src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/JGroupDescriptor.java

   1 /*
   2  * This class was automatically generated with
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
   4  * Schema.
   5  * $Id$
   6  */
   7
   8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
   9
  10 //---------------------------------/
  11 //- Imported classes and packages -/
  12 //---------------------------------/
  13
  14 import jalview.schemabinding.version2.JGroup;
  15
  16 /**
  17  * Class JGroupDescriptor.
  18  *
  19  * @version $Revision$ $Date$
  20  */
  21 public class JGroupDescriptor extends
  22         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  23 {
  24
  25   // --------------------------/
  26   // - Class/Member Variables -/
  27   // --------------------------/
  28
  29   /**
  30    * Field _elementDefinition.
  31    */
  32   private boolean _elementDefinition;
  33
  34   /**
  35    * Field _nsPrefix.
  36    */
  37   private java.lang.String _nsPrefix;
  38
  39   /**
  40    * Field _nsURI.
  41    */
  42   private java.lang.String _nsURI;
  43
  44   /**
  45    * Field _xmlName.
  46    */
  47   private java.lang.String _xmlName;
  48
  49   // ----------------/
  50   // - Constructors -/
  51   // ----------------/
  52
  53   public JGroupDescriptor()
  54   {
  55     super();
  56     _nsURI = "www.jalview.org";
  57     _xmlName = "JGroup";
  58     _elementDefinition = true;
  59
  60     // -- set grouping compositor
  61     setCompositorAsSequence();
  62     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  63     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  64     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  65     // -- initialize attribute descriptors
  66
  67     // -- _start
  68     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  69             java.lang.Integer.TYPE, "_start", "start",
  70             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  71     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  72     {
  73       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  74               throws IllegalStateException
  75       {
  76         JGroup target = (JGroup) object;
  77         if (!target.hasStart())
  78         {
  79           return null;
  80         }
  81         return new java.lang.Integer(target.getStart());
  82       }
  83
  84       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  85               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  86       {
  87         try
  88         {
  89           JGroup target = (JGroup) object;
  90           // if null, use delete method for optional primitives
  91           if (value == null)
  92           {
  93             target.deleteStart();
  94             return;
  95           }
  96           target.setStart(((java.lang.Integer) value).intValue());
  97         } catch (java.lang.Exception ex)
  98         {
  99           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 100         }
 101       }
 102
 103       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 104       {
 105         return null;
 106       }
 107     };
 108     desc.setHandler(handler);
 109     desc.setMultivalued(false);
 110     addFieldDescriptor(desc);
 111
 112     // -- validation code for: _start
 113     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 114     { // -- local scope
 115       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 116       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 117       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 118       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 119       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 120     }
 121     desc.setValidator(fieldValidator);
 122     // -- _end
 123     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 124             java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end",
 125             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 126     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 127     {
 128       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 129               throws IllegalStateException
 130       {
 131         JGroup target = (JGroup) object;
 132         if (!target.hasEnd())
 133         {
 134           return null;
 135         }
 136         return new java.lang.Integer(target.getEnd());
 137       }
 138
 139       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 140               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 141       {
 142         try
 143         {
 144           JGroup target = (JGroup) object;
 145           // if null, use delete method for optional primitives
 146           if (value == null)
 147           {
 148             target.deleteEnd();
 149             return;
 150           }
 151           target.setEnd(((java.lang.Integer) value).intValue());
 152         } catch (java.lang.Exception ex)
 153         {
 154           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 155         }
 156       }
 157
 158       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 159       {
 160         return null;
 161       }
 162     };
 163     desc.setHandler(handler);
 164     desc.setMultivalued(false);
 165     addFieldDescriptor(desc);
 166
 167     // -- validation code for: _end
 168     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 169     { // -- local scope
 170       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 171       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 172       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 173       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 174       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 175     }
 176     desc.setValidator(fieldValidator);
 177     // -- _name
 178     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 179             java.lang.String.class, "_name", "name",
 180             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 181     desc.setImmutable(true);
 182     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 183     {
 184       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 185               throws IllegalStateException
 186       {
 187         JGroup target = (JGroup) object;
 188         return target.getName();
 189       }
 190
 191       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 192               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 193       {
 194         try
 195         {
 196           JGroup target = (JGroup) object;
 197           target.setName((java.lang.String) value);
 198         } catch (java.lang.Exception ex)
 199         {
 200           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 201         }
 202       }
 203
 204       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 205       {
 206         return null;
 207       }
 208     };
 209     desc.setHandler(handler);
 210     desc.setMultivalued(false);
 211     addFieldDescriptor(desc);
 212
 213     // -- validation code for: _name
 214     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 215     { // -- local scope
 216       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 217       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 218       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 219       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 220     }
 221     desc.setValidator(fieldValidator);
 222     // -- _colour
 223     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 224             java.lang.String.class, "_colour", "colour",
 225             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 226     desc.setImmutable(true);
 227     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 228     {
 229       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 230               throws IllegalStateException
 231       {
 232         JGroup target = (JGroup) object;
 233         return target.getColour();
 234       }
 235
 236       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 237               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 238       {
 239         try
 240         {
 241           JGroup target = (JGroup) object;
 242           target.setColour((java.lang.String) value);
 243         } catch (java.lang.Exception ex)
 244         {
 245           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 246         }
 247       }
 248
 249       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 250       {
 251         return null;
 252       }
 253     };
 254     desc.setHandler(handler);
 255     desc.setMultivalued(false);
 256     addFieldDescriptor(desc);
 257
 258     // -- validation code for: _colour
 259     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 260     { // -- local scope
 261       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 262       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 263       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 264       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 265     }
 266     desc.setValidator(fieldValidator);
 267     // -- _consThreshold
 268     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 269             java.lang.Integer.TYPE, "_consThreshold", "consThreshold",
 270             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 271     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 272     {
 273       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 274               throws IllegalStateException
 275       {
 276         JGroup target = (JGroup) object;
 277         if (!target.hasConsThreshold())
 278         {
 279           return null;
 280         }
 281         return new java.lang.Integer(target.getConsThreshold());
 282       }
 283
 284       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 285               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 286       {
 287         try
 288         {
 289           JGroup target = (JGroup) object;
 290           // if null, use delete method for optional primitives
 291           if (value == null)
 292           {
 293             target.deleteConsThreshold();
 294             return;
 295           }
 296           target.setConsThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());
 297         } catch (java.lang.Exception ex)
 298         {
 299           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 300         }
 301       }
 302
 303       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 304       {
 305         return null;
 306       }
 307     };
 308     desc.setHandler(handler);
 309     desc.setMultivalued(false);
 310     addFieldDescriptor(desc);
 311
 312     // -- validation code for: _consThreshold
 313     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 314     { // -- local scope
 315       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 316       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 317       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 318       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 319       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 320     }
 321     desc.setValidator(fieldValidator);
 322     // -- _pidThreshold
 323     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 324             java.lang.Integer.TYPE, "_pidThreshold", "pidThreshold",
 325             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 326     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 327     {
 328       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 329               throws IllegalStateException
 330       {
 331         JGroup target = (JGroup) object;
 332         if (!target.hasPidThreshold())
 333         {
 334           return null;
 335         }
 336         return new java.lang.Integer(target.getPidThreshold());
 337       }
 338
 339       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 340               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 341       {
 342         try
 343         {
 344           JGroup target = (JGroup) object;
 345           // if null, use delete method for optional primitives
 346           if (value == null)
 347           {
 348             target.deletePidThreshold();
 349             return;
 350           }
 351           target.setPidThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());
 352         } catch (java.lang.Exception ex)
 353         {
 354           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 355         }
 356       }
 357
 358       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 359       {
 360         return null;
 361       }
 362     };
 363     desc.setHandler(handler);
 364     desc.setMultivalued(false);
 365     addFieldDescriptor(desc);
 366
 367     // -- validation code for: _pidThreshold
 368     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 369     { // -- local scope
 370       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 371       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 372       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 373       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 374       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 375     }
 376     desc.setValidator(fieldValidator);
 377     // -- _outlineColour
 378     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 379             java.lang.Integer.TYPE, "_outlineColour", "outlineColour",
 380             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 381     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 382     {
 383       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 384               throws IllegalStateException
 385       {
 386         JGroup target = (JGroup) object;
 387         if (!target.hasOutlineColour())
 388         {
 389           return null;
 390         }
 391         return new java.lang.Integer(target.getOutlineColour());
 392       }
 393
 394       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 395               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 396       {
 397         try
 398         {
 399           JGroup target = (JGroup) object;
 400           // if null, use delete method for optional primitives
 401           if (value == null)
 402           {
 403             target.deleteOutlineColour();
 404             return;
 405           }
 406           target.setOutlineColour(((java.lang.Integer) value).intValue());
 407         } catch (java.lang.Exception ex)
 408         {
 409           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 410         }
 411       }
 412
 413       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 414       {
 415         return null;
 416       }
 417     };
 418     desc.setHandler(handler);
 419     desc.setMultivalued(false);
 420     addFieldDescriptor(desc);
 421
 422     // -- validation code for: _outlineColour
 423     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 424     { // -- local scope
 425       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 426       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 427       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 428       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 429       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 430     }
 431     desc.setValidator(fieldValidator);
 432     // -- _displayBoxes
 433     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 434             java.lang.Boolean.TYPE, "_displayBoxes", "displayBoxes",
 435             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 436     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 437     {
 438       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 439               throws IllegalStateException
 440       {
 441         JGroup target = (JGroup) object;
 442         if (!target.hasDisplayBoxes())
 443         {
 444           return null;
 445         }
 446         return (target.getDisplayBoxes() ? java.lang.Boolean.TRUE
 447                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 448       }
 449
 450       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 451               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 452       {
 453         try
 454         {
 455           JGroup target = (JGroup) object;
 456           // if null, use delete method for optional primitives
 457           if (value == null)
 458           {
 459             target.deleteDisplayBoxes();
 460             return;
 461           }
 462           target.setDisplayBoxes(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 463         } catch (java.lang.Exception ex)
 464         {
 465           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 466         }
 467       }
 468
 469       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 470       {
 471         return null;
 472       }
 473     };
 474     desc.setHandler(handler);
 475     desc.setMultivalued(false);
 476     addFieldDescriptor(desc);
 477
 478     // -- validation code for: _displayBoxes
 479     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 480     { // -- local scope
 481       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 482       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 483       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 484     }
 485     desc.setValidator(fieldValidator);
 486     // -- _displayText
 487     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 488             java.lang.Boolean.TYPE, "_displayText", "displayText",
 489             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 490     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 491     {
 492       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 493               throws IllegalStateException
 494       {
 495         JGroup target = (JGroup) object;
 496         if (!target.hasDisplayText())
 497         {
 498           return null;
 499         }
 500         return (target.getDisplayText() ? java.lang.Boolean.TRUE
 501                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 502       }
 503
 504       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 505               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 506       {
 507         try
 508         {
 509           JGroup target = (JGroup) object;
 510           // if null, use delete method for optional primitives
 511           if (value == null)
 512           {
 513             target.deleteDisplayText();
 514             return;
 515           }
 516           target.setDisplayText(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 517         } catch (java.lang.Exception ex)
 518         {
 519           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 520         }
 521       }
 522
 523       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 524       {
 525         return null;
 526       }
 527     };
 528     desc.setHandler(handler);
 529     desc.setMultivalued(false);
 530     addFieldDescriptor(desc);
 531
 532     // -- validation code for: _displayText
 533     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 534     { // -- local scope
 535       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 536       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 537       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 538     }
 539     desc.setValidator(fieldValidator);
 540     // -- _colourText
 541     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 542             java.lang.Boolean.TYPE, "_colourText", "colourText",
 543             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 544     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 545     {
 546       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 547               throws IllegalStateException
 548       {
 549         JGroup target = (JGroup) object;
 550         if (!target.hasColourText())
 551         {
 552           return null;
 553         }
 554         return (target.getColourText() ? java.lang.Boolean.TRUE
 555                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 556       }
 557
 558       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 559               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 560       {
 561         try
 562         {
 563           JGroup target = (JGroup) object;
 564           // if null, use delete method for optional primitives
 565           if (value == null)
 566           {
 567             target.deleteColourText();
 568             return;
 569           }
 570           target.setColourText(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 571         } catch (java.lang.Exception ex)
 572         {
 573           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 574         }
 575       }
 576
 577       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 578       {
 579         return null;
 580       }
 581     };
 582     desc.setHandler(handler);
 583     desc.setMultivalued(false);
 584     addFieldDescriptor(desc);
 585
 586     // -- validation code for: _colourText
 587     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 588     { // -- local scope
 589       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 590       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 591       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 592     }
 593     desc.setValidator(fieldValidator);
 594     // -- _textCol1
 595     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 596             java.lang.Integer.TYPE, "_textCol1", "textCol1",
 597             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 598     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 599     {
 600       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 601               throws IllegalStateException
 602       {
 603         JGroup target = (JGroup) object;
 604         if (!target.hasTextCol1())
 605         {
 606           return null;
 607         }
 608         return new java.lang.Integer(target.getTextCol1());
 609       }
 610
 611       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 612               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 613       {
 614         try
 615         {
 616           JGroup target = (JGroup) object;
 617           // if null, use delete method for optional primitives
 618           if (value == null)
 619           {
 620             target.deleteTextCol1();
 621             return;
 622           }
 623           target.setTextCol1(((java.lang.Integer) value).intValue());
 624         } catch (java.lang.Exception ex)
 625         {
 626           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 627         }
 628       }
 629
 630       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 631       {
 632         return null;
 633       }
 634     };
 635     desc.setHandler(handler);
 636     desc.setMultivalued(false);
 637     addFieldDescriptor(desc);
 638
 639     // -- validation code for: _textCol1
 640     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 641     { // -- local scope
 642       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 643       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 644       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 645       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 646       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 647     }
 648     desc.setValidator(fieldValidator);
 649     // -- _textCol2
 650     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 651             java.lang.Integer.TYPE, "_textCol2", "textCol2",
 652             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 653     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 654     {
 655       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 656               throws IllegalStateException
 657       {
 658         JGroup target = (JGroup) object;
 659         if (!target.hasTextCol2())
 660         {
 661           return null;
 662         }
 663         return new java.lang.Integer(target.getTextCol2());
 664       }
 665
 666       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 667               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 668       {
 669         try
 670         {
 671           JGroup target = (JGroup) object;
 672           // if null, use delete method for optional primitives
 673           if (value == null)
 674           {
 675             target.deleteTextCol2();
 676             return;
 677           }
 678           target.setTextCol2(((java.lang.Integer) value).intValue());
 679         } catch (java.lang.Exception ex)
 680         {
 681           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 682         }
 683       }
 684
 685       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 686       {
 687         return null;
 688       }
 689     };
 690     desc.setHandler(handler);
 691     desc.setMultivalued(false);
 692     addFieldDescriptor(desc);
 693
 694     // -- validation code for: _textCol2
 695     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 696     { // -- local scope
 697       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 698       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 699       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 700       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 701       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 702     }
 703     desc.setValidator(fieldValidator);
 704     // -- _textColThreshold
 705     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 706             java.lang.Integer.TYPE, "_textColThreshold",
 707             "textColThreshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 708     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 709     {
 710       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 711               throws IllegalStateException
 712       {
 713         JGroup target = (JGroup) object;
 714         if (!target.hasTextColThreshold())
 715         {
 716           return null;
 717         }
 718         return new java.lang.Integer(target.getTextColThreshold());
 719       }
 720
 721       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 722               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 723       {
 724         try
 725         {
 726           JGroup target = (JGroup) object;
 727           // if null, use delete method for optional primitives
 728           if (value == null)
 729           {
 730             target.deleteTextColThreshold();
 731             return;
 732           }
 733           target.setTextColThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());
 734         } catch (java.lang.Exception ex)
 735         {
 736           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 737         }
 738       }
 739
 740       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 741       {
 742         return null;
 743       }
 744     };
 745     desc.setHandler(handler);
 746     desc.setMultivalued(false);
 747     addFieldDescriptor(desc);
 748
 749     // -- validation code for: _textColThreshold
 750     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 751     { // -- local scope
 752       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 753       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 754       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 755       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 756       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 757     }
 758     desc.setValidator(fieldValidator);
 759     // -- _showUnconserved
 760     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 761             java.lang.Boolean.TYPE, "_showUnconserved", "showUnconserved",
 762             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 763     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 764     {
 765       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 766               throws IllegalStateException
 767       {
 768         JGroup target = (JGroup) object;
 769         if (!target.hasShowUnconserved())
 770         {
 771           return null;
 772         }
 773         return (target.getShowUnconserved() ? java.lang.Boolean.TRUE
 774                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 775       }
 776
 777       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 778               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 779       {
 780         try
 781         {
 782           JGroup target = (JGroup) object;
 783           // if null, use delete method for optional primitives
 784           if (value == null)
 785           {
 786             target.deleteShowUnconserved();
 787             return;
 788           }
 789           target.setShowUnconserved(((java.lang.Boolean) value)
 790                   .booleanValue());
 791         } catch (java.lang.Exception ex)
 792         {
 793           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 794         }
 795       }
 796
 797       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 798       {
 799         return null;
 800       }
 801     };
 802     desc.setHandler(handler);
 803     desc.setMultivalued(false);
 804     addFieldDescriptor(desc);
 805
 806     // -- validation code for: _showUnconserved
 807     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 808     { // -- local scope
 809       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 810       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 811       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 812     }
 813     desc.setValidator(fieldValidator);
 814     // -- _ignoreGapsinConsensus
 815     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 816             java.lang.Boolean.TYPE, "_ignoreGapsinConsensus",
 817             "ignoreGapsinConsensus",
 818             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 819     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 820     {
 821       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 822               throws IllegalStateException
 823       {
 824         JGroup target = (JGroup) object;
 825         if (!target.hasIgnoreGapsinConsensus())
 826         {
 827           return null;
 828         }
 829         return (target.getIgnoreGapsinConsensus() ? java.lang.Boolean.TRUE
 830                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 831       }
 832
 833       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 834               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 835       {
 836         try
 837         {
 838           JGroup target = (JGroup) object;
 839           // if null, use delete method for optional primitives
 840           if (value == null)
 841           {
 842             target.deleteIgnoreGapsinConsensus();
 843             return;
 844           }
 845           target.setIgnoreGapsinConsensus(((java.lang.Boolean) value)
 846                   .booleanValue());
 847         } catch (java.lang.Exception ex)
 848         {
 849           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 850         }
 851       }
 852
 853       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 854       {
 855         return null;
 856       }
 857     };
 858     desc.setHandler(handler);
 859     desc.setMultivalued(false);
 860     addFieldDescriptor(desc);
 861
 862     // -- validation code for: _ignoreGapsinConsensus
 863     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 864     { // -- local scope
 865       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 866       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 867       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 868     }
 869     desc.setValidator(fieldValidator);
 870     // -- _showConsensusHistogram
 871     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 872             java.lang.Boolean.TYPE, "_showConsensusHistogram",
 873             "showConsensusHistogram",
 874             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 875     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 876     {
 877       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 878               throws IllegalStateException
 879       {
 880         JGroup target = (JGroup) object;
 881         if (!target.hasShowConsensusHistogram())
 882         {
 883           return null;
 884         }
 885         return (target.getShowConsensusHistogram() ? java.lang.Boolean.TRUE
 886                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 887       }
 888
 889       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 890               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 891       {
 892         try
 893         {
 894           JGroup target = (JGroup) object;
 895           // if null, use delete method for optional primitives
 896           if (value == null)
 897           {
 898             target.deleteShowConsensusHistogram();
 899             return;
 900           }
 901           target.setShowConsensusHistogram(((java.lang.Boolean) value)
 902                   .booleanValue());
 903         } catch (java.lang.Exception ex)
 904         {
 905           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 906         }
 907       }
 908
 909       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 910       {
 911         return null;
 912       }
 913     };
 914     desc.setHandler(handler);
 915     desc.setMultivalued(false);
 916     addFieldDescriptor(desc);
 917
 918     // -- validation code for: _showConsensusHistogram
 919     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 920     { // -- local scope
 921       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 922       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 923       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 924     }
 925     desc.setValidator(fieldValidator);
 926     // -- _showSequenceLogo
 927     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 928             java.lang.Boolean.TYPE, "_showSequenceLogo",
 929             "showSequenceLogo", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 930     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 931     {
 932       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 933               throws IllegalStateException
 934       {
 935         JGroup target = (JGroup) object;
 936         if (!target.hasShowSequenceLogo())
 937         {
 938           return null;
 939         }
 940         return (target.getShowSequenceLogo() ? java.lang.Boolean.TRUE
 941                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 942       }
 943
 944       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 945               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 946       {
 947         try
 948         {
 949           JGroup target = (JGroup) object;
 950           // if null, use delete method for optional primitives
 951           if (value == null)
 952           {
 953             target.deleteShowSequenceLogo();
 954             return;
 955           }
 956           target.setShowSequenceLogo(((java.lang.Boolean) value)
 957                   .booleanValue());
 958         } catch (java.lang.Exception ex)
 959         {
 960           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 961         }
 962       }
 963
 964       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 965       {
 966         return null;
 967       }
 968     };
 969     desc.setHandler(handler);
 970     desc.setMultivalued(false);
 971     addFieldDescriptor(desc);
 972
 973     // -- validation code for: _showSequenceLogo
 974     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 975     { // -- local scope
 976       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 977       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 978       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 979     }
 980     desc.setValidator(fieldValidator);
 981     // -- _normaliseSequenceLogo
 982     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 983             java.lang.Boolean.TYPE, "_normaliseSequenceLogo",
 984             "normaliseSequenceLogo",
 985             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 986     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 987     {
 988       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 989               throws IllegalStateException
 990       {
 991         JGroup target = (JGroup) object;
 992         if (!target.hasNormaliseSequenceLogo())
 993         {
 994           return null;
 995         }
 996         return (target.getNormaliseSequenceLogo() ? java.lang.Boolean.TRUE
 997                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 998       }
 999
1000       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
1001               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
1002       {
1003         try
1004         {
1005           JGroup target = (JGroup) object;
1006           // if null, use delete method for optional primitives
1007           if (value == null)
1008           {
1009             target.deleteNormaliseSequenceLogo();
1010             return;
1011           }
1012           target.setNormaliseSequenceLogo(((java.lang.Boolean) value)
1013                   .booleanValue());
1014         } catch (java.lang.Exception ex)
1015         {
1016           throw new IllegalStateException(ex.toString());
1017         }
1018       }
1019
1020       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
1021       {
1022         return null;
1023       }
1024     };
1025     desc.setHandler(handler);
1026     desc.setMultivalued(false);
1027     addFieldDescriptor(desc);
1028
1029     // -- validation code for: _normaliseSequenceLogo
1030     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
1031     { // -- local scope
1032       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
1033       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
1034       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
1035     }
1036     desc.setValidator(fieldValidator);
1037     // -- _id
1038     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
1039             java.lang.String.class, "_id", "id",
1040             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
1041     desc.setImmutable(true);
1042     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
1043     {
1044       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
1045               throws IllegalStateException
1046       {
1047         JGroup target = (JGroup) object;
1048         return target.getId();
1049       }
1050
1051       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
1052               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
1053       {
1054         try
1055         {
1056           JGroup target = (JGroup) object;
1057           target.setId((java.lang.String) value);
1058         } catch (java.lang.Exception ex)
1059         {
1060           throw new IllegalStateException(ex.toString());
1061         }
1062       }
1063
1064       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
1065       {
1066         return null;
1067       }
1068     };
1069     desc.setHandler(handler);
1070     desc.setMultivalued(false);
1071     addFieldDescriptor(desc);
1072
1073     // -- validation code for: _id
1074     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
1075     { // -- local scope
1076       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
1077       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
1078       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
1079       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
1080     }
1081     desc.setValidator(fieldValidator);
1082     // -- initialize element descriptors
1083
1084     // -- _seqList
1085     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
1086             java.lang.String.class, "_seqList", "seq",
1087             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
1088     desc.setImmutable(true);
1089     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
1090     {
1091       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
1092               throws IllegalStateException
1093       {
1094         JGroup target = (JGroup) object;
1095         return target.getSeq();
1096       }
1097
1098       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
1099               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
1100       {
1101         try
1102         {
1103           JGroup target = (JGroup) object;
1104           target.addSeq((java.lang.String) value);
1105         } catch (java.lang.Exception ex)
1106         {
1107           throw new IllegalStateException(ex.toString());
1108         }
1109       }
1110
1111       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
1112               IllegalArgumentException
1113       {
1114         try
1115         {
1116           JGroup target = (JGroup) object;
1117           target.removeAllSeq();
1118         } catch (java.lang.Exception ex)
1119         {
1120           throw new IllegalStateException(ex.toString());
1121         }
1122       }
1123
1124       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
1125       {
1126         return null;
1127       }
1128     };
1129     desc.setHandler(handler);
1130     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
1131     desc.setRequired(true);
1132     desc.setMultivalued(true);
1133     addFieldDescriptor(desc);
1134
1135     // -- validation code for: _seqList
1136     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
1137     fieldValidator.setMinOccurs(1);
1138     { // -- local scope
1139       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
1140       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
1141       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
1142       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
1143     }
1144     desc.setValidator(fieldValidator);
1145     // -- _annotationColours
1146     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
1147             jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours.class,
1148             "_annotationColours", "annotationColours",
1149             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
1150     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
1151     {
1152       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
1153               throws IllegalStateException
1154       {
1155         JGroup target = (JGroup) object;
1156         return target.getAnnotationColours();
1157       }
1158
1159       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
1160               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
1161       {
1162         try
1163         {
1164           JGroup target = (JGroup) object;
1165           target.setAnnotationColours((jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours) value);
1166         } catch (java.lang.Exception ex)
1167         {
1168           throw new IllegalStateException(ex.toString());
1169         }
1170       }
1171
1172       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
1173       {
1174         return new jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours();
1175       }
1176     };
1177     desc.setHandler(handler);
1178     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
1179     desc.setMultivalued(false);
1180     addFieldDescriptor(desc);
1181
1182     // -- validation code for: _annotationColours
1183     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
1184     { // -- local scope
1185     }
1186     desc.setValidator(fieldValidator);
1187   }
1188
1189   // -----------/
1190   // - Methods -/
1191   // -----------/
1192
1193   /**
1194    * Method getAccessMode.
1195    *
1196    * @return the access mode specified for this class.
1197    */
1198   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
1199   {
1200     return null;
1201   }
1202
1203   /**
1204    * Method getIdentity.
1205    *
1206    * @return the identity field, null if this class has no identity.
1207    */
1208   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
1209   {
1210     return super.getIdentity();
1211   }
1212
1213   /**
1214    * Method getJavaClass.
1215    *
1216    * @return the Java class represented by this descriptor.
1217    */
1218   public java.lang.Class getJavaClass()
1219   {
1220     return jalview.schemabinding.version2.JGroup.class;
1221   }
1222
1223   /**
1224    * Method getNameSpacePrefix.
1225    *
1226    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
1227    */
1228   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
1229   {
1230     return _nsPrefix;
1231   }
1232
1233   /**
1234    * Method getNameSpaceURI.
1235    *
1236    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
1237    */
1238   public java.lang.String getNameSpaceURI()
1239   {
1240     return _nsURI;
1241   }
1242
1243   /**
1244    * Method getValidator.
1245    *
1246    * @return a specific validator for the class described by this
1247    *         ClassDescriptor.
1248    */
1249   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
1250   {
1251     return this;
1252   }
1253
1254   /**
1255    * Method getXMLName.
1256    *
1257    * @return the XML Name for the Class being described.
1258    */
1259   public java.lang.String getXMLName()
1260   {
1261     return _xmlName;
1262   }
1263
1264   /**
1265    * Method isElementDefinition.
1266    *
1267    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
1268    *         element or element with anonymous type definition.
1269    */
1270   public boolean isElementDefinition()
1271   {
1272     return _elementDefinition;
1273   }
1274
1275 }