added aligned codon frames, and dataset reference ids for sequenceSet and sequences...
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / descriptors / DBRefDescriptor.java
1 /*\r
2  * This class was automatically generated with \r
3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
4  * Schema.\r
5  * $Id$\r
6  */\r
7 \r
8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
9 \r
10   //---------------------------------/\r
11  //- Imported classes and packages -/\r
12 //---------------------------------/\r
13 \r
14 import jalview.schemabinding.version2.DBRef;\r
15 \r
16 /**\r
17  * Class DBRefDescriptor.\r
18  * \r
19  * @version $Revision$ $Date$\r
20  */\r
21 public class DBRefDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
22 \r
23 \r
24       //--------------------------/\r
25      //- Class/Member Variables -/\r
26     //--------------------------/\r
27 \r
28     /**\r
29      * Field _elementDefinition.\r
30      */\r
31     private boolean _elementDefinition;\r
32 \r
33     /**\r
34      * Field _nsPrefix.\r
35      */\r
36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
37 \r
38     /**\r
39      * Field _nsURI.\r
40      */\r
41     private java.lang.String _nsURI;\r
42 \r
43     /**\r
44      * Field _xmlName.\r
45      */\r
46     private java.lang.String _xmlName;\r
47 \r
48 \r
49       //----------------/\r
50      //- Constructors -/\r
51     //----------------/\r
52 \r
53     public DBRefDescriptor() {\r
54         super();\r
55         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
56         _xmlName = "DBRef";\r
57         _elementDefinition = true;\r
58         \r
59         //-- set grouping compositor\r
60         setCompositorAsSequence();\r
61         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
62         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
63         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
64         //-- initialize attribute descriptors\r
65         \r
66         //-- _source\r
67         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_source", "source", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
68         desc.setImmutable(true);\r
69         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
70             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
71                 throws IllegalStateException\r
72             {\r
73                 DBRef target = (DBRef) object;\r
74                 return target.getSource();\r
75             }\r
76             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
77                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
78             {\r
79                 try {\r
80                     DBRef target = (DBRef) object;\r
81                     target.setSource( (java.lang.String) value);\r
82                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
83                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
84                 }\r
85             }\r
86             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
87                 return null;\r
88             }\r
89         };\r
90         desc.setHandler(handler);\r
91         desc.setMultivalued(false);\r
92         addFieldDescriptor(desc);\r
93         \r
94         //-- validation code for: _source\r
95         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
96         { //-- local scope\r
97             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
98             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
99             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
100             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
101         }\r
102         desc.setValidator(fieldValidator);\r
103         //-- _version\r
104         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_version", "version", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
105         desc.setImmutable(true);\r
106         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
107             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
108                 throws IllegalStateException\r
109             {\r
110                 DBRef target = (DBRef) object;\r
111                 return target.getVersion();\r
112             }\r
113             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
114                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
115             {\r
116                 try {\r
117                     DBRef target = (DBRef) object;\r
118                     target.setVersion( (java.lang.String) value);\r
119                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
120                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
121                 }\r
122             }\r
123             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
124                 return null;\r
125             }\r
126         };\r
127         desc.setHandler(handler);\r
128         desc.setMultivalued(false);\r
129         addFieldDescriptor(desc);\r
130         \r
131         //-- validation code for: _version\r
132         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
133         { //-- local scope\r
134             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
135             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
136             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
137             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
138         }\r
139         desc.setValidator(fieldValidator);\r
140         //-- _accessionId\r
141         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_accessionId", "accessionId", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
142         desc.setImmutable(true);\r
143         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
144             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
145                 throws IllegalStateException\r
146             {\r
147                 DBRef target = (DBRef) object;\r
148                 return target.getAccessionId();\r
149             }\r
150             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
151                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
152             {\r
153                 try {\r
154                     DBRef target = (DBRef) object;\r
155                     target.setAccessionId( (java.lang.String) value);\r
156                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
157                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
158                 }\r
159             }\r
160             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
161                 return null;\r
162             }\r
163         };\r
164         desc.setHandler(handler);\r
165         desc.setMultivalued(false);\r
166         addFieldDescriptor(desc);\r
167         \r
168         //-- validation code for: _accessionId\r
169         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
170         { //-- local scope\r
171             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
172             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
173             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
174             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
175         }\r
176         desc.setValidator(fieldValidator);\r
177         //-- initialize element descriptors\r
178         \r
179         //-- _mapping\r
180         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, "_mapping", "Mapping", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
181         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
182             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
183                 throws IllegalStateException\r
184             {\r
185                 DBRef target = (DBRef) object;\r
186                 return target.getMapping();\r
187             }\r
188             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
189                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
190             {\r
191                 try {\r
192                     DBRef target = (DBRef) object;\r
193                     target.setMapping( (jalview.schemabinding.version2.Mapping) value);\r
194                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
195                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
196                 }\r
197             }\r
198             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
199                 return new jalview.schemabinding.version2.Mapping();\r
200             }\r
201         };\r
202         desc.setHandler(handler);\r
203         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
204         desc.setMultivalued(false);\r
205         addFieldDescriptor(desc);\r
206         \r
207         //-- validation code for: _mapping\r
208         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
209         { //-- local scope\r
210         }\r
211         desc.setValidator(fieldValidator);\r
212     }\r
213 \r
214 \r
215       //-----------/\r
216      //- Methods -/\r
217     //-----------/\r
218 \r
219     /**\r
220      * Method getAccessMode.\r
221      * \r
222      * @return the access mode specified for this class.\r
223      */\r
224     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
225     ) {\r
226         return null;\r
227     }\r
228 \r
229     /**\r
230      * Method getIdentity.\r
231      * \r
232      * @return the identity field, null if this class has no\r
233      * identity.\r
234      */\r
235     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
236     ) {\r
237         return super.getIdentity();\r
238     }\r
239 \r
240     /**\r
241      * Method getJavaClass.\r
242      * \r
243      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
244      */\r
245     public java.lang.Class getJavaClass(\r
246     ) {\r
247         return jalview.schemabinding.version2.DBRef.class;\r
248     }\r
249 \r
250     /**\r
251      * Method getNameSpacePrefix.\r
252      * \r
253      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
254      */\r
255     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
256     ) {\r
257         return _nsPrefix;\r
258     }\r
259 \r
260     /**\r
261      * Method getNameSpaceURI.\r
262      * \r
263      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
264      * unmarshaling as XML.\r
265      */\r
266     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
267     ) {\r
268         return _nsURI;\r
269     }\r
270 \r
271     /**\r
272      * Method getValidator.\r
273      * \r
274      * @return a specific validator for the class described by this\r
275      * ClassDescriptor.\r
276      */\r
277     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
278     ) {\r
279         return this;\r
280     }\r
281 \r
282     /**\r
283      * Method getXMLName.\r
284      * \r
285      * @return the XML Name for the Class being described.\r
286      */\r
287     public java.lang.String getXMLName(\r
288     ) {\r
289         return _xmlName;\r
290     }\r
291 \r
292     /**\r
293      * Method isElementDefinition.\r
294      * \r
295      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
296      * of a global\r
297      * element or element with anonymous type definition.\r
298      */\r
299     public boolean isElementDefinition(\r
300     ) {\r
301         return _elementDefinition;\r
302     }\r
303 \r
304 }\r