src/jalview/schemes/FollowerColourScheme.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.schemes;
  22
  23 import jalview.api.AlignViewportI;
  24 import jalview.datamodel.AnnotatedCollectionI;
  25 import jalview.datamodel.SequenceCollectionI;
  26 import jalview.datamodel.SequenceI;
  27
  28 import java.util.Map;
  29
  30 /**
  31  * Colourscheme that takes its colours from some other colourscheme
  32  *
  33  * @author jimp
  34  *
  35  */
  36 public class FollowerColourScheme extends ResidueColourScheme
  37 {
  38
  39   private ColourSchemeI colourScheme;
  40
  41   public ColourSchemeI getBaseColour()
  42   {
  43     return colourScheme;
  44   }
  45
  46   @Override
  47   public String getSchemeName()
  48   {
  49     return "Follower";
  50   }
  51
  52   /**
  53    * Returns a new instance of this colour scheme with which the given data may
  54    * be coloured
  55    */
  56   @Override
  57   public ColourSchemeI getInstance(AlignViewportI view,
  58           AnnotatedCollectionI coll,
  59           Map<SequenceI, SequenceCollectionI> hrs)
  60   {
  61     return new FollowerColourScheme();
  62   }
  63
  64   protected ColourSchemeI getColourScheme()
  65   {
  66     return colourScheme;
  67   }
  68
  69   protected void setColourScheme(ColourSchemeI colourScheme)
  70   {
  71     this.colourScheme = colourScheme;
  72   }
  73
  74 }