src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import jalview.schemabinding.version2.Annotation;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class AnnotationDescriptor.\r
  18  * \r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class AnnotationDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  22 \r
  23 \r
  24       //--------------------------/\r
  25      //- Class/Member Variables -/\r
  26     //--------------------------/\r
  27 \r
  28     /**\r
  29      * Field _elementDefinition.\r
  30      */\r
  31     private boolean _elementDefinition;\r
  32 \r
  33     /**\r
  34      * Field _nsPrefix.\r
  35      */\r
  36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  37 \r
  38     /**\r
  39      * Field _nsURI.\r
  40      */\r
  41     private java.lang.String _nsURI;\r
  42 \r
  43     /**\r
  44      * Field _xmlName.\r
  45      */\r
  46     private java.lang.String _xmlName;\r
  47 \r
  48 \r
  49       //----------------/\r
  50      //- Constructors -/\r
  51     //----------------/\r
  52 \r
  53     public AnnotationDescriptor() {\r
  54         super();\r
  55         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  56         _xmlName = "Annotation";\r
  57         _elementDefinition = true;\r
  58         \r
  59         //-- set grouping compositor\r
  60         setCompositorAsSequence();\r
  61         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  62         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  63         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  64         //-- initialize attribute descriptors\r
  65         \r
  66         //-- _graph\r
  67         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  68         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  69             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  70                 throws IllegalStateException\r
  71             {\r
  72                 Annotation target = (Annotation) object;\r
  73                 if (!target.hasGraph()) { return null; }\r
  74                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
  75             }\r
  76             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  77                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  78             {\r
  79                 try {\r
  80                     Annotation target = (Annotation) object;\r
  81                     // ignore null values for non optional primitives\r
  82                     if (value == null) { return; }\r
  83                     \r
  84                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
  85                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  86                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  87                 }\r
  88             }\r
  89             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
  90                 return null;\r
  91             }\r
  92         };\r
  93         desc.setHandler(handler);\r
  94         desc.setRequired(true);\r
  95         desc.setMultivalued(false);\r
  96         addFieldDescriptor(desc);\r
  97         \r
  98         //-- validation code for: _graph\r
  99         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 100         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 101         { //-- local scope\r
 102             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 103             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 104             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 105         }\r
 106         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 107         //-- _graphType\r
 108         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_graphType", "graphType", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 109         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 110             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 111                 throws IllegalStateException\r
 112             {\r
 113                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 114                 if (!target.hasGraphType()) { return null; }\r
 115                 return new java.lang.Integer(target.getGraphType());\r
 116             }\r
 117             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 118                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 119             {\r
 120                 try {\r
 121                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 122                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 123                     if (value == null) {\r
 124                         target.deleteGraphType();\r
 125                         return;\r
 126                     }\r
 127                     target.setGraphType( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 128                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 129                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 130                 }\r
 131             }\r
 132             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 133                 return null;\r
 134             }\r
 135         };\r
 136         desc.setHandler(handler);\r
 137         desc.setMultivalued(false);\r
 138         addFieldDescriptor(desc);\r
 139         \r
 140         //-- validation code for: _graphType\r
 141         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 142         { //-- local scope\r
 143             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 144             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 145             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 146             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 147             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 148         }\r
 149         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 150         //-- _sequenceRef\r
 151         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_sequenceRef", "sequenceRef", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 152         desc.setImmutable(true);\r
 153         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 154             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 155                 throws IllegalStateException\r
 156             {\r
 157                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 158                 return target.getSequenceRef();\r
 159             }\r
 160             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 161                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 162             {\r
 163                 try {\r
 164                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 165                     target.setSequenceRef( (java.lang.String) value);\r
 166                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 167                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 168                 }\r
 169             }\r
 170             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 171                 return null;\r
 172             }\r
 173         };\r
 174         desc.setHandler(handler);\r
 175         desc.setMultivalued(false);\r
 176         addFieldDescriptor(desc);\r
 177         \r
 178         //-- validation code for: _sequenceRef\r
 179         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 180         { //-- local scope\r
 181             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 182             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 183             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 184             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 185         }\r
 186         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 187         //-- _graphColour\r
 188         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_graphColour", "graphColour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 189         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 190             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 191                 throws IllegalStateException\r
 192             {\r
 193                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 194                 if (!target.hasGraphColour()) { return null; }\r
 195                 return new java.lang.Integer(target.getGraphColour());\r
 196             }\r
 197             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 198                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 199             {\r
 200                 try {\r
 201                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 202                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 203                     if (value == null) {\r
 204                         target.deleteGraphColour();\r
 205                         return;\r
 206                     }\r
 207                     target.setGraphColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 208                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 209                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 210                 }\r
 211             }\r
 212             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 213                 return null;\r
 214             }\r
 215         };\r
 216         desc.setHandler(handler);\r
 217         desc.setMultivalued(false);\r
 218         addFieldDescriptor(desc);\r
 219         \r
 220         //-- validation code for: _graphColour\r
 221         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 222         { //-- local scope\r
 223             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 224             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 225             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 226             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 227             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 228         }\r
 229         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 230         //-- _graphGroup\r
 231         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_graphGroup", "graphGroup", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 232         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 233             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 234                 throws IllegalStateException\r
 235             {\r
 236                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 237                 if (!target.hasGraphGroup()) { return null; }\r
 238                 return new java.lang.Integer(target.getGraphGroup());\r
 239             }\r
 240             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 241                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 242             {\r
 243                 try {\r
 244                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 245                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 246                     if (value == null) {\r
 247                         target.deleteGraphGroup();\r
 248                         return;\r
 249                     }\r
 250                     target.setGraphGroup( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 251                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 252                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 253                 }\r
 254             }\r
 255             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 256                 return null;\r
 257             }\r
 258         };\r
 259         desc.setHandler(handler);\r
 260         desc.setMultivalued(false);\r
 261         addFieldDescriptor(desc);\r
 262         \r
 263         //-- validation code for: _graphGroup\r
 264         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 265         { //-- local scope\r
 266             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 267             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 268             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 269             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 270             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 271         }\r
 272         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 273         //-- _id\r
 274         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 275         desc.setImmutable(true);\r
 276         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 277             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 278                 throws IllegalStateException\r
 279             {\r
 280                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 281                 return target.getId();\r
 282             }\r
 283             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 284                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 285             {\r
 286                 try {\r
 287                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 288                     target.setId( (java.lang.String) value);\r
 289                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 290                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 291                 }\r
 292             }\r
 293             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 294                 return null;\r
 295             }\r
 296         };\r
 297         desc.setHandler(handler);\r
 298         desc.setMultivalued(false);\r
 299         addFieldDescriptor(desc);\r
 300         \r
 301         //-- validation code for: _id\r
 302         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 303         { //-- local scope\r
 304             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 305             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 306             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 307             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 308         }\r
 309         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 310         //-- _scoreOnly\r
 311         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_scoreOnly", "scoreOnly", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 312         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 313             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 314                 throws IllegalStateException\r
 315             {\r
 316                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 317                 if (!target.hasScoreOnly()) { return null; }\r
 318                 return (target.getScoreOnly() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 319             }\r
 320             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 321                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 322             {\r
 323                 try {\r
 324                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 325                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 326                     if (value == null) {\r
 327                         target.deleteScoreOnly();\r
 328                         return;\r
 329                     }\r
 330                     target.setScoreOnly( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 331                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 332                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 333                 }\r
 334             }\r
 335             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 336                 return null;\r
 337             }\r
 338         };\r
 339         desc.setHandler(handler);\r
 340         desc.setMultivalued(false);\r
 341         addFieldDescriptor(desc);\r
 342         \r
 343         //-- validation code for: _scoreOnly\r
 344         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 345         { //-- local scope\r
 346             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 347             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 348             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 349         }\r
 350         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 351         //-- _score\r
 352         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Double.TYPE, "_score", "score", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 353         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 354             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 355                 throws IllegalStateException\r
 356             {\r
 357                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 358                 if (!target.hasScore()) { return null; }\r
 359                 return new java.lang.Double(target.getScore());\r
 360             }\r
 361             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 362                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 363             {\r
 364                 try {\r
 365                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 366                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 367                     if (value == null) {\r
 368                         target.deleteScore();\r
 369                         return;\r
 370                     }\r
 371                     target.setScore( ((java.lang.Double) value).doubleValue());\r
 372                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 373                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 374                 }\r
 375             }\r
 376             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 377                 return null;\r
 378             }\r
 379         };\r
 380         desc.setHandler(handler);\r
 381         desc.setMultivalued(false);\r
 382         addFieldDescriptor(desc);\r
 383         \r
 384         //-- validation code for: _score\r
 385         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 386         { //-- local scope\r
 387             org.exolab.castor.xml.validators.DoubleValidator typeValidator;\r
 388             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.DoubleValidator();\r
 389             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 390             typeValidator.setMinInclusive(-1.7976931348623157E308);\r
 391             typeValidator.setMaxInclusive(1.7976931348623157E308);\r
 392         }\r
 393         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 394         //-- _visible\r
 395         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_visible", "visible", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 396         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 397             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 398                 throws IllegalStateException\r
 399             {\r
 400                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 401                 if (!target.hasVisible()) { return null; }\r
 402                 return (target.getVisible() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 403             }\r
 404             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 405                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 406             {\r
 407                 try {\r
 408                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 409                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 410                     if (value == null) {\r
 411                         target.deleteVisible();\r
 412                         return;\r
 413                     }\r
 414                     target.setVisible( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 415                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 416                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 417                 }\r
 418             }\r
 419             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 420                 return null;\r
 421             }\r
 422         };\r
 423         desc.setHandler(handler);\r
 424         desc.setMultivalued(false);\r
 425         addFieldDescriptor(desc);\r
 426         \r
 427         //-- validation code for: _visible\r
 428         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 429         { //-- local scope\r
 430             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 431             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 432             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 433         }\r
 434         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 435         //-- initialize element descriptors\r
 436         \r
 437         //-- _annotationElementList\r
 438         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement.class, "_annotationElementList", "annotationElement", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 439         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 440             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 441                 throws IllegalStateException\r
 442             {\r
 443                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 444                 return target.getAnnotationElement();\r
 445             }\r
 446             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 447                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 448             {\r
 449                 try {\r
 450                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 451                     target.addAnnotationElement( (jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement) value);\r
 452                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 453                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 454                 }\r
 455             }\r
 456             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 457                 try {\r
 458                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 459                     target.removeAllAnnotationElement();\r
 460                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 461                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 462                 }\r
 463             }\r
 464             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 465                 return new jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement();\r
 466             }\r
 467         };\r
 468         desc.setHandler(handler);\r
 469         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 470         desc.setMultivalued(true);\r
 471         addFieldDescriptor(desc);\r
 472         \r
 473         //-- validation code for: _annotationElementList\r
 474         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 475         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 476         { //-- local scope\r
 477         }\r
 478         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 479         //-- _label\r
 480         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_label", "label", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 481         desc.setImmutable(true);\r
 482         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 483             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 484                 throws IllegalStateException\r
 485             {\r
 486                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 487                 return target.getLabel();\r
 488             }\r
 489             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 490                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 491             {\r
 492                 try {\r
 493                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 494                     target.setLabel( (java.lang.String) value);\r
 495                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 496                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 497                 }\r
 498             }\r
 499             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 500                 return null;\r
 501             }\r
 502         };\r
 503         desc.setHandler(handler);\r
 504         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 505         desc.setRequired(true);\r
 506         desc.setMultivalued(false);\r
 507         addFieldDescriptor(desc);\r
 508         \r
 509         //-- validation code for: _label\r
 510         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 511         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 512         { //-- local scope\r
 513             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 514             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 515             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 516             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 517         }\r
 518         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 519         //-- _description\r
 520         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 521         desc.setImmutable(true);\r
 522         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 523             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 524                 throws IllegalStateException\r
 525             {\r
 526                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 527                 return target.getDescription();\r
 528             }\r
 529             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 530                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 531             {\r
 532                 try {\r
 533                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 534                     target.setDescription( (java.lang.String) value);\r
 535                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 536                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 537                 }\r
 538             }\r
 539             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 540                 return null;\r
 541             }\r
 542         };\r
 543         desc.setHandler(handler);\r
 544         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 545         desc.setMultivalued(false);\r
 546         addFieldDescriptor(desc);\r
 547         \r
 548         //-- validation code for: _description\r
 549         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 550         { //-- local scope\r
 551             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 552             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 553             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 554             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 555         }\r
 556         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 557         //-- _thresholdLine\r
 558         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine.class, "_thresholdLine", "thresholdLine", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 559         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 560             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 561                 throws IllegalStateException\r
 562             {\r
 563                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 564                 return target.getThresholdLine();\r
 565             }\r
 566             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 567                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 568             {\r
 569                 try {\r
 570                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 571                     target.setThresholdLine( (jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine) value);\r
 572                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 573                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 574                 }\r
 575             }\r
 576             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 577                 return new jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine();\r
 578             }\r
 579         };\r
 580         desc.setHandler(handler);\r
 581         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 582         desc.setMultivalued(false);\r
 583         addFieldDescriptor(desc);\r
 584         \r
 585         //-- validation code for: _thresholdLine\r
 586         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 587         { //-- local scope\r
 588         }\r
 589         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 590     }\r
 591 \r
 592 \r
 593       //-----------/\r
 594      //- Methods -/\r
 595     //-----------/\r
 596 \r
 597     /**\r
 598      * Method getAccessMode.\r
 599      * \r
 600      * @return the access mode specified for this class.\r
 601      */\r
 602     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 603     ) {\r
 604         return null;\r
 605     }\r
 606 \r
 607     /**\r
 608      * Method getIdentity.\r
 609      * \r
 610      * @return the identity field, null if this class has no\r
 611      * identity.\r
 612      */\r
 613     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 614     ) {\r
 615         return super.getIdentity();\r
 616     }\r
 617 \r
 618     /**\r
 619      * Method getJavaClass.\r
 620      * \r
 621      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 622      */\r
 623     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 624     ) {\r
 625         return jalview.schemabinding.version2.Annotation.class;\r
 626     }\r
 627 \r
 628     /**\r
 629      * Method getNameSpacePrefix.\r
 630      * \r
 631      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 632      */\r
 633     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 634     ) {\r
 635         return _nsPrefix;\r
 636     }\r
 637 \r
 638     /**\r
 639      * Method getNameSpaceURI.\r
 640      * \r
 641      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 642      * unmarshaling as XML.\r
 643      */\r
 644     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 645     ) {\r
 646         return _nsURI;\r
 647     }\r
 648 \r
 649     /**\r
 650      * Method getValidator.\r
 651      * \r
 652      * @return a specific validator for the class described by this\r
 653      * ClassDescriptor.\r
 654      */\r
 655     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 656     ) {\r
 657         return this;\r
 658     }\r
 659 \r
 660     /**\r
 661      * Method getXMLName.\r
 662      * \r
 663      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 664      */\r
 665     public java.lang.String getXMLName(\r
 666     ) {\r
 667         return _xmlName;\r
 668     }\r
 669 \r
 670     /**\r
 671      * Method isElementDefinition.\r
 672      * \r
 673      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 674      * of a global\r
 675      * element or element with anonymous type definition.\r
 676      */\r
 677     public boolean isElementDefinition(\r
 678     ) {\r
 679         return _elementDefinition;\r
 680     }\r
 681 \r
 682 }\r