src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/StructureStateDescriptor.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  19
  20 //---------------------------------/
  21 //- Imported classes and packages -/
  22 //---------------------------------/
  23
  24 import jalview.schemabinding.version2.StructureState;
  25
  26 /**
  27  * Class StructureStateDescriptor.
  28  *
  29  * @version $Revision$ $Date$
  30  */
  31 public class StructureStateDescriptor extends
  32         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  33 {
  34
  35   // --------------------------/
  36   // - Class/Member Variables -/
  37   // --------------------------/
  38
  39   /**
  40    * Field _elementDefinition.
  41    */
  42   private boolean _elementDefinition;
  43
  44   /**
  45    * Field _nsPrefix.
  46    */
  47   private java.lang.String _nsPrefix;
  48
  49   /**
  50    * Field _nsURI.
  51    */
  52   private java.lang.String _nsURI;
  53
  54   /**
  55    * Field _xmlName.
  56    */
  57   private java.lang.String _xmlName;
  58
  59   // ----------------/
  60   // - Constructors -/
  61   // ----------------/
  62
  63   public StructureStateDescriptor()
  64   {
  65     super();
  66     _nsURI = "www.jalview.org";
  67     _xmlName = "structureState";
  68     _elementDefinition = true;
  69     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  70     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  71     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  72     // -- _content
  73     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  74             java.lang.String.class, "_content", "PCDATA",
  75             org.exolab.castor.xml.NodeType.Text);
  76     desc.setImmutable(true);
  77     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  78     {
  79       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  80               throws IllegalStateException
  81       {
  82         StructureState target = (StructureState) object;
  83         return target.getContent();
  84       }
  85
  86       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  87               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  88       {
  89         try
  90         {
  91           StructureState target = (StructureState) object;
  92           target.setContent((java.lang.String) value);
  93         } catch (java.lang.Exception ex)
  94         {
  95           throw new IllegalStateException(ex.toString());
  96         }
  97       }
  98
  99       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 100       {
 101         return null;
 102       }
 103     };
 104     desc.setHandler(handler);
 105     addFieldDescriptor(desc);
 106
 107     // -- validation code for: _content
 108     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 109     { // -- local scope
 110       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 111       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 112       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 113       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 114     }
 115     desc.setValidator(fieldValidator);
 116     // -- initialize attribute descriptors
 117
 118     // -- _visible
 119     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 120             java.lang.Boolean.TYPE, "_visible", "visible",
 121             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 122     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 123     {
 124       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 125               throws IllegalStateException
 126       {
 127         StructureState target = (StructureState) object;
 128         if (!target.hasVisible())
 129         {
 130           return null;
 131         }
 132         return (target.getVisible() ? java.lang.Boolean.TRUE
 133                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 134       }
 135
 136       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 137               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 138       {
 139         try
 140         {
 141           StructureState target = (StructureState) object;
 142           // if null, use delete method for optional primitives
 143           if (value == null)
 144           {
 145             target.deleteVisible();
 146             return;
 147           }
 148           target.setVisible(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 149         } catch (java.lang.Exception ex)
 150         {
 151           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 152         }
 153       }
 154
 155       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 156       {
 157         return null;
 158       }
 159     };
 160     desc.setHandler(handler);
 161     desc.setMultivalued(false);
 162     addFieldDescriptor(desc);
 163
 164     // -- validation code for: _visible
 165     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 166     { // -- local scope
 167       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 168       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 169       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 170     }
 171     desc.setValidator(fieldValidator);
 172     // -- _viewId
 173     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 174             java.lang.String.class, "_viewId", "viewId",
 175             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 176     desc.setImmutable(true);
 177     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 178     {
 179       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 180               throws IllegalStateException
 181       {
 182         StructureState target = (StructureState) object;
 183         return target.getViewId();
 184       }
 185
 186       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 187               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 188       {
 189         try
 190         {
 191           StructureState target = (StructureState) object;
 192           target.setViewId((java.lang.String) value);
 193         } catch (java.lang.Exception ex)
 194         {
 195           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 196         }
 197       }
 198
 199       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 200       {
 201         return null;
 202       }
 203     };
 204     desc.setHandler(handler);
 205     desc.setMultivalued(false);
 206     addFieldDescriptor(desc);
 207
 208     // -- validation code for: _viewId
 209     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 210     { // -- local scope
 211       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 212       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 213       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 214       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 215     }
 216     desc.setValidator(fieldValidator);
 217     // -- _alignwithAlignPanel
 218     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 219             java.lang.Boolean.TYPE, "_alignwithAlignPanel",
 220             "alignwithAlignPanel", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 221     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 222     {
 223       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 224               throws IllegalStateException
 225       {
 226         StructureState target = (StructureState) object;
 227         if (!target.hasAlignwithAlignPanel())
 228         {
 229           return null;
 230         }
 231         return (target.getAlignwithAlignPanel() ? java.lang.Boolean.TRUE
 232                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 233       }
 234
 235       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 236               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 237       {
 238         try
 239         {
 240           StructureState target = (StructureState) object;
 241           // if null, use delete method for optional primitives
 242           if (value == null)
 243           {
 244             target.deleteAlignwithAlignPanel();
 245             return;
 246           }
 247           target.setAlignwithAlignPanel(((java.lang.Boolean) value)
 248                   .booleanValue());
 249         } catch (java.lang.Exception ex)
 250         {
 251           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 252         }
 253       }
 254
 255       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 256       {
 257         return null;
 258       }
 259     };
 260     desc.setHandler(handler);
 261     desc.setMultivalued(false);
 262     addFieldDescriptor(desc);
 263
 264     // -- validation code for: _alignwithAlignPanel
 265     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 266     { // -- local scope
 267       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 268       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 269       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 270     }
 271     desc.setValidator(fieldValidator);
 272     // -- _colourwithAlignPanel
 273     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 274             java.lang.Boolean.TYPE, "_colourwithAlignPanel",
 275             "colourwithAlignPanel",
 276             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 277     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 278     {
 279       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 280               throws IllegalStateException
 281       {
 282         StructureState target = (StructureState) object;
 283         if (!target.hasColourwithAlignPanel())
 284         {
 285           return null;
 286         }
 287         return (target.getColourwithAlignPanel() ? java.lang.Boolean.TRUE
 288                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 289       }
 290
 291       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 292               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 293       {
 294         try
 295         {
 296           StructureState target = (StructureState) object;
 297           // if null, use delete method for optional primitives
 298           if (value == null)
 299           {
 300             target.deleteColourwithAlignPanel();
 301             return;
 302           }
 303           target.setColourwithAlignPanel(((java.lang.Boolean) value)
 304                   .booleanValue());
 305         } catch (java.lang.Exception ex)
 306         {
 307           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 308         }
 309       }
 310
 311       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 312       {
 313         return null;
 314       }
 315     };
 316     desc.setHandler(handler);
 317     desc.setMultivalued(false);
 318     addFieldDescriptor(desc);
 319
 320     // -- validation code for: _colourwithAlignPanel
 321     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 322     { // -- local scope
 323       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 324       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 325       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 326     }
 327     desc.setValidator(fieldValidator);
 328     // -- _colourByJmol
 329     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 330             java.lang.Boolean.TYPE, "_colourByJmol", "colourByJmol",
 331             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 332     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 333     {
 334       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 335               throws IllegalStateException
 336       {
 337         StructureState target = (StructureState) object;
 338         if (!target.hasColourByJmol())
 339         {
 340           return null;
 341         }
 342         return (target.getColourByJmol() ? java.lang.Boolean.TRUE
 343                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 344       }
 345
 346       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 347               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 348       {
 349         try
 350         {
 351           StructureState target = (StructureState) object;
 352           // if null, use delete method for optional primitives
 353           if (value == null)
 354           {
 355             target.deleteColourByJmol();
 356             return;
 357           }
 358           target.setColourByJmol(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 359         } catch (java.lang.Exception ex)
 360         {
 361           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 362         }
 363       }
 364
 365       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 366       {
 367         return null;
 368       }
 369     };
 370     desc.setHandler(handler);
 371     desc.setMultivalued(false);
 372     addFieldDescriptor(desc);
 373
 374     // -- validation code for: _colourByJmol
 375     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 376     { // -- local scope
 377       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 378       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 379       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 380     }
 381     desc.setValidator(fieldValidator);
 382     // -- _width
 383     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 384             java.lang.Integer.TYPE, "_width", "width",
 385             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 386     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 387     {
 388       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 389               throws IllegalStateException
 390       {
 391         StructureState target = (StructureState) object;
 392         if (!target.hasWidth())
 393         {
 394           return null;
 395         }
 396         return new java.lang.Integer(target.getWidth());
 397       }
 398
 399       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 400               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 401       {
 402         try
 403         {
 404           StructureState target = (StructureState) object;
 405           // if null, use delete method for optional primitives
 406           if (value == null)
 407           {
 408             target.deleteWidth();
 409             return;
 410           }
 411           target.setWidth(((java.lang.Integer) value).intValue());
 412         } catch (java.lang.Exception ex)
 413         {
 414           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 415         }
 416       }
 417
 418       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 419       {
 420         return null;
 421       }
 422     };
 423     desc.setHandler(handler);
 424     desc.setMultivalued(false);
 425     addFieldDescriptor(desc);
 426
 427     // -- validation code for: _width
 428     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 429     { // -- local scope
 430       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 431       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 432       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 433       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 434       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 435     }
 436     desc.setValidator(fieldValidator);
 437     // -- _height
 438     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 439             java.lang.Integer.TYPE, "_height", "height",
 440             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 441     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 442     {
 443       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 444               throws IllegalStateException
 445       {
 446         StructureState target = (StructureState) object;
 447         if (!target.hasHeight())
 448         {
 449           return null;
 450         }
 451         return new java.lang.Integer(target.getHeight());
 452       }
 453
 454       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 455               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 456       {
 457         try
 458         {
 459           StructureState target = (StructureState) object;
 460           // if null, use delete method for optional primitives
 461           if (value == null)
 462           {
 463             target.deleteHeight();
 464             return;
 465           }
 466           target.setHeight(((java.lang.Integer) value).intValue());
 467         } catch (java.lang.Exception ex)
 468         {
 469           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 470         }
 471       }
 472
 473       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 474       {
 475         return null;
 476       }
 477     };
 478     desc.setHandler(handler);
 479     desc.setMultivalued(false);
 480     addFieldDescriptor(desc);
 481
 482     // -- validation code for: _height
 483     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 484     { // -- local scope
 485       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 486       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 487       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 488       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 489       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 490     }
 491     desc.setValidator(fieldValidator);
 492     // -- _xpos
 493     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 494             java.lang.Integer.TYPE, "_xpos", "xpos",
 495             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 496     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 497     {
 498       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 499               throws IllegalStateException
 500       {
 501         StructureState target = (StructureState) object;
 502         if (!target.hasXpos())
 503         {
 504           return null;
 505         }
 506         return new java.lang.Integer(target.getXpos());
 507       }
 508
 509       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 510               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 511       {
 512         try
 513         {
 514           StructureState target = (StructureState) object;
 515           // if null, use delete method for optional primitives
 516           if (value == null)
 517           {
 518             target.deleteXpos();
 519             return;
 520           }
 521           target.setXpos(((java.lang.Integer) value).intValue());
 522         } catch (java.lang.Exception ex)
 523         {
 524           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 525         }
 526       }
 527
 528       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 529       {
 530         return null;
 531       }
 532     };
 533     desc.setHandler(handler);
 534     desc.setMultivalued(false);
 535     addFieldDescriptor(desc);
 536
 537     // -- validation code for: _xpos
 538     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 539     { // -- local scope
 540       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 541       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 542       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 543       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 544       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 545     }
 546     desc.setValidator(fieldValidator);
 547     // -- _ypos
 548     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 549             java.lang.Integer.TYPE, "_ypos", "ypos",
 550             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 551     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 552     {
 553       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 554               throws IllegalStateException
 555       {
 556         StructureState target = (StructureState) object;
 557         if (!target.hasYpos())
 558         {
 559           return null;
 560         }
 561         return new java.lang.Integer(target.getYpos());
 562       }
 563
 564       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 565               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 566       {
 567         try
 568         {
 569           StructureState target = (StructureState) object;
 570           // if null, use delete method for optional primitives
 571           if (value == null)
 572           {
 573             target.deleteYpos();
 574             return;
 575           }
 576           target.setYpos(((java.lang.Integer) value).intValue());
 577         } catch (java.lang.Exception ex)
 578         {
 579           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 580         }
 581       }
 582
 583       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 584       {
 585         return null;
 586       }
 587     };
 588     desc.setHandler(handler);
 589     desc.setMultivalued(false);
 590     addFieldDescriptor(desc);
 591
 592     // -- validation code for: _ypos
 593     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 594     { // -- local scope
 595       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 596       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 597       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 598       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 599       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 600     }
 601     desc.setValidator(fieldValidator);
 602     // -- initialize element descriptors
 603
 604   }
 605
 606   // -----------/
 607   // - Methods -/
 608   // -----------/
 609
 610   /**
 611    * Method getAccessMode.
 612    *
 613    * @return the access mode specified for this class.
 614    */
 615   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 616   {
 617     return null;
 618   }
 619
 620   /**
 621    * Method getIdentity.
 622    *
 623    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 624    */
 625   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 626   {
 627     return super.getIdentity();
 628   }
 629
 630   /**
 631    * Method getJavaClass.
 632    *
 633    * @return the Java class represented by this descriptor.
 634    */
 635   public java.lang.Class getJavaClass()
 636   {
 637     return jalview.schemabinding.version2.StructureState.class;
 638   }
 639
 640   /**
 641    * Method getNameSpacePrefix.
 642    *
 643    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 644    */
 645   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 646   {
 647     return _nsPrefix;
 648   }
 649
 650   /**
 651    * Method getNameSpaceURI.
 652    *
 653    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 654    */
 655   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 656   {
 657     return _nsURI;
 658   }
 659
 660   /**
 661    * Method getValidator.
 662    *
 663    * @return a specific validator for the class described by this
 664    *         ClassDescriptor.
 665    */
 666   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 667   {
 668     return this;
 669   }
 670
 671   /**
 672    * Method getXMLName.
 673    *
 674    * @return the XML Name for the Class being described.
 675    */
 676   public java.lang.String getXMLName()
 677   {
 678     return _xmlName;
 679   }
 680
 681   /**
 682    * Method isElementDefinition.
 683    *
 684    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 685    *         element or element with anonymous type definition.
 686    */
 687   public boolean isElementDefinition()
 688   {
 689     return _elementDefinition;
 690   }
 691
 692 }