src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/SequenceDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import jalview.schemabinding.version2.Sequence;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class SequenceDescriptor.\r
  18  * \r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class SequenceDescriptor extends jalview.schemabinding.version2.descriptors.SequenceTypeDescriptor {\r
  22 \r
  23 \r
  24       //--------------------------/\r
  25      //- Class/Member Variables -/\r
  26     //--------------------------/\r
  27 \r
  28     /**\r
  29      * Field _elementDefinition.\r
  30      */\r
  31     private boolean _elementDefinition;\r
  32 \r
  33     /**\r
  34      * Field _nsPrefix.\r
  35      */\r
  36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  37 \r
  38     /**\r
  39      * Field _nsURI.\r
  40      */\r
  41     private java.lang.String _nsURI;\r
  42 \r
  43     /**\r
  44      * Field _xmlName.\r
  45      */\r
  46     private java.lang.String _xmlName;\r
  47 \r
  48 \r
  49       //----------------/\r
  50      //- Constructors -/\r
  51     //----------------/\r
  52 \r
  53     public SequenceDescriptor() {\r
  54         super();\r
  55         setExtendsWithoutFlatten(new jalview.schemabinding.version2.descriptors.SequenceTypeDescriptor());\r
  56         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  57         _xmlName = "Sequence";\r
  58         _elementDefinition = true;\r
  59         \r
  60         //-- set grouping compositor\r
  61         setCompositorAsSequence();\r
  62         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  63         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  64         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  65         //-- initialize attribute descriptors\r
  66         \r
  67         //-- _dsseqid\r
  68         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_dsseqid", "dsseqid", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  69         desc.setImmutable(true);\r
  70         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  71             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  72                 throws IllegalStateException\r
  73             {\r
  74                 Sequence target = (Sequence) object;\r
  75                 return target.getDsseqid();\r
  76             }\r
  77             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  78                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  79             {\r
  80                 try {\r
  81                     Sequence target = (Sequence) object;\r
  82                     target.setDsseqid( (java.lang.String) value);\r
  83                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  84                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  85                 }\r
  86             }\r
  87             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
  88                 return null;\r
  89             }\r
  90         };\r
  91         desc.setHandler(handler);\r
  92         desc.setMultivalued(false);\r
  93         addFieldDescriptor(desc);\r
  94         \r
  95         //-- validation code for: _dsseqid\r
  96         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
  97         { //-- local scope\r
  98             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
  99             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 100             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 101             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 102         }\r
 103         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 104         //-- initialize element descriptors\r
 105         \r
 106         //-- _DBRefList\r
 107         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.DBRef.class, "_DBRefList", "DBRef", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 108         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 109             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 110                 throws IllegalStateException\r
 111             {\r
 112                 Sequence target = (Sequence) object;\r
 113                 return target.getDBRef();\r
 114             }\r
 115             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 116                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 117             {\r
 118                 try {\r
 119                     Sequence target = (Sequence) object;\r
 120                     target.addDBRef( (jalview.schemabinding.version2.DBRef) value);\r
 121                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 122                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 123                 }\r
 124             }\r
 125             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 126                 try {\r
 127                     Sequence target = (Sequence) object;\r
 128                     target.removeAllDBRef();\r
 129                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 130                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 131                 }\r
 132             }\r
 133             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 134                 return new jalview.schemabinding.version2.DBRef();\r
 135             }\r
 136         };\r
 137         desc.setHandler(handler);\r
 138         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 139         desc.setMultivalued(true);\r
 140         addFieldDescriptor(desc);\r
 141         \r
 142         //-- validation code for: _DBRefList\r
 143         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 144         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 145         { //-- local scope\r
 146         }\r
 147         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 148     }\r
 149 \r
 150 \r
 151       //-----------/\r
 152      //- Methods -/\r
 153     //-----------/\r
 154 \r
 155     /**\r
 156      * Method getAccessMode.\r
 157      * \r
 158      * @return the access mode specified for this class.\r
 159      */\r
 160     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 161     ) {\r
 162         return null;\r
 163     }\r
 164 \r
 165     /**\r
 166      * Method getIdentity.\r
 167      * \r
 168      * @return the identity field, null if this class has no\r
 169      * identity.\r
 170      */\r
 171     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 172     ) {\r
 173         return super.getIdentity();\r
 174     }\r
 175 \r
 176     /**\r
 177      * Method getJavaClass.\r
 178      * \r
 179      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 180      */\r
 181     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 182     ) {\r
 183         return jalview.schemabinding.version2.Sequence.class;\r
 184     }\r
 185 \r
 186     /**\r
 187      * Method getNameSpacePrefix.\r
 188      * \r
 189      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 190      */\r
 191     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 192     ) {\r
 193         return _nsPrefix;\r
 194     }\r
 195 \r
 196     /**\r
 197      * Method getNameSpaceURI.\r
 198      * \r
 199      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 200      * unmarshaling as XML.\r
 201      */\r
 202     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 203     ) {\r
 204         return _nsURI;\r
 205     }\r
 206 \r
 207     /**\r
 208      * Method getValidator.\r
 209      * \r
 210      * @return a specific validator for the class described by this\r
 211      * ClassDescriptor.\r
 212      */\r
 213     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 214     ) {\r
 215         return this;\r
 216     }\r
 217 \r
 218     /**\r
 219      * Method getXMLName.\r
 220      * \r
 221      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 222      */\r
 223     public java.lang.String getXMLName(\r
 224     ) {\r
 225         return _xmlName;\r
 226     }\r
 227 \r
 228     /**\r
 229      * Method isElementDefinition.\r
 230      * \r
 231      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 232      * of a global\r
 233      * element or element with anonymous type definition.\r
 234      */\r
 235     public boolean isElementDefinition(\r
 236     ) {\r
 237         return _elementDefinition;\r
 238     }\r
 239 \r
 240 }\r