src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/VAMSASDescriptor.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  *******************************************************************************/
  18 /*
  19  * This class was automatically generated with
  20  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  21  * Schema.
  22  * $Id$
  23  */
  24
  25 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  26
  27   //---------------------------------/
  28  //- Imported classes and packages -/
  29 //---------------------------------/
  30
  31 import jalview.schemabinding.version2.VAMSAS;
  32
  33 /**
  34  * Class VAMSASDescriptor.
  35  *
  36  * @version $Revision$ $Date$
  37  */
  38 public class VAMSASDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {
  39
  40
  41       //--------------------------/
  42      //- Class/Member Variables -/
  43     //--------------------------/
  44
  45     /**
  46      * Field _elementDefinition.
  47      */
  48     private boolean _elementDefinition;
  49
  50     /**
  51      * Field _nsPrefix.
  52      */
  53     private java.lang.String _nsPrefix;
  54
  55     /**
  56      * Field _nsURI.
  57      */
  58     private java.lang.String _nsURI;
  59
  60     /**
  61      * Field _xmlName.
  62      */
  63     private java.lang.String _xmlName;
  64
  65
  66       //----------------/
  67      //- Constructors -/
  68     //----------------/
  69
  70     public VAMSASDescriptor() {
  71         super();
  72         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  73         _xmlName = "VAMSAS";
  74         _elementDefinition = false;
  75
  76         //-- set grouping compositor
  77         setCompositorAsSequence();
  78         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;
  79         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;
  80         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;
  81         //-- initialize attribute descriptors
  82
  83         //-- initialize element descriptors
  84
  85         //-- _treeList
  86         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_treeList", "Tree", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
  87         desc.setImmutable(true);
  88         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
  89             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
  90                 throws IllegalStateException
  91             {
  92                 VAMSAS target = (VAMSAS) object;
  93                 return target.getTree();
  94             }
  95             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  96                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  97             {
  98                 try {
  99                     VAMSAS target = (VAMSAS) object;
 100                     target.addTree( (java.lang.String) value);
 101                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 102                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 103                 }
 104             }
 105             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {
 106                 try {
 107                     VAMSAS target = (VAMSAS) object;
 108                     target.removeAllTree();
 109                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 110                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 111                 }
 112             }
 113             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 114                 return null;
 115             }
 116         };
 117         desc.setHandler(handler);
 118         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 119         desc.setMultivalued(true);
 120         addFieldDescriptor(desc);
 121
 122         //-- validation code for: _treeList
 123         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 124         fieldValidator.setMinOccurs(0);
 125         { //-- local scope
 126             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 127             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 128             fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 129             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 130         }
 131         desc.setValidator(fieldValidator);
 132         //-- _sequenceSetList
 133         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.SequenceSet.class, "_sequenceSetList", "SequenceSet", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 134         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {
 135             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object )
 136                 throws IllegalStateException
 137             {
 138                 VAMSAS target = (VAMSAS) object;
 139                 return target.getSequenceSet();
 140             }
 141             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 142                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 143             {
 144                 try {
 145                     VAMSAS target = (VAMSAS) object;
 146                     target.addSequenceSet( (jalview.schemabinding.version2.SequenceSet) value);
 147                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 148                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 149                 }
 150             }
 151             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {
 152                 try {
 153                     VAMSAS target = (VAMSAS) object;
 154                     target.removeAllSequenceSet();
 155                 } catch (java.lang.Exception ex) {
 156                     throw new IllegalStateException(ex.toString());
 157                 }
 158             }
 159             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {
 160                 return new jalview.schemabinding.version2.SequenceSet();
 161             }
 162         };
 163         desc.setHandler(handler);
 164         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 165         desc.setMultivalued(true);
 166         addFieldDescriptor(desc);
 167
 168         //-- validation code for: _sequenceSetList
 169         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 170         fieldValidator.setMinOccurs(0);
 171         { //-- local scope
 172         }
 173         desc.setValidator(fieldValidator);
 174     }
 175
 176
 177       //-----------/
 178      //- Methods -/
 179     //-----------/
 180
 181     /**
 182      * Method getAccessMode.
 183      *
 184      * @return the access mode specified for this class.
 185      */
 186     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(
 187     ) {
 188         return null;
 189     }
 190
 191     /**
 192      * Method getIdentity.
 193      *
 194      * @return the identity field, null if this class has no
 195      * identity.
 196      */
 197     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(
 198     ) {
 199         return super.getIdentity();
 200     }
 201
 202     /**
 203      * Method getJavaClass.
 204      *
 205      * @return the Java class represented by this descriptor.
 206      */
 207     public java.lang.Class getJavaClass(
 208     ) {
 209         return jalview.schemabinding.version2.VAMSAS.class;
 210     }
 211
 212     /**
 213      * Method getNameSpacePrefix.
 214      *
 215      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 216      */
 217     public java.lang.String getNameSpacePrefix(
 218     ) {
 219         return _nsPrefix;
 220     }
 221
 222     /**
 223      * Method getNameSpaceURI.
 224      *
 225      * @return the namespace URI used when marshaling and
 226      * unmarshaling as XML.
 227      */
 228     public java.lang.String getNameSpaceURI(
 229     ) {
 230         return _nsURI;
 231     }
 232
 233     /**
 234      * Method getValidator.
 235      *
 236      * @return a specific validator for the class described by this
 237      * ClassDescriptor.
 238      */
 239     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(
 240     ) {
 241         return this;
 242     }
 243
 244     /**
 245      * Method getXMLName.
 246      *
 247      * @return the XML Name for the Class being described.
 248      */
 249     public java.lang.String getXMLName(
 250     ) {
 251         return _xmlName;
 252     }
 253
 254     /**
 255      * Method isElementDefinition.
 256      *
 257      * @return true if XML schema definition of this Class is that
 258      * of a global
 259      * element or element with anonymous type definition.
 260      */
 261     public boolean isElementDefinition(
 262     ) {
 263         return _elementDefinition;
 264     }
 265
 266 }