src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/DBRefDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21 // ---------------------------------/\r
  22 // - Imported classes and packages -/\r
  23 // ---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.DBRef;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class DBRefDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class DBRefDescriptor extends\r
  33         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  34 {\r
  35 \r
  36   // --------------------------/\r
  37   // - Class/Member Variables -/\r
  38   // --------------------------/\r
  39 \r
  40   /**\r
  41    * Field _elementDefinition.\r
  42    */\r
  43   private boolean _elementDefinition;\r
  44 \r
  45   /**\r
  46    * Field _nsPrefix.\r
  47    */\r
  48   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  49 \r
  50   /**\r
  51    * Field _nsURI.\r
  52    */\r
  53   private java.lang.String _nsURI;\r
  54 \r
  55   /**\r
  56    * Field _xmlName.\r
  57    */\r
  58   private java.lang.String _xmlName;\r
  59 \r
  60   // ----------------/\r
  61   // - Constructors -/\r
  62   // ----------------/\r
  63 \r
  64   public DBRefDescriptor()\r
  65   {\r
  66     super();\r
  67     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  68     _xmlName = "DBRef";\r
  69     _elementDefinition = true;\r
  70 \r
  71     // -- set grouping compositor\r
  72     setCompositorAsSequence();\r
  73     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  74     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  75     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  76     // -- initialize attribute descriptors\r
  77 \r
  78     // -- _source\r
  79     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  80             java.lang.String.class, "_source", "source",\r
  81             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  82     desc.setImmutable(true);\r
  83     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  84     {\r
  85       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  86               throws IllegalStateException\r
  87       {\r
  88         DBRef target = (DBRef) object;\r
  89         return target.getSource();\r
  90       }\r
  91 \r
  92       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  93               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  94       {\r
  95         try\r
  96         {\r
  97           DBRef target = (DBRef) object;\r
  98           target.setSource((java.lang.String) value);\r
  99         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 100         {\r
 101           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 102         }\r
 103       }\r
 104 \r
 105       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 106       {\r
 107         return null;\r
 108       }\r
 109     };\r
 110     desc.setHandler(handler);\r
 111     desc.setMultivalued(false);\r
 112     addFieldDescriptor(desc);\r
 113 \r
 114     // -- validation code for: _source\r
 115     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 116     { // -- local scope\r
 117       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 118       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 119       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 120       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 121     }\r
 122     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 123     // -- _version\r
 124     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 125             java.lang.String.class, "_version", "version",\r
 126             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 127     desc.setImmutable(true);\r
 128     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 129     {\r
 130       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 131               throws IllegalStateException\r
 132       {\r
 133         DBRef target = (DBRef) object;\r
 134         return target.getVersion();\r
 135       }\r
 136 \r
 137       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 138               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 139       {\r
 140         try\r
 141         {\r
 142           DBRef target = (DBRef) object;\r
 143           target.setVersion((java.lang.String) value);\r
 144         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 145         {\r
 146           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 147         }\r
 148       }\r
 149 \r
 150       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 151       {\r
 152         return null;\r
 153       }\r
 154     };\r
 155     desc.setHandler(handler);\r
 156     desc.setMultivalued(false);\r
 157     addFieldDescriptor(desc);\r
 158 \r
 159     // -- validation code for: _version\r
 160     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 161     { // -- local scope\r
 162       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 163       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 164       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 165       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 166     }\r
 167     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 168     // -- _accessionId\r
 169     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 170             java.lang.String.class, "_accessionId", "accessionId",\r
 171             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 172     desc.setImmutable(true);\r
 173     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 174     {\r
 175       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 176               throws IllegalStateException\r
 177       {\r
 178         DBRef target = (DBRef) object;\r
 179         return target.getAccessionId();\r
 180       }\r
 181 \r
 182       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 183               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 184       {\r
 185         try\r
 186         {\r
 187           DBRef target = (DBRef) object;\r
 188           target.setAccessionId((java.lang.String) value);\r
 189         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 190         {\r
 191           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 192         }\r
 193       }\r
 194 \r
 195       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 196       {\r
 197         return null;\r
 198       }\r
 199     };\r
 200     desc.setHandler(handler);\r
 201     desc.setMultivalued(false);\r
 202     addFieldDescriptor(desc);\r
 203 \r
 204     // -- validation code for: _accessionId\r
 205     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 206     { // -- local scope\r
 207       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 208       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 209       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 210       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 211     }\r
 212     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 213     // -- initialize element descriptors\r
 214 \r
 215     // -- _mapping\r
 216     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 217             jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, "_mapping",\r
 218             "Mapping", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 219     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 220     {\r
 221       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 222               throws IllegalStateException\r
 223       {\r
 224         DBRef target = (DBRef) object;\r
 225         return target.getMapping();\r
 226       }\r
 227 \r
 228       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 229               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 230       {\r
 231         try\r
 232         {\r
 233           DBRef target = (DBRef) object;\r
 234           target.setMapping((jalview.schemabinding.version2.Mapping) value);\r
 235         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 236         {\r
 237           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 238         }\r
 239       }\r
 240 \r
 241       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 242       {\r
 243         return new jalview.schemabinding.version2.Mapping();\r
 244       }\r
 245     };\r
 246     desc.setHandler(handler);\r
 247     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 248     desc.setMultivalued(false);\r
 249     addFieldDescriptor(desc);\r
 250 \r
 251     // -- validation code for: _mapping\r
 252     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 253     { // -- local scope\r
 254     }\r
 255     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 256   }\r
 257 \r
 258   // -----------/\r
 259   // - Methods -/\r
 260   // -----------/\r
 261 \r
 262   /**\r
 263    * Method getAccessMode.\r
 264    * \r
 265    * @return the access mode specified for this class.\r
 266    */\r
 267   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 268   {\r
 269     return null;\r
 270   }\r
 271 \r
 272   /**\r
 273    * Method getIdentity.\r
 274    * \r
 275    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 276    */\r
 277   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 278   {\r
 279     return super.getIdentity();\r
 280   }\r
 281 \r
 282   /**\r
 283    * Method getJavaClass.\r
 284    * \r
 285    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 286    */\r
 287   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 288   {\r
 289     return jalview.schemabinding.version2.DBRef.class;\r
 290   }\r
 291 \r
 292   /**\r
 293    * Method getNameSpacePrefix.\r
 294    * \r
 295    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 296    */\r
 297   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 298   {\r
 299     return _nsPrefix;\r
 300   }\r
 301 \r
 302   /**\r
 303    * Method getNameSpaceURI.\r
 304    * \r
 305    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 306    */\r
 307   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 308   {\r
 309     return _nsURI;\r
 310   }\r
 311 \r
 312   /**\r
 313    * Method getValidator.\r
 314    * \r
 315    * @return a specific validator for the class described by this\r
 316    *         ClassDescriptor.\r
 317    */\r
 318   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 319   {\r
 320     return this;\r
 321   }\r
 322 \r
 323   /**\r
 324    * Method getXMLName.\r
 325    * \r
 326    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 327    */\r
 328   public java.lang.String getXMLName()\r
 329   {\r
 330     return _xmlName;\r
 331   }\r
 332 \r
 333   /**\r
 334    * Method isElementDefinition.\r
 335    * \r
 336    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 337    *         element or element with anonymous type definition.\r
 338    */\r
 339   public boolean isElementDefinition()\r
 340   {\r
 341     return _elementDefinition;\r
 342   }\r
 343 \r
 344 }\r