src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationColoursDescriptor.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  19
  20 //---------------------------------/
  21 //- Imported classes and packages -/
  22 //---------------------------------/
  23
  24 import jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours;
  25
  26 /**
  27  * Class AnnotationColoursDescriptor.
  28  *
  29  * @version $Revision$ $Date$
  30  */
  31 public class AnnotationColoursDescriptor extends
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  33 {
  34
  35   // --------------------------/
  36   // - Class/Member Variables -/
  37   // --------------------------/
  38
  39   /**
  40    * Field _elementDefinition.
  41    */
  42   private boolean _elementDefinition;
  43
  44   /**
  45    * Field _nsPrefix.
  46    */
  47   private java.lang.String _nsPrefix;
  48
  49   /**
  50    * Field _nsURI.
  51    */
  52   private java.lang.String _nsURI;
  53
  54   /**
  55    * Field _xmlName.
  56    */
  57   private java.lang.String _xmlName;
  58
  59   // ----------------/
  60   // - Constructors -/
  61   // ----------------/
  62
  63   public AnnotationColoursDescriptor()
  64   {
  65     super();
  66     _nsURI = "www.jalview.org";
  67     _xmlName = "AnnotationColours";
  68     _elementDefinition = true;
  69     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  70     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  71     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  72     // -- initialize attribute descriptors
  73
  74     // -- _aboveThreshold
  75     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  76             java.lang.Integer.TYPE, "_aboveThreshold", "aboveThreshold",
  77             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  78     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  79     {
  80       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  81               throws IllegalStateException
  82       {
  83         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
  84         if (!target.hasAboveThreshold())
  85         {
  86           return null;
  87         }
  88         return new java.lang.Integer(target.getAboveThreshold());
  89       }
  90
  91       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  92               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  93       {
  94         try
  95         {
  96           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
  97           // if null, use delete method for optional primitives
  98           if (value == null)
  99           {
 100             target.deleteAboveThreshold();
 101             return;
 102           }
 103           target.setAboveThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());
 104         } catch (java.lang.Exception ex)
 105         {
 106           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 107         }
 108       }
 109
 110       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 111       {
 112         return null;
 113       }
 114     };
 115     desc.setHandler(handler);
 116     desc.setMultivalued(false);
 117     addFieldDescriptor(desc);
 118
 119     // -- validation code for: _aboveThreshold
 120     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 121     { // -- local scope
 122       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 123       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 124       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 125       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 126       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 127     }
 128     desc.setValidator(fieldValidator);
 129     // -- _annotation
 130     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 131             java.lang.String.class, "_annotation", "annotation",
 132             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 133     desc.setImmutable(true);
 134     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 135     {
 136       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 137               throws IllegalStateException
 138       {
 139         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 140         return target.getAnnotation();
 141       }
 142
 143       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 144               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 145       {
 146         try
 147         {
 148           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 149           target.setAnnotation((java.lang.String) value);
 150         } catch (java.lang.Exception ex)
 151         {
 152           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 153         }
 154       }
 155
 156       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 157       {
 158         return null;
 159       }
 160     };
 161     desc.setHandler(handler);
 162     desc.setMultivalued(false);
 163     addFieldDescriptor(desc);
 164
 165     // -- validation code for: _annotation
 166     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 167     { // -- local scope
 168       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 169       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 170       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 171       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 172     }
 173     desc.setValidator(fieldValidator);
 174     // -- _minColour
 175     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 176             java.lang.Integer.TYPE, "_minColour", "minColour",
 177             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 178     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 179     {
 180       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 181               throws IllegalStateException
 182       {
 183         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 184         if (!target.hasMinColour())
 185         {
 186           return null;
 187         }
 188         return new java.lang.Integer(target.getMinColour());
 189       }
 190
 191       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 192               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 193       {
 194         try
 195         {
 196           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 197           // if null, use delete method for optional primitives
 198           if (value == null)
 199           {
 200             target.deleteMinColour();
 201             return;
 202           }
 203           target.setMinColour(((java.lang.Integer) value).intValue());
 204         } catch (java.lang.Exception ex)
 205         {
 206           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 207         }
 208       }
 209
 210       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 211       {
 212         return null;
 213       }
 214     };
 215     desc.setHandler(handler);
 216     desc.setMultivalued(false);
 217     addFieldDescriptor(desc);
 218
 219     // -- validation code for: _minColour
 220     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 221     { // -- local scope
 222       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 223       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 224       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 225       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 226       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 227     }
 228     desc.setValidator(fieldValidator);
 229     // -- _maxColour
 230     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 231             java.lang.Integer.TYPE, "_maxColour", "maxColour",
 232             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 233     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 234     {
 235       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 236               throws IllegalStateException
 237       {
 238         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 239         if (!target.hasMaxColour())
 240         {
 241           return null;
 242         }
 243         return new java.lang.Integer(target.getMaxColour());
 244       }
 245
 246       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 247               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 248       {
 249         try
 250         {
 251           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 252           // if null, use delete method for optional primitives
 253           if (value == null)
 254           {
 255             target.deleteMaxColour();
 256             return;
 257           }
 258           target.setMaxColour(((java.lang.Integer) value).intValue());
 259         } catch (java.lang.Exception ex)
 260         {
 261           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 262         }
 263       }
 264
 265       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 266       {
 267         return null;
 268       }
 269     };
 270     desc.setHandler(handler);
 271     desc.setMultivalued(false);
 272     addFieldDescriptor(desc);
 273
 274     // -- validation code for: _maxColour
 275     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 276     { // -- local scope
 277       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 278       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 279       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 280       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 281       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 282     }
 283     desc.setValidator(fieldValidator);
 284     // -- _colourScheme
 285     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 286             java.lang.String.class, "_colourScheme", "colourScheme",
 287             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 288     desc.setImmutable(true);
 289     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 290     {
 291       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 292               throws IllegalStateException
 293       {
 294         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 295         return target.getColourScheme();
 296       }
 297
 298       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 299               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 300       {
 301         try
 302         {
 303           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 304           target.setColourScheme((java.lang.String) value);
 305         } catch (java.lang.Exception ex)
 306         {
 307           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 308         }
 309       }
 310
 311       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 312       {
 313         return null;
 314       }
 315     };
 316     desc.setHandler(handler);
 317     desc.setMultivalued(false);
 318     addFieldDescriptor(desc);
 319
 320     // -- validation code for: _colourScheme
 321     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 322     { // -- local scope
 323       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 324       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 325       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 326       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 327     }
 328     desc.setValidator(fieldValidator);
 329     // -- _threshold
 330     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 331             java.lang.Float.TYPE, "_threshold", "threshold",
 332             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 333     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 334     {
 335       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 336               throws IllegalStateException
 337       {
 338         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 339         if (!target.hasThreshold())
 340         {
 341           return null;
 342         }
 343         return new java.lang.Float(target.getThreshold());
 344       }
 345
 346       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 347               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 348       {
 349         try
 350         {
 351           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;
 352           // if null, use delete method for optional primitives
 353           if (value == null)
 354           {
 355             target.deleteThreshold();
 356             return;
 357           }
 358           target.setThreshold(((java.lang.Float) value).floatValue());
 359         } catch (java.lang.Exception ex)
 360         {
 361           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 362         }
 363       }
 364
 365       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 366       {
 367         return null;
 368       }
 369     };
 370     desc.setHandler(handler);
 371     desc.setMultivalued(false);
 372     addFieldDescriptor(desc);
 373
 374     // -- validation code for: _threshold
 375     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 376     { // -- local scope
 377       org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;
 378       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();
 379       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 380       typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);
 381       typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);
 382     }
 383     desc.setValidator(fieldValidator);
 384     // -- initialize element descriptors
 385
 386   }
 387
 388   // -----------/
 389   // - Methods -/
 390   // -----------/
 391
 392   /**
 393    * Method getAccessMode.
 394    *
 395    * @return the access mode specified for this class.
 396    */
 397   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 398   {
 399     return null;
 400   }
 401
 402   /**
 403    * Method getIdentity.
 404    *
 405    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 406    */
 407   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 408   {
 409     return super.getIdentity();
 410   }
 411
 412   /**
 413    * Method getJavaClass.
 414    *
 415    * @return the Java class represented by this descriptor.
 416    */
 417   public java.lang.Class getJavaClass()
 418   {
 419     return jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours.class;
 420   }
 421
 422   /**
 423    * Method getNameSpacePrefix.
 424    *
 425    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 426    */
 427   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 428   {
 429     return _nsPrefix;
 430   }
 431
 432   /**
 433    * Method getNameSpaceURI.
 434    *
 435    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 436    */
 437   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 438   {
 439     return _nsURI;
 440   }
 441
 442   /**
 443    * Method getValidator.
 444    *
 445    * @return a specific validator for the class described by this
 446    *         ClassDescriptor.
 447    */
 448   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 449   {
 450     return this;
 451   }
 452
 453   /**
 454    * Method getXMLName.
 455    *
 456    * @return the XML Name for the Class being described.
 457    */
 458   public java.lang.String getXMLName()
 459   {
 460     return _xmlName;
 461   }
 462
 463   /**
 464    * Method isElementDefinition.
 465    *
 466    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 467    *         element or element with anonymous type definition.
 468    */
 469   public boolean isElementDefinition()
 470   {
 471     return _elementDefinition;
 472   }
 473
 474 }