src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/JalviewModelSequenceDescriptor.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
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  18  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  19  ******************************************************************************/
  20 /*
  21  * This class was automatically generated with
  22  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  23  * Schema.
  24  * $Id$
  25  */
  26
  27 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  28
  29 //---------------------------------/
  30 //- Imported classes and packages -/
  31 //---------------------------------/
  32
  33 import jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence;
  34
  35 /**
  36  * Class JalviewModelSequenceDescriptor.
  37  *
  38  * @version $Revision$ $Date$
  39  */
  40 public class JalviewModelSequenceDescriptor extends
  41         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  42 {
  43
  44   // --------------------------/
  45   // - Class/Member Variables -/
  46   // --------------------------/
  47
  48   /**
  49    * Field _elementDefinition.
  50    */
  51   private boolean _elementDefinition;
  52
  53   /**
  54    * Field _nsPrefix.
  55    */
  56   private java.lang.String _nsPrefix;
  57
  58   /**
  59    * Field _nsURI.
  60    */
  61   private java.lang.String _nsURI;
  62
  63   /**
  64    * Field _xmlName.
  65    */
  66   private java.lang.String _xmlName;
  67
  68   // ----------------/
  69   // - Constructors -/
  70   // ----------------/
  71
  72   public JalviewModelSequenceDescriptor()
  73   {
  74     super();
  75     _nsURI = "www.jalview.org";
  76     _elementDefinition = false;
  77
  78     // -- set grouping compositor
  79     setCompositorAsSequence();
  80     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  81     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  82     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  83     // -- initialize attribute descriptors
  84
  85     // -- initialize element descriptors
  86
  87     // -- _JSeqList
  88     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  89             jalview.schemabinding.version2.JSeq.class, "_JSeqList", "JSeq",
  90             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
  91     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  92     {
  93       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  94               throws IllegalStateException
  95       {
  96         JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
  97         return target.getJSeq();
  98       }
  99
 100       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 101               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 102       {
 103         try
 104         {
 105           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 106           target.addJSeq((jalview.schemabinding.version2.JSeq) value);
 107         } catch (java.lang.Exception ex)
 108         {
 109           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 110         }
 111       }
 112
 113       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 114               IllegalArgumentException
 115       {
 116         try
 117         {
 118           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 119           target.removeAllJSeq();
 120         } catch (java.lang.Exception ex)
 121         {
 122           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 123         }
 124       }
 125
 126       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 127       {
 128         return new jalview.schemabinding.version2.JSeq();
 129       }
 130     };
 131     desc.setHandler(handler);
 132     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 133     desc.setMultivalued(true);
 134     addFieldDescriptor(desc);
 135
 136     // -- validation code for: _JSeqList
 137     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 138     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 139     { // -- local scope
 140     }
 141     desc.setValidator(fieldValidator);
 142     // -- _JGroupList
 143     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 144             jalview.schemabinding.version2.JGroup.class, "_JGroupList",
 145             "JGroup", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 146     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 147     {
 148       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 149               throws IllegalStateException
 150       {
 151         JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 152         return target.getJGroup();
 153       }
 154
 155       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 156               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 157       {
 158         try
 159         {
 160           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 161           target.addJGroup((jalview.schemabinding.version2.JGroup) value);
 162         } catch (java.lang.Exception ex)
 163         {
 164           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 165         }
 166       }
 167
 168       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 169               IllegalArgumentException
 170       {
 171         try
 172         {
 173           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 174           target.removeAllJGroup();
 175         } catch (java.lang.Exception ex)
 176         {
 177           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 178         }
 179       }
 180
 181       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 182       {
 183         return new jalview.schemabinding.version2.JGroup();
 184       }
 185     };
 186     desc.setHandler(handler);
 187     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 188     desc.setMultivalued(true);
 189     addFieldDescriptor(desc);
 190
 191     // -- validation code for: _JGroupList
 192     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 193     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 194     { // -- local scope
 195     }
 196     desc.setValidator(fieldValidator);
 197     // -- _viewportList
 198     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 199             jalview.schemabinding.version2.Viewport.class, "_viewportList",
 200             "Viewport", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 201     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 202     {
 203       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 204               throws IllegalStateException
 205       {
 206         JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 207         return target.getViewport();
 208       }
 209
 210       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 211               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 212       {
 213         try
 214         {
 215           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 216           target.addViewport((jalview.schemabinding.version2.Viewport) value);
 217         } catch (java.lang.Exception ex)
 218         {
 219           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 220         }
 221       }
 222
 223       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 224               IllegalArgumentException
 225       {
 226         try
 227         {
 228           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 229           target.removeAllViewport();
 230         } catch (java.lang.Exception ex)
 231         {
 232           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 233         }
 234       }
 235
 236       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 237       {
 238         return new jalview.schemabinding.version2.Viewport();
 239       }
 240     };
 241     desc.setHandler(handler);
 242     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 243     desc.setMultivalued(true);
 244     addFieldDescriptor(desc);
 245
 246     // -- validation code for: _viewportList
 247     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 248     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 249     { // -- local scope
 250     }
 251     desc.setValidator(fieldValidator);
 252     // -- _userColoursList
 253     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 254             jalview.schemabinding.version2.UserColours.class,
 255             "_userColoursList", "UserColours",
 256             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 257     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 258     {
 259       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 260               throws IllegalStateException
 261       {
 262         JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 263         return target.getUserColours();
 264       }
 265
 266       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 267               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 268       {
 269         try
 270         {
 271           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 272           target.addUserColours((jalview.schemabinding.version2.UserColours) value);
 273         } catch (java.lang.Exception ex)
 274         {
 275           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 276         }
 277       }
 278
 279       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 280               IllegalArgumentException
 281       {
 282         try
 283         {
 284           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 285           target.removeAllUserColours();
 286         } catch (java.lang.Exception ex)
 287         {
 288           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 289         }
 290       }
 291
 292       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 293       {
 294         return new jalview.schemabinding.version2.UserColours();
 295       }
 296     };
 297     desc.setHandler(handler);
 298     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 299     desc.setMultivalued(true);
 300     addFieldDescriptor(desc);
 301
 302     // -- validation code for: _userColoursList
 303     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 304     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 305     { // -- local scope
 306     }
 307     desc.setValidator(fieldValidator);
 308     // -- _treeList
 309     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 310             jalview.schemabinding.version2.Tree.class, "_treeList", "tree",
 311             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 312     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 313     {
 314       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 315               throws IllegalStateException
 316       {
 317         JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 318         return target.getTree();
 319       }
 320
 321       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 322               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 323       {
 324         try
 325         {
 326           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 327           target.addTree((jalview.schemabinding.version2.Tree) value);
 328         } catch (java.lang.Exception ex)
 329         {
 330           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 331         }
 332       }
 333
 334       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 335               IllegalArgumentException
 336       {
 337         try
 338         {
 339           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 340           target.removeAllTree();
 341         } catch (java.lang.Exception ex)
 342         {
 343           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 344         }
 345       }
 346
 347       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 348       {
 349         return new jalview.schemabinding.version2.Tree();
 350       }
 351     };
 352     desc.setHandler(handler);
 353     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 354     desc.setMultivalued(true);
 355     addFieldDescriptor(desc);
 356
 357     // -- validation code for: _treeList
 358     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 359     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 360     { // -- local scope
 361     }
 362     desc.setValidator(fieldValidator);
 363     // -- _featureSettings
 364     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 365             jalview.schemabinding.version2.FeatureSettings.class,
 366             "_featureSettings", "FeatureSettings",
 367             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 368     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 369     {
 370       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 371               throws IllegalStateException
 372       {
 373         JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 374         return target.getFeatureSettings();
 375       }
 376
 377       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 378               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 379       {
 380         try
 381         {
 382           JalviewModelSequence target = (JalviewModelSequence) object;
 383           target.setFeatureSettings((jalview.schemabinding.version2.FeatureSettings) value);
 384         } catch (java.lang.Exception ex)
 385         {
 386           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 387         }
 388       }
 389
 390       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 391       {
 392         return new jalview.schemabinding.version2.FeatureSettings();
 393       }
 394     };
 395     desc.setHandler(handler);
 396     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 397     desc.setMultivalued(false);
 398     addFieldDescriptor(desc);
 399
 400     // -- validation code for: _featureSettings
 401     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 402     { // -- local scope
 403     }
 404     desc.setValidator(fieldValidator);
 405   }
 406
 407   // -----------/
 408   // - Methods -/
 409   // -----------/
 410
 411   /**
 412    * Method getAccessMode.
 413    *
 414    * @return the access mode specified for this class.
 415    */
 416   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 417   {
 418     return null;
 419   }
 420
 421   /**
 422    * Method getIdentity.
 423    *
 424    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 425    */
 426   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 427   {
 428     return super.getIdentity();
 429   }
 430
 431   /**
 432    * Method getJavaClass.
 433    *
 434    * @return the Java class represented by this descriptor.
 435    */
 436   public java.lang.Class getJavaClass()
 437   {
 438     return jalview.schemabinding.version2.JalviewModelSequence.class;
 439   }
 440
 441   /**
 442    * Method getNameSpacePrefix.
 443    *
 444    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 445    */
 446   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 447   {
 448     return _nsPrefix;
 449   }
 450
 451   /**
 452    * Method getNameSpaceURI.
 453    *
 454    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 455    */
 456   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 457   {
 458     return _nsURI;
 459   }
 460
 461   /**
 462    * Method getValidator.
 463    *
 464    * @return a specific validator for the class described by this
 465    *         ClassDescriptor.
 466    */
 467   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 468   {
 469     return this;
 470   }
 471
 472   /**
 473    * Method getXMLName.
 474    *
 475    * @return the XML Name for the Class being described.
 476    */
 477   public java.lang.String getXMLName()
 478   {
 479     return _xmlName;
 480   }
 481
 482   /**
 483    * Method isElementDefinition.
 484    *
 485    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 486    *         element or element with anonymous type definition.
 487    */
 488   public boolean isElementDefinition()
 489   {
 490     return _elementDefinition;
 491   }
 492
 493 }