src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/DBRefDescriptor.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
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  17  */
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  19
  20 //---------------------------------/
  21 //- Imported classes and packages -/
  22 //---------------------------------/
  23
  24 import jalview.schemabinding.version2.DBRef;
  25
  26 /**
  27  * Class DBRefDescriptor.
  28  *
  29  * @version $Revision$ $Date$
  30  */
  31 public class DBRefDescriptor extends
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  33 {
  34
  35   // --------------------------/
  36   // - Class/Member Variables -/
  37   // --------------------------/
  38
  39   /**
  40    * Field _elementDefinition.
  41    */
  42   private boolean _elementDefinition;
  43
  44   /**
  45    * Field _nsPrefix.
  46    */
  47   private java.lang.String _nsPrefix;
  48
  49   /**
  50    * Field _nsURI.
  51    */
  52   private java.lang.String _nsURI;
  53
  54   /**
  55    * Field _xmlName.
  56    */
  57   private java.lang.String _xmlName;
  58
  59   // ----------------/
  60   // - Constructors -/
  61   // ----------------/
  62
  63   public DBRefDescriptor()
  64   {
  65     super();
  66     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  67     _xmlName = "DBRef";
  68     _elementDefinition = true;
  69
  70     // -- set grouping compositor
  71     setCompositorAsSequence();
  72     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  73     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  74     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  75     // -- initialize attribute descriptors
  76
  77     // -- _source
  78     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  79             java.lang.String.class, "_source", "source",
  80             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  81     desc.setImmutable(true);
  82     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  83     {
  84       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  85               throws IllegalStateException
  86       {
  87         DBRef target = (DBRef) object;
  88         return target.getSource();
  89       }
  90
  91       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  92               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  93       {
  94         try
  95         {
  96           DBRef target = (DBRef) object;
  97           target.setSource((java.lang.String) value);
  98         } catch (java.lang.Exception ex)
  99         {
 100           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 101         }
 102       }
 103
 104       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 105       {
 106         return null;
 107       }
 108     };
 109     desc.setHandler(handler);
 110     desc.setMultivalued(false);
 111     addFieldDescriptor(desc);
 112
 113     // -- validation code for: _source
 114     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 115     { // -- local scope
 116       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 117       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 118       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 119       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 120     }
 121     desc.setValidator(fieldValidator);
 122     // -- _version
 123     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 124             java.lang.String.class, "_version", "version",
 125             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 126     desc.setImmutable(true);
 127     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 128     {
 129       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 130               throws IllegalStateException
 131       {
 132         DBRef target = (DBRef) object;
 133         return target.getVersion();
 134       }
 135
 136       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 137               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 138       {
 139         try
 140         {
 141           DBRef target = (DBRef) object;
 142           target.setVersion((java.lang.String) value);
 143         } catch (java.lang.Exception ex)
 144         {
 145           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 146         }
 147       }
 148
 149       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 150       {
 151         return null;
 152       }
 153     };
 154     desc.setHandler(handler);
 155     desc.setMultivalued(false);
 156     addFieldDescriptor(desc);
 157
 158     // -- validation code for: _version
 159     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 160     { // -- local scope
 161       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 162       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 163       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 164       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 165     }
 166     desc.setValidator(fieldValidator);
 167     // -- _accessionId
 168     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 169             java.lang.String.class, "_accessionId", "accessionId",
 170             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 171     desc.setImmutable(true);
 172     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 173     {
 174       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 175               throws IllegalStateException
 176       {
 177         DBRef target = (DBRef) object;
 178         return target.getAccessionId();
 179       }
 180
 181       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 182               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 183       {
 184         try
 185         {
 186           DBRef target = (DBRef) object;
 187           target.setAccessionId((java.lang.String) value);
 188         } catch (java.lang.Exception ex)
 189         {
 190           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 191         }
 192       }
 193
 194       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 195       {
 196         return null;
 197       }
 198     };
 199     desc.setHandler(handler);
 200     desc.setMultivalued(false);
 201     addFieldDescriptor(desc);
 202
 203     // -- validation code for: _accessionId
 204     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 205     { // -- local scope
 206       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 207       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 208       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 209       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 210     }
 211     desc.setValidator(fieldValidator);
 212     // -- initialize element descriptors
 213
 214     // -- _mapping
 215     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 216             jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, "_mapping",
 217             "Mapping", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 218     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 219     {
 220       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 221               throws IllegalStateException
 222       {
 223         DBRef target = (DBRef) object;
 224         return target.getMapping();
 225       }
 226
 227       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 228               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 229       {
 230         try
 231         {
 232           DBRef target = (DBRef) object;
 233           target.setMapping((jalview.schemabinding.version2.Mapping) value);
 234         } catch (java.lang.Exception ex)
 235         {
 236           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 237         }
 238       }
 239
 240       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 241       {
 242         return new jalview.schemabinding.version2.Mapping();
 243       }
 244     };
 245     desc.setHandler(handler);
 246     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 247     desc.setMultivalued(false);
 248     addFieldDescriptor(desc);
 249
 250     // -- validation code for: _mapping
 251     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 252     { // -- local scope
 253     }
 254     desc.setValidator(fieldValidator);
 255   }
 256
 257   // -----------/
 258   // - Methods -/
 259   // -----------/
 260
 261   /**
 262    * Method getAccessMode.
 263    *
 264    * @return the access mode specified for this class.
 265    */
 266   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 267   {
 268     return null;
 269   }
 270
 271   /**
 272    * Method getIdentity.
 273    *
 274    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 275    */
 276   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 277   {
 278     return super.getIdentity();
 279   }
 280
 281   /**
 282    * Method getJavaClass.
 283    *
 284    * @return the Java class represented by this descriptor.
 285    */
 286   public java.lang.Class getJavaClass()
 287   {
 288     return jalview.schemabinding.version2.DBRef.class;
 289   }
 290
 291   /**
 292    * Method getNameSpacePrefix.
 293    *
 294    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 295    */
 296   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 297   {
 298     return _nsPrefix;
 299   }
 300
 301   /**
 302    * Method getNameSpaceURI.
 303    *
 304    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 305    */
 306   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 307   {
 308     return _nsURI;
 309   }
 310
 311   /**
 312    * Method getValidator.
 313    *
 314    * @return a specific validator for the class described by this
 315    *         ClassDescriptor.
 316    */
 317   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 318   {
 319     return this;
 320   }
 321
 322   /**
 323    * Method getXMLName.
 324    *
 325    * @return the XML Name for the Class being described.
 326    */
 327   public java.lang.String getXMLName()
 328   {
 329     return _xmlName;
 330   }
 331
 332   /**
 333    * Method isElementDefinition.
 334    *
 335    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 336    *         element or element with anonymous type definition.
 337    */
 338   public boolean isElementDefinition()
 339   {
 340     return _elementDefinition;
 341   }
 342
 343 }