src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/DBRefDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21   //---------------------------------/\r
  22  //- Imported classes and packages -/\r
  23 //---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.DBRef;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class DBRefDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class DBRefDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  33 \r
  34 \r
  35       //--------------------------/\r
  36      //- Class/Member Variables -/\r
  37     //--------------------------/\r
  38 \r
  39     /**\r
  40      * Field _elementDefinition.\r
  41      */\r
  42     private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44     /**\r
  45      * Field _nsPrefix.\r
  46      */\r
  47     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49     /**\r
  50      * Field _nsURI.\r
  51      */\r
  52     private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54     /**\r
  55      * Field _xmlName.\r
  56      */\r
  57     private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59 \r
  60       //----------------/\r
  61      //- Constructors -/\r
  62     //----------------/\r
  63 \r
  64     public DBRefDescriptor() {\r
  65         super();\r
  66         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  67         _xmlName = "DBRef";\r
  68         _elementDefinition = true;\r
  69         \r
  70         //-- set grouping compositor\r
  71         setCompositorAsSequence();\r
  72         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  73         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  74         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  75         //-- initialize attribute descriptors\r
  76         \r
  77         //-- _source\r
  78         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_source", "source", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  79         desc.setImmutable(true);\r
  80         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  81             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  82                 throws IllegalStateException\r
  83             {\r
  84                 DBRef target = (DBRef) object;\r
  85                 return target.getSource();\r
  86             }\r
  87             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  88                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  89             {\r
  90                 try {\r
  91                     DBRef target = (DBRef) object;\r
  92                     target.setSource( (java.lang.String) value);\r
  93                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  94                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  95                 }\r
  96             }\r
  97             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
  98                 return null;\r
  99             }\r
 100         };\r
 101         desc.setHandler(handler);\r
 102         desc.setMultivalued(false);\r
 103         addFieldDescriptor(desc);\r
 104         \r
 105         //-- validation code for: _source\r
 106         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 107         { //-- local scope\r
 108             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 109             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 110             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 111             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 112         }\r
 113         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 114         //-- _version\r
 115         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_version", "version", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 116         desc.setImmutable(true);\r
 117         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 118             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 119                 throws IllegalStateException\r
 120             {\r
 121                 DBRef target = (DBRef) object;\r
 122                 return target.getVersion();\r
 123             }\r
 124             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 125                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 126             {\r
 127                 try {\r
 128                     DBRef target = (DBRef) object;\r
 129                     target.setVersion( (java.lang.String) value);\r
 130                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 131                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 132                 }\r
 133             }\r
 134             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 135                 return null;\r
 136             }\r
 137         };\r
 138         desc.setHandler(handler);\r
 139         desc.setMultivalued(false);\r
 140         addFieldDescriptor(desc);\r
 141         \r
 142         //-- validation code for: _version\r
 143         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 144         { //-- local scope\r
 145             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 146             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 147             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 148             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 149         }\r
 150         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 151         //-- _accessionId\r
 152         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_accessionId", "accessionId", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 153         desc.setImmutable(true);\r
 154         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 155             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 156                 throws IllegalStateException\r
 157             {\r
 158                 DBRef target = (DBRef) object;\r
 159                 return target.getAccessionId();\r
 160             }\r
 161             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 162                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 163             {\r
 164                 try {\r
 165                     DBRef target = (DBRef) object;\r
 166                     target.setAccessionId( (java.lang.String) value);\r
 167                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 168                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 169                 }\r
 170             }\r
 171             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 172                 return null;\r
 173             }\r
 174         };\r
 175         desc.setHandler(handler);\r
 176         desc.setMultivalued(false);\r
 177         addFieldDescriptor(desc);\r
 178         \r
 179         //-- validation code for: _accessionId\r
 180         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 181         { //-- local scope\r
 182             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 183             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 184             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 185             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 186         }\r
 187         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 188         //-- initialize element descriptors\r
 189         \r
 190         //-- _mapping\r
 191         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, "_mapping", "Mapping", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 192         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 193             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 194                 throws IllegalStateException\r
 195             {\r
 196                 DBRef target = (DBRef) object;\r
 197                 return target.getMapping();\r
 198             }\r
 199             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 200                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 201             {\r
 202                 try {\r
 203                     DBRef target = (DBRef) object;\r
 204                     target.setMapping( (jalview.schemabinding.version2.Mapping) value);\r
 205                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 206                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 207                 }\r
 208             }\r
 209             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 210                 return new jalview.schemabinding.version2.Mapping();\r
 211             }\r
 212         };\r
 213         desc.setHandler(handler);\r
 214         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 215         desc.setMultivalued(false);\r
 216         addFieldDescriptor(desc);\r
 217         \r
 218         //-- validation code for: _mapping\r
 219         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 220         { //-- local scope\r
 221         }\r
 222         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 223     }\r
 224 \r
 225 \r
 226       //-----------/\r
 227      //- Methods -/\r
 228     //-----------/\r
 229 \r
 230     /**\r
 231      * Method getAccessMode.\r
 232      * \r
 233      * @return the access mode specified for this class.\r
 234      */\r
 235     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 236     ) {\r
 237         return null;\r
 238     }\r
 239 \r
 240     /**\r
 241      * Method getIdentity.\r
 242      * \r
 243      * @return the identity field, null if this class has no\r
 244      * identity.\r
 245      */\r
 246     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 247     ) {\r
 248         return super.getIdentity();\r
 249     }\r
 250 \r
 251     /**\r
 252      * Method getJavaClass.\r
 253      * \r
 254      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 255      */\r
 256     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 257     ) {\r
 258         return jalview.schemabinding.version2.DBRef.class;\r
 259     }\r
 260 \r
 261     /**\r
 262      * Method getNameSpacePrefix.\r
 263      * \r
 264      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 265      */\r
 266     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 267     ) {\r
 268         return _nsPrefix;\r
 269     }\r
 270 \r
 271     /**\r
 272      * Method getNameSpaceURI.\r
 273      * \r
 274      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 275      * unmarshaling as XML.\r
 276      */\r
 277     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 278     ) {\r
 279         return _nsURI;\r
 280     }\r
 281 \r
 282     /**\r
 283      * Method getValidator.\r
 284      * \r
 285      * @return a specific validator for the class described by this\r
 286      * ClassDescriptor.\r
 287      */\r
 288     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 289     ) {\r
 290         return this;\r
 291     }\r
 292 \r
 293     /**\r
 294      * Method getXMLName.\r
 295      * \r
 296      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 297      */\r
 298     public java.lang.String getXMLName(\r
 299     ) {\r
 300         return _xmlName;\r
 301     }\r
 302 \r
 303     /**\r
 304      * Method isElementDefinition.\r
 305      * \r
 306      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 307      * of a global\r
 308      * element or element with anonymous type definition.\r
 309      */\r
 310     public boolean isElementDefinition(\r
 311     ) {\r
 312         return _elementDefinition;\r
 313     }\r
 314 \r
 315 }\r