src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/JSeqDescriptor.java

   1 /*
   2  * This class was automatically generated with
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
   4  * Schema.
   5  * $Id$
   6  */
   7
   8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
   9
  10   //---------------------------------/
  11  //- Imported classes and packages -/
  12 //---------------------------------/
  13
  14 import jalview.schemabinding.version2.JSeq;
  15
  16 /**
  17  * Class JSeqDescriptor.
  18  *
  19  * @version $Revision$ $Date$
  20  */
  21 public class JSeqDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {
  22
  23
  24       //--------------------------/
  25      //- Class/Member Variables -/
  26     //--------------------------/
  27
  28     /**
  29      * Field _elementDefinition.
  30      */
  31     private boolean _elementDefinition;
  32
  33     /**
  34      * Field _nsPrefix.
  35      */
  36     private java.lang.String _nsPrefix;
  37
  38     /**
  39      * Field _nsURI.
  40      */
  41     private java.lang.String _nsURI;
  42
  43     /**
  44      * Field _xmlName.
  45      */
  46     private java.lang.String _xmlName;
  47
  48
  49       //----------------/
  50      //- Constructors -/
  51     //----------------/
  52
  53     public JSeqDescriptor() {
  54         super();
  55         _nsURI = "www.jalview.org";
  56         _xmlName = "JSeq";
  57         _elementDefinition = true;
  58
  59         //-- set grouping compositor
  60         setCompositorAsSequence();
  61         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;
  62         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;
  63         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;
  64         //-- initialize attribute descriptors
  65
  66         //-- _colour
  67         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_colour", "colour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  68         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
  69             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
  70                 throws IllegalStateException
  71             {
  72                 JSeq target = (JSeq) object;
  73                 if (!target.hasColour()) { return null; }
  74                 return new java.lang.Integer(target.getColour());
  75             }
  76             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  77                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  78             {
  79                 try {
  80                     JSeq target = (JSeq) object;
  81                     // if null, use delete method for optional primitives
  82                     if (value == null) {
  83                         target.deleteColour();
  84                         return;
  85                     }
  86                     target.setColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());
  87                 } catch (java.lang.Exception ex) {
  88                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
  89                 }
  90             }
  91             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
  92                 return null;
  93             }
  94         };
  95         desc.setHandler(handler);
  96         desc.setMultivalued(false);
  97         addFieldDescriptor(desc);
  98
  99         //-- validation code for: _colour
 100         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 101         { //-- local scope
 102             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 103             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 104             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 105             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 106             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 107         }
 108         desc.setValidator(fieldValidator);
 109         //-- _start
 110         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_start", "start", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 111         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 112             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 113                 throws IllegalStateException
 114             {
 115                 JSeq target = (JSeq) object;
 116                 if (!target.hasStart()) { return null; }
 117                 return new java.lang.Integer(target.getStart());
 118             }
 119             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 120                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 121             {
 122                 try {
 123                     JSeq target = (JSeq) object;
 124                     // ignore null values for non optional primitives
 125                     if (value == null) { return; }
 126
 127                     target.setStart( ((java.lang.Integer) value).intValue());
 128                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 129                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 130                 }
 131             }
 132             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 133                 return null;
 134             }
 135         };
 136         desc.setHandler(handler);
 137         desc.setRequired(true);
 138         desc.setMultivalued(false);
 139         addFieldDescriptor(desc);
 140
 141         //-- validation code for: _start
 142         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 143         fieldValidator.setMinOccurs(1);
 144         { //-- local scope
 145             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 146             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 147             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 148             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 149             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 150         }
 151         desc.setValidator(fieldValidator);
 152         //-- _end
 153         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 154         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 155             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 156                 throws IllegalStateException
 157             {
 158                 JSeq target = (JSeq) object;
 159                 if (!target.hasEnd()) { return null; }
 160                 return new java.lang.Integer(target.getEnd());
 161             }
 162             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 163                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 164             {
 165                 try {
 166                     JSeq target = (JSeq) object;
 167                     // ignore null values for non optional primitives
 168                     if (value == null) { return; }
 169
 170                     target.setEnd( ((java.lang.Integer) value).intValue());
 171                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 172                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 173                 }
 174             }
 175             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 176                 return null;
 177             }
 178         };
 179         desc.setHandler(handler);
 180         desc.setRequired(true);
 181         desc.setMultivalued(false);
 182         addFieldDescriptor(desc);
 183
 184         //-- validation code for: _end
 185         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 186         fieldValidator.setMinOccurs(1);
 187         { //-- local scope
 188             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 189             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 190             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 191             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 192             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 193         }
 194         desc.setValidator(fieldValidator);
 195         //-- _id
 196         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 197         desc.setImmutable(true);
 198         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 199             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 200                 throws IllegalStateException
 201             {
 202                 JSeq target = (JSeq) object;
 203                 return target.getId();
 204             }
 205             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 206                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 207             {
 208                 try {
 209                     JSeq target = (JSeq) object;
 210                     target.setId( (java.lang.String) value);
 211                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 212                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 213                 }
 214             }
 215             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 216                 return null;
 217             }
 218         };
 219         desc.setHandler(handler);
 220         desc.setRequired(true);
 221         desc.setMultivalued(false);
 222         addFieldDescriptor(desc);
 223
 224         //-- validation code for: _id
 225         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 226         fieldValidator.setMinOccurs(1);
 227         { //-- local scope
 228             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 229             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 230             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 231             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 232         }
 233         desc.setValidator(fieldValidator);
 234         //-- _hidden
 235         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_hidden", "hidden", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 236         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 237             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 238                 throws IllegalStateException
 239             {
 240                 JSeq target = (JSeq) object;
 241                 if (!target.hasHidden()) { return null; }
 242                 return (target.getHidden() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);
 243             }
 244             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 245                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 246             {
 247                 try {
 248                     JSeq target = (JSeq) object;
 249                     // if null, use delete method for optional primitives
 250                     if (value == null) {
 251                         target.deleteHidden();
 252                         return;
 253                     }
 254                     target.setHidden( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 255                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 256                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 257                 }
 258             }
 259             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 260                 return null;
 261             }
 262         };
 263         desc.setHandler(handler);
 264         desc.setMultivalued(false);
 265         addFieldDescriptor(desc);
 266
 267         //-- validation code for: _hidden
 268         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 269         { //-- local scope
 270             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 271             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 272             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 273         }
 274         desc.setValidator(fieldValidator);
 275         //-- initialize element descriptors
 276
 277         //-- _featuresList
 278         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.Features.class, "_featuresList", "features", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 279         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 280             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 281                 throws IllegalStateException
 282             {
 283                 JSeq target = (JSeq) object;
 284                 return target.getFeatures();
 285             }
 286             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 287                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 288             {
 289                 try {
 290                     JSeq target = (JSeq) object;
 291                     target.addFeatures( (jalview.schemabinding.version2.Features) value);
 292                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 293                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 294                 }
 295             }
 296             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {
 297                 try {
 298                     JSeq target = (JSeq) object;
 299                     target.removeAllFeatures();
 300                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 301                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 302                 }
 303             }
 304             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 305                 return new jalview.schemabinding.version2.Features();
 306             }
 307         };
 308         desc.setHandler(handler);
 309         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 310         desc.setMultivalued(true);
 311         addFieldDescriptor(desc);
 312
 313         //-- validation code for: _featuresList
 314         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 315         fieldValidator.setMinOccurs(0);
 316         { //-- local scope
 317         }
 318         desc.setValidator(fieldValidator);
 319         //-- _pdbidsList
 320         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.Pdbids.class, "_pdbidsList", "pdbids", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 321         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 322             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 323                 throws IllegalStateException
 324             {
 325                 JSeq target = (JSeq) object;
 326                 return target.getPdbids();
 327             }
 328             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 329                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 330             {
 331                 try {
 332                     JSeq target = (JSeq) object;
 333                     target.addPdbids( (jalview.schemabinding.version2.Pdbids) value);
 334                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 335                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 336                 }
 337             }
 338             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {
 339                 try {
 340                     JSeq target = (JSeq) object;
 341                     target.removeAllPdbids();
 342                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 343                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 344                 }
 345             }
 346             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 347                 return new jalview.schemabinding.version2.Pdbids();
 348             }
 349         };
 350         desc.setHandler(handler);
 351         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 352         desc.setMultivalued(true);
 353         addFieldDescriptor(desc);
 354
 355         //-- validation code for: _pdbidsList
 356         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 357         fieldValidator.setMinOccurs(0);
 358         { //-- local scope
 359         }
 360         desc.setValidator(fieldValidator);
 361         //-- _hiddenSequencesList
 362         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_hiddenSequencesList", "hiddenSequences", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 363         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 364             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 365                 throws IllegalStateException
 366             {
 367                 JSeq target = (JSeq) object;
 368                 return target.getHiddenSequences();
 369             }
 370             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 371                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 372             {
 373                 try {
 374                     JSeq target = (JSeq) object;
 375                     // ignore null values for non optional primitives
 376                     if (value == null) { return; }
 377
 378                     target.addHiddenSequences( ((java.lang.Integer) value).intValue());
 379                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 380                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 381                 }
 382             }
 383             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {
 384                 try {
 385                     JSeq target = (JSeq) object;
 386                     target.removeAllHiddenSequences();
 387                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 388                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 389                 }
 390             }
 391             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 392                 return null;
 393             }
 394         };
 395         desc.setHandler(handler);
 396         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 397         desc.setMultivalued(true);
 398         addFieldDescriptor(desc);
 399
 400         //-- validation code for: _hiddenSequencesList
 401         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 402         fieldValidator.setMinOccurs(0);
 403         { //-- local scope
 404             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 405             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 406             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 407             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 408             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 409         }
 410         desc.setValidator(fieldValidator);
 411     }
 412
 413
 414       //-----------/
 415      //- Methods -/
 416     //-----------/
 417
 418     /**
 419      * Method getAccessMode.
 420      *
 421      * @return the access mode specified for this class.
 422      */
 423     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(
 424     ) {
 425         return null;
 426     }
 427
 428     /**
 429      * Method getIdentity.
 430      *
 431      * @return the identity field, null if this class has no
 432      * identity.
 433      */
 434     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(
 435     ) {
 436         return super.getIdentity();
 437     }
 438
 439     /**
 440      * Method getJavaClass.
 441      *
 442      * @return the Java class represented by this descriptor.
 443      */
 444     public java.lang.Class getJavaClass(
 445     ) {
 446         return jalview.schemabinding.version2.JSeq.class;
 447     }
 448
 449     /**
 450      * Method getNameSpacePrefix.
 451      *
 452      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 453      */
 454     public java.lang.String getNameSpacePrefix(
 455     ) {
 456         return _nsPrefix;
 457     }
 458
 459     /**
 460      * Method getNameSpaceURI.
 461      *
 462      * @return the namespace URI used when marshaling and
 463      * unmarshaling as XML.
 464      */
 465     public java.lang.String getNameSpaceURI(
 466     ) {
 467         return _nsURI;
 468     }
 469
 470     /**
 471      * Method getValidator.
 472      *
 473      * @return a specific validator for the class described by this
 474      * ClassDescriptor.
 475      */
 476     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(
 477     ) {
 478         return this;
 479     }
 480
 481     /**
 482      * Method getXMLName.
 483      *
 484      * @return the XML Name for the Class being described.
 485      */
 486     public java.lang.String getXMLName(
 487     ) {
 488         return _xmlName;
 489     }
 490
 491     /**
 492      * Method isElementDefinition.
 493      *
 494      * @return true if XML schema definition of this Class is that
 495      * of a global
 496      * element or element with anonymous type definition.
 497      */
 498     public boolean isElementDefinition(
 499     ) {
 500         return _elementDefinition;
 501     }
 502
 503 }