src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/DBRefDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  19 \r
  20 //---------------------------------/\r
  21 //- Imported classes and packages -/\r
  22 //---------------------------------/\r
  23 \r
  24 import jalview.schemabinding.version2.DBRef;\r
  25 \r
  26 /**\r
  27  * Class DBRefDescriptor.\r
  28  * \r
  29  * @version $Revision$ $Date$\r
  30  */\r
  31 public class DBRefDescriptor extends\r
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  33 {\r
  34 \r
  35   // --------------------------/\r
  36   // - Class/Member Variables -/\r
  37   // --------------------------/\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field _elementDefinition.\r
  41    */\r
  42   private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field _nsPrefix.\r
  46    */\r
  47   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49   /**\r
  50    * Field _nsURI.\r
  51    */\r
  52   private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54   /**\r
  55    * Field _xmlName.\r
  56    */\r
  57   private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59   // ----------------/\r
  60   // - Constructors -/\r
  61   // ----------------/\r
  62 \r
  63   public DBRefDescriptor()\r
  64   {\r
  65     super();\r
  66     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  67     _xmlName = "DBRef";\r
  68     _elementDefinition = true;\r
  69 \r
  70     // -- set grouping compositor\r
  71     setCompositorAsSequence();\r
  72     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  73     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  74     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  75     // -- initialize attribute descriptors\r
  76 \r
  77     // -- _source\r
  78     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  79             java.lang.String.class, "_source", "source",\r
  80             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  81     desc.setImmutable(true);\r
  82     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  83     {\r
  84       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  85               throws IllegalStateException\r
  86       {\r
  87         DBRef target = (DBRef) object;\r
  88         return target.getSource();\r
  89       }\r
  90 \r
  91       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  92               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  93       {\r
  94         try\r
  95         {\r
  96           DBRef target = (DBRef) object;\r
  97           target.setSource((java.lang.String) value);\r
  98         } catch (java.lang.Exception ex)\r
  99         {\r
 100           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 101         }\r
 102       }\r
 103 \r
 104       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 105       {\r
 106         return null;\r
 107       }\r
 108     };\r
 109     desc.setHandler(handler);\r
 110     desc.setMultivalued(false);\r
 111     addFieldDescriptor(desc);\r
 112 \r
 113     // -- validation code for: _source\r
 114     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 115     { // -- local scope\r
 116       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 117       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 118       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 119       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 120     }\r
 121     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 122     // -- _version\r
 123     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 124             java.lang.String.class, "_version", "version",\r
 125             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 126     desc.setImmutable(true);\r
 127     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 128     {\r
 129       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 130               throws IllegalStateException\r
 131       {\r
 132         DBRef target = (DBRef) object;\r
 133         return target.getVersion();\r
 134       }\r
 135 \r
 136       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 137               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 138       {\r
 139         try\r
 140         {\r
 141           DBRef target = (DBRef) object;\r
 142           target.setVersion((java.lang.String) value);\r
 143         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 144         {\r
 145           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 146         }\r
 147       }\r
 148 \r
 149       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 150       {\r
 151         return null;\r
 152       }\r
 153     };\r
 154     desc.setHandler(handler);\r
 155     desc.setMultivalued(false);\r
 156     addFieldDescriptor(desc);\r
 157 \r
 158     // -- validation code for: _version\r
 159     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 160     { // -- local scope\r
 161       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 162       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 163       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 164       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 165     }\r
 166     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 167     // -- _accessionId\r
 168     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 169             java.lang.String.class, "_accessionId", "accessionId",\r
 170             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 171     desc.setImmutable(true);\r
 172     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 173     {\r
 174       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 175               throws IllegalStateException\r
 176       {\r
 177         DBRef target = (DBRef) object;\r
 178         return target.getAccessionId();\r
 179       }\r
 180 \r
 181       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 182               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 183       {\r
 184         try\r
 185         {\r
 186           DBRef target = (DBRef) object;\r
 187           target.setAccessionId((java.lang.String) value);\r
 188         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 189         {\r
 190           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 191         }\r
 192       }\r
 193 \r
 194       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 195       {\r
 196         return null;\r
 197       }\r
 198     };\r
 199     desc.setHandler(handler);\r
 200     desc.setMultivalued(false);\r
 201     addFieldDescriptor(desc);\r
 202 \r
 203     // -- validation code for: _accessionId\r
 204     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 205     { // -- local scope\r
 206       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 207       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 208       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 209       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 210     }\r
 211     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 212     // -- initialize element descriptors\r
 213 \r
 214     // -- _mapping\r
 215     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 216             jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, "_mapping",\r
 217             "Mapping", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 218     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 219     {\r
 220       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 221               throws IllegalStateException\r
 222       {\r
 223         DBRef target = (DBRef) object;\r
 224         return target.getMapping();\r
 225       }\r
 226 \r
 227       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 228               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 229       {\r
 230         try\r
 231         {\r
 232           DBRef target = (DBRef) object;\r
 233           target.setMapping((jalview.schemabinding.version2.Mapping) value);\r
 234         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 235         {\r
 236           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 237         }\r
 238       }\r
 239 \r
 240       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 241       {\r
 242         return new jalview.schemabinding.version2.Mapping();\r
 243       }\r
 244     };\r
 245     desc.setHandler(handler);\r
 246     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 247     desc.setMultivalued(false);\r
 248     addFieldDescriptor(desc);\r
 249 \r
 250     // -- validation code for: _mapping\r
 251     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 252     { // -- local scope\r
 253     }\r
 254     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 255   }\r
 256 \r
 257   // -----------/\r
 258   // - Methods -/\r
 259   // -----------/\r
 260 \r
 261   /**\r
 262    * Method getAccessMode.\r
 263    * \r
 264    * @return the access mode specified for this class.\r
 265    */\r
 266   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 267   {\r
 268     return null;\r
 269   }\r
 270 \r
 271   /**\r
 272    * Method getIdentity.\r
 273    * \r
 274    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 275    */\r
 276   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 277   {\r
 278     return super.getIdentity();\r
 279   }\r
 280 \r
 281   /**\r
 282    * Method getJavaClass.\r
 283    * \r
 284    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 285    */\r
 286   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 287   {\r
 288     return jalview.schemabinding.version2.DBRef.class;\r
 289   }\r
 290 \r
 291   /**\r
 292    * Method getNameSpacePrefix.\r
 293    * \r
 294    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 295    */\r
 296   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 297   {\r
 298     return _nsPrefix;\r
 299   }\r
 300 \r
 301   /**\r
 302    * Method getNameSpaceURI.\r
 303    * \r
 304    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 305    */\r
 306   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 307   {\r
 308     return _nsURI;\r
 309   }\r
 310 \r
 311   /**\r
 312    * Method getValidator.\r
 313    * \r
 314    * @return a specific validator for the class described by this\r
 315    *         ClassDescriptor.\r
 316    */\r
 317   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 318   {\r
 319     return this;\r
 320   }\r
 321 \r
 322   /**\r
 323    * Method getXMLName.\r
 324    * \r
 325    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 326    */\r
 327   public java.lang.String getXMLName()\r
 328   {\r
 329     return _xmlName;\r
 330   }\r
 331 \r
 332   /**\r
 333    * Method isElementDefinition.\r
 334    * \r
 335    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 336    *         element or element with anonymous type definition.\r
 337    */\r
 338   public boolean isElementDefinition()\r
 339   {\r
 340     return _elementDefinition;\r
 341   }\r
 342 \r
 343 }\r