src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/SequenceDescriptor.java

   1 /*******************************************************************************
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  19  ******************************************************************************/
  20 /*
  21  * This class was automatically generated with
  22  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  23  * Schema.
  24  * $Id$
  25  */
  26
  27 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  28
  29 //---------------------------------/
  30 //- Imported classes and packages -/
  31 //---------------------------------/
  32
  33 import jalview.schemabinding.version2.Sequence;
  34
  35 /**
  36  * Class SequenceDescriptor.
  37  *
  38  * @version $Revision$ $Date$
  39  */
  40 public class SequenceDescriptor extends
  41         jalview.schemabinding.version2.descriptors.SequenceTypeDescriptor
  42 {
  43
  44   // --------------------------/
  45   // - Class/Member Variables -/
  46   // --------------------------/
  47
  48   /**
  49    * Field _elementDefinition.
  50    */
  51   private boolean _elementDefinition;
  52
  53   /**
  54    * Field _nsPrefix.
  55    */
  56   private java.lang.String _nsPrefix;
  57
  58   /**
  59    * Field _nsURI.
  60    */
  61   private java.lang.String _nsURI;
  62
  63   /**
  64    * Field _xmlName.
  65    */
  66   private java.lang.String _xmlName;
  67
  68   // ----------------/
  69   // - Constructors -/
  70   // ----------------/
  71
  72   public SequenceDescriptor()
  73   {
  74     super();
  75     setExtendsWithoutFlatten(new jalview.schemabinding.version2.descriptors.SequenceTypeDescriptor());
  76     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  77     _xmlName = "Sequence";
  78     _elementDefinition = true;
  79
  80     // -- set grouping compositor
  81     setCompositorAsSequence();
  82     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  83     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  84     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  85     // -- initialize attribute descriptors
  86
  87     // -- _dsseqid
  88     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  89             java.lang.String.class, "_dsseqid", "dsseqid",
  90             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  91     desc.setImmutable(true);
  92     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  93     {
  94       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  95               throws IllegalStateException
  96       {
  97         Sequence target = (Sequence) object;
  98         return target.getDsseqid();
  99       }
 100
 101       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 102               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 103       {
 104         try
 105         {
 106           Sequence target = (Sequence) object;
 107           target.setDsseqid((java.lang.String) value);
 108         } catch (java.lang.Exception ex)
 109         {
 110           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 111         }
 112       }
 113
 114       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 115       {
 116         return null;
 117       }
 118     };
 119     desc.setHandler(handler);
 120     desc.setMultivalued(false);
 121     addFieldDescriptor(desc);
 122
 123     // -- validation code for: _dsseqid
 124     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 125     { // -- local scope
 126       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 127       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 128       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 129       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 130     }
 131     desc.setValidator(fieldValidator);
 132     // -- initialize element descriptors
 133
 134     // -- _DBRefList
 135     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 136             jalview.schemabinding.version2.DBRef.class, "_DBRefList",
 137             "DBRef", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 138     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 139     {
 140       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 141               throws IllegalStateException
 142       {
 143         Sequence target = (Sequence) object;
 144         return target.getDBRef();
 145       }
 146
 147       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 148               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 149       {
 150         try
 151         {
 152           Sequence target = (Sequence) object;
 153           target.addDBRef((jalview.schemabinding.version2.DBRef) value);
 154         } catch (java.lang.Exception ex)
 155         {
 156           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 157         }
 158       }
 159
 160       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 161               IllegalArgumentException
 162       {
 163         try
 164         {
 165           Sequence target = (Sequence) object;
 166           target.removeAllDBRef();
 167         } catch (java.lang.Exception ex)
 168         {
 169           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 170         }
 171       }
 172
 173       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 174       {
 175         return new jalview.schemabinding.version2.DBRef();
 176       }
 177     };
 178     desc.setHandler(handler);
 179     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 180     desc.setMultivalued(true);
 181     addFieldDescriptor(desc);
 182
 183     // -- validation code for: _DBRefList
 184     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 185     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 186     { // -- local scope
 187     }
 188     desc.setValidator(fieldValidator);
 189   }
 190
 191   // -----------/
 192   // - Methods -/
 193   // -----------/
 194
 195   /**
 196    * Method getAccessMode.
 197    *
 198    * @return the access mode specified for this class.
 199    */
 200   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 201   {
 202     return null;
 203   }
 204
 205   /**
 206    * Method getIdentity.
 207    *
 208    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 209    */
 210   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 211   {
 212     return super.getIdentity();
 213   }
 214
 215   /**
 216    * Method getJavaClass.
 217    *
 218    * @return the Java class represented by this descriptor.
 219    */
 220   public java.lang.Class getJavaClass()
 221   {
 222     return jalview.schemabinding.version2.Sequence.class;
 223   }
 224
 225   /**
 226    * Method getNameSpacePrefix.
 227    *
 228    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 229    */
 230   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 231   {
 232     return _nsPrefix;
 233   }
 234
 235   /**
 236    * Method getNameSpaceURI.
 237    *
 238    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 239    */
 240   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 241   {
 242     return _nsURI;
 243   }
 244
 245   /**
 246    * Method getValidator.
 247    *
 248    * @return a specific validator for the class described by this
 249    *         ClassDescriptor.
 250    */
 251   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 252   {
 253     return this;
 254   }
 255
 256   /**
 257    * Method getXMLName.
 258    *
 259    * @return the XML Name for the Class being described.
 260    */
 261   public java.lang.String getXMLName()
 262   {
 263     return _xmlName;
 264   }
 265
 266   /**
 267    * Method isElementDefinition.
 268    *
 269    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 270    *         element or element with anonymous type definition.
 271    */
 272   public boolean isElementDefinition()
 273   {
 274     return _elementDefinition;
 275   }
 276
 277 }