src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/SequenceTypeDescriptor.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  *******************************************************************************/
  18 /*
  19  * This class was automatically generated with
  20  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  21  * Schema.
  22  * $Id$
  23  */
  24
  25 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  26
  27   //---------------------------------/
  28  //- Imported classes and packages -/
  29 //---------------------------------/
  30
  31 import jalview.schemabinding.version2.SequenceType;
  32
  33 /**
  34  * Class SequenceTypeDescriptor.
  35  *
  36  * @version $Revision$ $Date$
  37  */
  38 public class SequenceTypeDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {
  39
  40
  41       //--------------------------/
  42      //- Class/Member Variables -/
  43     //--------------------------/
  44
  45     /**
  46      * Field _elementDefinition.
  47      */
  48     private boolean _elementDefinition;
  49
  50     /**
  51      * Field _nsPrefix.
  52      */
  53     private java.lang.String _nsPrefix;
  54
  55     /**
  56      * Field _nsURI.
  57      */
  58     private java.lang.String _nsURI;
  59
  60     /**
  61      * Field _xmlName.
  62      */
  63     private java.lang.String _xmlName;
  64
  65
  66       //----------------/
  67      //- Constructors -/
  68     //----------------/
  69
  70     public SequenceTypeDescriptor() {
  71         super();
  72         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  73         _xmlName = "SequenceType";
  74         _elementDefinition = false;
  75
  76         //-- set grouping compositor
  77         setCompositorAsSequence();
  78         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;
  79         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;
  80         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;
  81         //-- initialize attribute descriptors
  82
  83         //-- _id
  84         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  85         desc.setImmutable(true);
  86         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
  87             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
  88                 throws IllegalStateException
  89             {
  90                 SequenceType target = (SequenceType) object;
  91                 return target.getId();
  92             }
  93             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  94                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  95             {
  96                 try {
  97                     SequenceType target = (SequenceType) object;
  98                     target.setId( (java.lang.String) value);
  99                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 100                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 101                 }
 102             }
 103             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 104                 return null;
 105             }
 106         };
 107         desc.setHandler(handler);
 108         desc.setMultivalued(false);
 109         addFieldDescriptor(desc);
 110
 111         //-- validation code for: _id
 112         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 113         { //-- local scope
 114             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 115             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 116             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 117             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 118         }
 119         desc.setValidator(fieldValidator);
 120         //-- _description
 121         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 122         desc.setImmutable(true);
 123         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 124             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 125                 throws IllegalStateException
 126             {
 127                 SequenceType target = (SequenceType) object;
 128                 return target.getDescription();
 129             }
 130             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 131                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 132             {
 133                 try {
 134                     SequenceType target = (SequenceType) object;
 135                     target.setDescription( (java.lang.String) value);
 136                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 137                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 138                 }
 139             }
 140             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 141                 return null;
 142             }
 143         };
 144         desc.setHandler(handler);
 145         desc.setMultivalued(false);
 146         addFieldDescriptor(desc);
 147
 148         //-- validation code for: _description
 149         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 150         { //-- local scope
 151             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 152             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 153             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 154             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 155         }
 156         desc.setValidator(fieldValidator);
 157         //-- initialize element descriptors
 158
 159         //-- _sequence
 160         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_sequence", "sequence", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 161         desc.setImmutable(true);
 162         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 163             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 164                 throws IllegalStateException
 165             {
 166                 SequenceType target = (SequenceType) object;
 167                 return target.getSequence();
 168             }
 169             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 170                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 171             {
 172                 try {
 173                     SequenceType target = (SequenceType) object;
 174                     target.setSequence( (java.lang.String) value);
 175                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 176                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 177                 }
 178             }
 179             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 180                 return null;
 181             }
 182         };
 183         desc.setHandler(handler);
 184         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 185         desc.setMultivalued(false);
 186         addFieldDescriptor(desc);
 187
 188         //-- validation code for: _sequence
 189         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 190         { //-- local scope
 191             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 192             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 193             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 194             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 195         }
 196         desc.setValidator(fieldValidator);
 197         //-- _name
 198         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_name", "name", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 199         desc.setImmutable(true);
 200         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 201             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 202                 throws IllegalStateException
 203             {
 204                 SequenceType target = (SequenceType) object;
 205                 return target.getName();
 206             }
 207             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 208                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 209             {
 210                 try {
 211                     SequenceType target = (SequenceType) object;
 212                     target.setName( (java.lang.String) value);
 213                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 214                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 215                 }
 216             }
 217             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 218                 return null;
 219             }
 220         };
 221         desc.setHandler(handler);
 222         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 223         desc.setMultivalued(false);
 224         addFieldDescriptor(desc);
 225
 226         //-- validation code for: _name
 227         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 228         { //-- local scope
 229             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 230             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 231             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 232             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 233         }
 234         desc.setValidator(fieldValidator);
 235     }
 236
 237
 238       //-----------/
 239      //- Methods -/
 240     //-----------/
 241
 242     /**
 243      * Method getAccessMode.
 244      *
 245      * @return the access mode specified for this class.
 246      */
 247     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(
 248     ) {
 249         return null;
 250     }
 251
 252     /**
 253      * Method getIdentity.
 254      *
 255      * @return the identity field, null if this class has no
 256      * identity.
 257      */
 258     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(
 259     ) {
 260         return super.getIdentity();
 261     }
 262
 263     /**
 264      * Method getJavaClass.
 265      *
 266      * @return the Java class represented by this descriptor.
 267      */
 268     public java.lang.Class getJavaClass(
 269     ) {
 270         return jalview.schemabinding.version2.SequenceType.class;
 271     }
 272
 273     /**
 274      * Method getNameSpacePrefix.
 275      *
 276      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 277      */
 278     public java.lang.String getNameSpacePrefix(
 279     ) {
 280         return _nsPrefix;
 281     }
 282
 283     /**
 284      * Method getNameSpaceURI.
 285      *
 286      * @return the namespace URI used when marshaling and
 287      * unmarshaling as XML.
 288      */
 289     public java.lang.String getNameSpaceURI(
 290     ) {
 291         return _nsURI;
 292     }
 293
 294     /**
 295      * Method getValidator.
 296      *
 297      * @return a specific validator for the class described by this
 298      * ClassDescriptor.
 299      */
 300     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(
 301     ) {
 302         return this;
 303     }
 304
 305     /**
 306      * Method getXMLName.
 307      *
 308      * @return the XML Name for the Class being described.
 309      */
 310     public java.lang.String getXMLName(
 311     ) {
 312         return _xmlName;
 313     }
 314
 315     /**
 316      * Method isElementDefinition.
 317      *
 318      * @return true if XML schema definition of this Class is that
 319      * of a global
 320      * element or element with anonymous type definition.
 321      */
 322     public boolean isElementDefinition(
 323     ) {
 324         return _elementDefinition;
 325     }
 326
 327 }