54   /**\r
  55    * Field _xmlName.\r
  56    */\r
  57   private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59   // ----------------/\r
  60   // - Constructors -/\r
  61   // ----------------/\r
  62 \r
  63   public AlcodonFrameDescriptor()\r
  64   {\r
  65     super();\r
  66     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  67     _xmlName = "AlcodonFrame";\r
  68     _elementDefinition = true;\r
  69 \r
  70     // -- set grouping compositor\r
  71     setCompositorAsSequence();\r
  72     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  73     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  74     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  75     // -- initialize attribute descriptors\r
  76 \r
  77     // -- initialize element descriptors\r
  78 \r
  79     // -- _alcodonList\r
  80     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  81             jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class, "_alcodonList",\r
  82             "alcodon", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
  83     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  84     {\r
  85       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  86               throws IllegalStateException\r
  87       {\r
  88         AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
  89         return target.getAlcodon();\r
  90       }\r
  91 \r
  92       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  93               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  94       {\r
  95         try\r
  96         {\r
  97           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
  98           target.addAlcodon((jalview.schemabinding.version2.Alcodon) value);\r
  99         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 100         {\r
 101           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 102         }\r
 103       }\r
 104 \r
 105       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,\r
 106               IllegalArgumentException\r
 107       {\r
 108         try\r
 109         {\r
 110           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 111           target.removeAllAlcodon();\r
 112         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 113         {\r
 114           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 115         }\r
 116       }\r
 117 \r
 118       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 119       {\r
 120         return new jalview.schemabinding.version2.Alcodon();\r
 121       }\r
 122     };\r
 123     desc.setHandler(handler);\r
 124     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 125     desc.setMultivalued(true);\r
 126     addFieldDescriptor(desc);\r
 127 \r
 128     // -- validation code for: _alcodonList\r
 129     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 130     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 131     { // -- local scope\r
 132     }\r
 133     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 134     // -- _alcodMapList\r
 135     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 136             jalview.schemabinding.version2.AlcodMap.class, "_alcodMapList",\r
 137             "alcodMap", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 138     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 139     {\r
 140       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 141               throws IllegalStateException\r
 142       {\r
 143         AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 144         return target.getAlcodMap();\r
 145       }\r
 146 \r
 147       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 148               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 149       {\r
 150         try\r
 151         {\r
 152           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 153           target\r
 154                   .addAlcodMap((jalview.schemabinding.version2.AlcodMap) value);\r
 155         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 156         {\r
 157           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 158         }\r
 159       }\r
 160 \r
 161       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,\r
 162               IllegalArgumentException\r
 163       {\r
 164         try\r
 165         {\r
 166           AlcodonFrame target = (AlcodonFrame) object;\r
 167           target.removeAllAlcodMap();\r
 168         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 169         {\r
 170           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 171         }\r
 172       }\r
 173 \r
 174       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 175       {\r
 176         return new jalview.schemabinding.version2.AlcodMap();\r
 177       }\r
 178     };\r
 179     desc.setHandler(handler);\r
 180     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 181     desc.setMultivalued(true);\r
 182     addFieldDescriptor(desc);\r
 183 \r
 184     // -- validation code for: _alcodMapList\r
 185     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 186     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 187     { // -- local scope\r
 188     }\r
 189     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 190   }\r
 191 \r
 192   // -----------/\r
 193   // - Methods -/\r
 194   // -----------/\r
 195 \r
 196   /**\r
 197    * Method getAccessMode.\r
 198    * \r
 199    * @return the access mode specified for this class.\r
 200    */\r
 201   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 202   {\r
 203     return null;\r
 204   }\r
 205 \r
 206   /**\r
 207    * Method getIdentity.\r
 208    * \r
 209    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 210    */\r
 211   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 212   {\r
 213     return super.getIdentity();\r
 214   }\r
 215 \r
 216   /**\r
 217    * Method getJavaClass.\r
 218    * \r
 219    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 220    */\r
 221   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 222   {\r
 223     return jalview.schemabinding.version2.AlcodonFrame.class;\r
 224   }\r
 225 \r
 226   /**\r
 227    * Method getNameSpacePrefix.\r
 228    * \r
 229    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 230    */\r
 231   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 232   {\r
 233     return _nsPrefix;\r
 234   }\r
 235 \r
 236   /**\r
 237    * Method getNameSpaceURI.\r
 238    * \r
 239    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 240    */\r
 241   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 242   {\r
 243     return _nsURI;\r
 244   }\r
 245 \r
 246   /**\r
 247    * Method getValidator.\r
 248    * \r
 249    * @return a specific validator for the class described by this\r
 250    *         ClassDescriptor.\r
 251    */\r
 252   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 253   {\r
 254     return this;\r
 255   }\r
 256 \r
 257   /**\r
 258    * Method getXMLName.\r
 259    * \r
 260    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 261    */\r
 262   public java.lang.String getXMLName()\r
 263   {\r
 264     return _xmlName;\r
 265   }\r
 266 \r
 267   /**\r
 268    * Method isElementDefinition.\r
 269    * \r
 270    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 271    *         element or element with anonymous type definition.\r
 272    */\r
 273   public boolean isElementDefinition()\r
 274   {\r
 275     return _elementDefinition;\r
 276   }\r
 277 \r
 278 }\r