src/jalview/schemes/TurnColourScheme.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.schemes;
  22
  23 import jalview.api.AlignViewportI;
  24 import jalview.datamodel.AnnotatedCollectionI;
  25
  26 import java.awt.Color;
  27
  28 /**
  29  * DOCUMENT ME!
  30  *
  31  * @author $author$
  32  * @version $Revision$
  33  */
  34 public class TurnColourScheme extends ScoreColourScheme
  35 {
  36   /**
  37    * Creates a new TurnColourScheme object.
  38    */
  39   public TurnColourScheme()
  40   {
  41     super(ResidueProperties.aaIndex, ResidueProperties.turn);
  42   }
  43
  44   /**
  45    * DOCUMENT ME!
  46    *
  47    * @param c
  48    *          DOCUMENT ME!
  49    *
  50    * @return DOCUMENT ME!
  51    */
  52   @Override
  53   public Color makeColour(float c)
  54   {
  55     return new Color(c, 1 - c, 1 - c);
  56   }
  57
  58   @Override
  59   public boolean isPeptideSpecific()
  60   {
  61     return true;
  62   }
  63
  64   @Override
  65   public String getSchemeName()
  66   {
  67     return JalviewColourScheme.Turn.toString();
  68   }
  69
  70   /**
  71    * Returns a new instance of this colour scheme with which the given data may
  72    * be coloured
  73    */
  74   @Override
  75   public ColourSchemeI getInstance(AlignViewportI view,
  76           AnnotatedCollectionI coll)
  77   {
  78     return new TurnColourScheme();
  79   }
  80 }