src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationColoursDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  19 \r
  20 //---------------------------------/\r
  21 //- Imported classes and packages -/\r
  22 //---------------------------------/\r
  23 \r
  24 import jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours;\r
  25 \r
  26 /**\r
  27  * Class AnnotationColoursDescriptor.\r
  28  * \r
  29  * @version $Revision$ $Date$\r
  30  */\r
  31 public class AnnotationColoursDescriptor extends\r
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  33 {\r
  34 \r
  35   // --------------------------/\r
  36   // - Class/Member Variables -/\r
  37   // --------------------------/\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field _elementDefinition.\r
  41    */\r
  42   private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field _nsPrefix.\r
  46    */\r
  47   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49   /**\r
  50    * Field _nsURI.\r
  51    */\r
  52   private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54   /**\r
  55    * Field _xmlName.\r
  56    */\r
  57   private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59   // ----------------/\r
  60   // - Constructors -/\r
  61   // ----------------/\r
  62 \r
  63   public AnnotationColoursDescriptor()\r
  64   {\r
  65     super();\r
  66     _nsURI = "www.jalview.org";\r
  67     _xmlName = "AnnotationColours";\r
  68     _elementDefinition = true;\r
  69     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  70     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  71     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  72     // -- initialize attribute descriptors\r
  73 \r
  74     // -- _aboveThreshold\r
  75     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  76             java.lang.Integer.TYPE, "_aboveThreshold", "aboveThreshold",\r
  77             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  78     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  79     {\r
  80       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  81               throws IllegalStateException\r
  82       {\r
  83         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
  84         if (!target.hasAboveThreshold())\r
  85         {\r
  86           return null;\r
  87         }\r
  88         return new java.lang.Integer(target.getAboveThreshold());\r
  89       }\r
  90 \r
  91       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  92               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  93       {\r
  94         try\r
  95         {\r
  96           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
  97           // if null, use delete method for optional primitives\r
  98           if (value == null)\r
  99           {\r
 100             target.deleteAboveThreshold();\r
 101             return;\r
 102           }\r
 103           target.setAboveThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 104         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 105         {\r
 106           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 107         }\r
 108       }\r
 109 \r
 110       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 111       {\r
 112         return null;\r
 113       }\r
 114     };\r
 115     desc.setHandler(handler);\r
 116     desc.setMultivalued(false);\r
 117     addFieldDescriptor(desc);\r
 118 \r
 119     // -- validation code for: _aboveThreshold\r
 120     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 121     { // -- local scope\r
 122       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 123       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 124       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 125       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 126       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 127     }\r
 128     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 129     // -- _annotation\r
 130     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 131             java.lang.String.class, "_annotation", "annotation",\r
 132             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 133     desc.setImmutable(true);\r
 134     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 135     {\r
 136       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 137               throws IllegalStateException\r
 138       {\r
 139         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 140         return target.getAnnotation();\r
 141       }\r
 142 \r
 143       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 144               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 145       {\r
 146         try\r
 147         {\r
 148           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 149           target.setAnnotation((java.lang.String) value);\r
 150         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 151         {\r
 152           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 153         }\r
 154       }\r
 155 \r
 156       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 157       {\r
 158         return null;\r
 159       }\r
 160     };\r
 161     desc.setHandler(handler);\r
 162     desc.setMultivalued(false);\r
 163     addFieldDescriptor(desc);\r
 164 \r
 165     // -- validation code for: _annotation\r
 166     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 167     { // -- local scope\r
 168       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 169       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 170       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 171       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 172     }\r
 173     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 174     // -- _minColour\r
 175     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 176             java.lang.Integer.TYPE, "_minColour", "minColour",\r
 177             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 178     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 179     {\r
 180       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 181               throws IllegalStateException\r
 182       {\r
 183         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 184         if (!target.hasMinColour())\r
 185         {\r
 186           return null;\r
 187         }\r
 188         return new java.lang.Integer(target.getMinColour());\r
 189       }\r
 190 \r
 191       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 192               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 193       {\r
 194         try\r
 195         {\r
 196           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 197           // if null, use delete method for optional primitives\r
 198           if (value == null)\r
 199           {\r
 200             target.deleteMinColour();\r
 201             return;\r
 202           }\r
 203           target.setMinColour(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 204         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 205         {\r
 206           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 207         }\r
 208       }\r
 209 \r
 210       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 211       {\r
 212         return null;\r
 213       }\r
 214     };\r
 215     desc.setHandler(handler);\r
 216     desc.setMultivalued(false);\r
 217     addFieldDescriptor(desc);\r
 218 \r
 219     // -- validation code for: _minColour\r
 220     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 221     { // -- local scope\r
 222       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 223       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 224       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 225       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 226       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 227     }\r
 228     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 229     // -- _maxColour\r
 230     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 231             java.lang.Integer.TYPE, "_maxColour", "maxColour",\r
 232             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 233     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 234     {\r
 235       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 236               throws IllegalStateException\r
 237       {\r
 238         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 239         if (!target.hasMaxColour())\r
 240         {\r
 241           return null;\r
 242         }\r
 243         return new java.lang.Integer(target.getMaxColour());\r
 244       }\r
 245 \r
 246       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 247               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 248       {\r
 249         try\r
 250         {\r
 251           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 252           // if null, use delete method for optional primitives\r
 253           if (value == null)\r
 254           {\r
 255             target.deleteMaxColour();\r
 256             return;\r
 257           }\r
 258           target.setMaxColour(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 259         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 260         {\r
 261           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 262         }\r
 263       }\r
 264 \r
 265       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 266       {\r
 267         return null;\r
 268       }\r
 269     };\r
 270     desc.setHandler(handler);\r
 271     desc.setMultivalued(false);\r
 272     addFieldDescriptor(desc);\r
 273 \r
 274     // -- validation code for: _maxColour\r
 275     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 276     { // -- local scope\r
 277       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 278       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 279       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 280       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 281       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 282     }\r
 283     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 284     // -- _colourScheme\r
 285     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 286             java.lang.String.class, "_colourScheme", "colourScheme",\r
 287             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 288     desc.setImmutable(true);\r
 289     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 290     {\r
 291       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 292               throws IllegalStateException\r
 293       {\r
 294         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 295         return target.getColourScheme();\r
 296       }\r
 297 \r
 298       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 299               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 300       {\r
 301         try\r
 302         {\r
 303           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 304           target.setColourScheme((java.lang.String) value);\r
 305         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 306         {\r
 307           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 308         }\r
 309       }\r
 310 \r
 311       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 312       {\r
 313         return null;\r
 314       }\r
 315     };\r
 316     desc.setHandler(handler);\r
 317     desc.setMultivalued(false);\r
 318     addFieldDescriptor(desc);\r
 319 \r
 320     // -- validation code for: _colourScheme\r
 321     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 322     { // -- local scope\r
 323       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 324       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 325       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 326       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 327     }\r
 328     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 329     // -- _threshold\r
 330     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 331             java.lang.Float.TYPE, "_threshold", "threshold",\r
 332             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 333     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 334     {\r
 335       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 336               throws IllegalStateException\r
 337       {\r
 338         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 339         if (!target.hasThreshold())\r
 340         {\r
 341           return null;\r
 342         }\r
 343         return new java.lang.Float(target.getThreshold());\r
 344       }\r
 345 \r
 346       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 347               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 348       {\r
 349         try\r
 350         {\r
 351           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 352           // if null, use delete method for optional primitives\r
 353           if (value == null)\r
 354           {\r
 355             target.deleteThreshold();\r
 356             return;\r
 357           }\r
 358           target.setThreshold(((java.lang.Float) value).floatValue());\r
 359         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 360         {\r
 361           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 362         }\r
 363       }\r
 364 \r
 365       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 366       {\r
 367         return null;\r
 368       }\r
 369     };\r
 370     desc.setHandler(handler);\r
 371     desc.setMultivalued(false);\r
 372     addFieldDescriptor(desc);\r
 373 \r
 374     // -- validation code for: _threshold\r
 375     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 376     { // -- local scope\r
 377       org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;\r
 378       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();\r
 379       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 380       typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);\r
 381       typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);\r
 382     }\r
 383     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 384     // -- initialize element descriptors\r
 385 \r
 386   }\r
 387 \r
 388   // -----------/\r
 389   // - Methods -/\r
 390   // -----------/\r
 391 \r
 392   /**\r
 393    * Method getAccessMode.\r
 394    * \r
 395    * @return the access mode specified for this class.\r
 396    */\r
 397   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 398   {\r
 399     return null;\r
 400   }\r
 401 \r
 402   /**\r
 403    * Method getIdentity.\r
 404    * \r
 405    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 406    */\r
 407   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 408   {\r
 409     return super.getIdentity();\r
 410   }\r
 411 \r
 412   /**\r
 413    * Method getJavaClass.\r
 414    * \r
 415    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 416    */\r
 417   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 418   {\r
 419     return jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours.class;\r
 420   }\r
 421 \r
 422   /**\r
 423    * Method getNameSpacePrefix.\r
 424    * \r
 425    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 426    */\r
 427   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 428   {\r
 429     return _nsPrefix;\r
 430   }\r
 431 \r
 432   /**\r
 433    * Method getNameSpaceURI.\r
 434    * \r
 435    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 436    */\r
 437   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 438   {\r
 439     return _nsURI;\r
 440   }\r
 441 \r
 442   /**\r
 443    * Method getValidator.\r
 444    * \r
 445    * @return a specific validator for the class described by this\r
 446    *         ClassDescriptor.\r
 447    */\r
 448   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 449   {\r
 450     return this;\r
 451   }\r
 452 \r
 453   /**\r
 454    * Method getXMLName.\r
 455    * \r
 456    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 457    */\r
 458   public java.lang.String getXMLName()\r
 459   {\r
 460     return _xmlName;\r
 461   }\r
 462 \r
 463   /**\r
 464    * Method isElementDefinition.\r
 465    * \r
 466    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 467    *         element or element with anonymous type definition.\r
 468    */\r
 469   public boolean isElementDefinition()\r
 470   {\r
 471     return _elementDefinition;\r
 472   }\r
 473 \r
 474 }\r