src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationElementDescriptor.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  *******************************************************************************/
  18 /*
  19  * This class was automatically generated with
  20  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  21  * Schema.
  22  * $Id$
  23  */
  24
  25 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  26
  27   //---------------------------------/
  28  //- Imported classes and packages -/
  29 //---------------------------------/
  30
  31 import jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement;
  32
  33 /**
  34  * Class AnnotationElementDescriptor.
  35  *
  36  * @version $Revision$ $Date$
  37  */
  38 public class AnnotationElementDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {
  39
  40
  41       //--------------------------/
  42      //- Class/Member Variables -/
  43     //--------------------------/
  44
  45     /**
  46      * Field _elementDefinition.
  47      */
  48     private boolean _elementDefinition;
  49
  50     /**
  51      * Field _nsPrefix.
  52      */
  53     private java.lang.String _nsPrefix;
  54
  55     /**
  56      * Field _nsURI.
  57      */
  58     private java.lang.String _nsURI;
  59
  60     /**
  61      * Field _xmlName.
  62      */
  63     private java.lang.String _xmlName;
  64
  65
  66       //----------------/
  67      //- Constructors -/
  68     //----------------/
  69
  70     public AnnotationElementDescriptor() {
  71         super();
  72         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  73         _xmlName = "annotationElement";
  74         _elementDefinition = true;
  75
  76         //-- set grouping compositor
  77         setCompositorAsSequence();
  78         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;
  79         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;
  80         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;
  81         //-- initialize attribute descriptors
  82
  83         //-- _position
  84         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_position", "position", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  85         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
  86             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
  87                 throws IllegalStateException
  88             {
  89                 AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
  90                 if (!target.hasPosition()) { return null; }
  91                 return new java.lang.Integer(target.getPosition());
  92             }
  93             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  94                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  95             {
  96                 try {
  97                     AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
  98                     // ignore null values for non optional primitives
  99                     if (value == null) { return; }
 100
 101                     target.setPosition( ((java.lang.Integer) value).intValue());
 102                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 103                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 104                 }
 105             }
 106             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 107                 return null;
 108             }
 109         };
 110         desc.setHandler(handler);
 111         desc.setRequired(true);
 112         desc.setMultivalued(false);
 113         addFieldDescriptor(desc);
 114
 115         //-- validation code for: _position
 116         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 117         fieldValidator.setMinOccurs(1);
 118         { //-- local scope
 119             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 120             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 121             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 122             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 123             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 124         }
 125         desc.setValidator(fieldValidator);
 126         //-- _colour
 127         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_colour", "colour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 128         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 129             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 130                 throws IllegalStateException
 131             {
 132                 AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 133                 if (!target.hasColour()) { return null; }
 134                 return new java.lang.Integer(target.getColour());
 135             }
 136             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 137                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 138             {
 139                 try {
 140                     AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 141                     // if null, use delete method for optional primitives
 142                     if (value == null) {
 143                         target.deleteColour();
 144                         return;
 145                     }
 146                     target.setColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());
 147                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 148                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 149                 }
 150             }
 151             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 152                 return null;
 153             }
 154         };
 155         desc.setHandler(handler);
 156         desc.setMultivalued(false);
 157         addFieldDescriptor(desc);
 158
 159         //-- validation code for: _colour
 160         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 161         { //-- local scope
 162             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 163             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 164             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 165             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 166             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 167         }
 168         desc.setValidator(fieldValidator);
 169         //-- initialize element descriptors
 170
 171         //-- _displayCharacter
 172         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_displayCharacter", "displayCharacter", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 173         desc.setImmutable(true);
 174         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 175             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 176                 throws IllegalStateException
 177             {
 178                 AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 179                 return target.getDisplayCharacter();
 180             }
 181             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 182                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 183             {
 184                 try {
 185                     AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 186                     target.setDisplayCharacter( (java.lang.String) value);
 187                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 188                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 189                 }
 190             }
 191             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 192                 return null;
 193             }
 194         };
 195         desc.setHandler(handler);
 196         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 197         desc.setMultivalued(false);
 198         addFieldDescriptor(desc);
 199
 200         //-- validation code for: _displayCharacter
 201         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 202         { //-- local scope
 203             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 204             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 205             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 206             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 207         }
 208         desc.setValidator(fieldValidator);
 209         //-- _description
 210         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 211         desc.setImmutable(true);
 212         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 213             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 214                 throws IllegalStateException
 215             {
 216                 AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 217                 return target.getDescription();
 218             }
 219             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 220                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 221             {
 222                 try {
 223                     AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 224                     target.setDescription( (java.lang.String) value);
 225                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 226                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 227                 }
 228             }
 229             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 230                 return null;
 231             }
 232         };
 233         desc.setHandler(handler);
 234         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 235         desc.setMultivalued(false);
 236         addFieldDescriptor(desc);
 237
 238         //-- validation code for: _description
 239         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 240         { //-- local scope
 241             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 242             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 243             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 244             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 245         }
 246         desc.setValidator(fieldValidator);
 247         //-- _secondaryStructure
 248         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_secondaryStructure", "secondaryStructure", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 249         desc.setImmutable(true);
 250         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 251             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 252                 throws IllegalStateException
 253             {
 254                 AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 255                 return target.getSecondaryStructure();
 256             }
 257             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 258                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 259             {
 260                 try {
 261                     AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 262                     target.setSecondaryStructure( (java.lang.String) value);
 263                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 264                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 265                 }
 266             }
 267             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 268                 return null;
 269             }
 270         };
 271         desc.setHandler(handler);
 272         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 273         desc.setMultivalued(false);
 274         addFieldDescriptor(desc);
 275
 276         //-- validation code for: _secondaryStructure
 277         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 278         { //-- local scope
 279             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 280             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 281             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 282             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 283             typeValidator.setLength(1);
 284         }
 285         desc.setValidator(fieldValidator);
 286         //-- _value
 287         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Float.TYPE, "_value", "value", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 288         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 289             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 290                 throws IllegalStateException
 291             {
 292                 AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 293                 if (!target.hasValue()) { return null; }
 294                 return new java.lang.Float(target.getValue());
 295             }
 296             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 297                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 298             {
 299                 try {
 300                     AnnotationElement target = (AnnotationElement) object;
 301                     // if null, use delete method for optional primitives
 302                     if (value == null) {
 303                         target.deleteValue();
 304                         return;
 305                     }
 306                     target.setValue( ((java.lang.Float) value).floatValue());
 307                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 308                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 309                 }
 310             }
 311             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 312                 return null;
 313             }
 314         };
 315         desc.setHandler(handler);
 316         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 317         desc.setMultivalued(false);
 318         addFieldDescriptor(desc);
 319
 320         //-- validation code for: _value
 321         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 322         { //-- local scope
 323             org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;
 324             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();
 325             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 326             typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);
 327             typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);
 328         }
 329         desc.setValidator(fieldValidator);
 330     }
 331
 332
 333       //-----------/
 334      //- Methods -/
 335     //-----------/
 336
 337     /**
 338      * Method getAccessMode.
 339      *
 340      * @return the access mode specified for this class.
 341      */
 342     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(
 343     ) {
 344         return null;
 345     }
 346
 347     /**
 348      * Method getIdentity.
 349      *
 350      * @return the identity field, null if this class has no
 351      * identity.
 352      */
 353     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(
 354     ) {
 355         return super.getIdentity();
 356     }
 357
 358     /**
 359      * Method getJavaClass.
 360      *
 361      * @return the Java class represented by this descriptor.
 362      */
 363     public java.lang.Class getJavaClass(
 364     ) {
 365         return jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement.class;
 366     }
 367
 368     /**
 369      * Method getNameSpacePrefix.
 370      *
 371      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 372      */
 373     public java.lang.String getNameSpacePrefix(
 374     ) {
 375         return _nsPrefix;
 376     }
 377
 378     /**
 379      * Method getNameSpaceURI.
 380      *
 381      * @return the namespace URI used when marshaling and
 382      * unmarshaling as XML.
 383      */
 384     public java.lang.String getNameSpaceURI(
 385     ) {
 386         return _nsURI;
 387     }
 388
 389     /**
 390      * Method getValidator.
 391      *
 392      * @return a specific validator for the class described by this
 393      * ClassDescriptor.
 394      */
 395     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(
 396     ) {
 397         return this;
 398     }
 399
 400     /**
 401      * Method getXMLName.
 402      *
 403      * @return the XML Name for the Class being described.
 404      */
 405     public java.lang.String getXMLName(
 406     ) {
 407         return _xmlName;
 408     }
 409
 410     /**
 411      * Method isElementDefinition.
 412      *
 413      * @return true if XML schema definition of this Class is that
 414      * of a global
 415      * element or element with anonymous type definition.
 416      */
 417     public boolean isElementDefinition(
 418     ) {
 419         return _elementDefinition;
 420     }
 421
 422 }