src/jalview/schemes/UserColourScheme.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemes;\r
  20 \r
  21 import java.awt.*;\r
  22 import java.util.StringTokenizer;\r
  23 \r
  24 public class UserColourScheme\r
  25     extends ResidueColourScheme\r
  26 {\r
  27   protected String schemeName;\r
  28 \r
  29   public UserColourScheme()\r
  30   {  }\r
  31 \r
  32   public UserColourScheme(Color[] newColors)\r
  33   {\r
  34     colors = newColors;\r
  35   }\r
  36 \r
  37   public UserColourScheme(String colour)\r
  38   {\r
  39     Color col = getColourFromString(colour);\r
  40 \r
  41     if(col==null)\r
  42     {\r
  43       System.out.println("Unknown colour!! "+colour);\r
  44       col = createColourFromName(colour);\r
  45     }\r
  46 \r
  47     colors = new Color[24];\r
  48     for(int i=0; i<24; i++)\r
  49       colors[i] = col;\r
  50   }\r
  51 \r
  52   public Color[] getColours()\r
  53   {\r
  54     return colors;\r
  55   }\r
  56 \r
  57   public void setName(String name)\r
  58   {\r
  59     schemeName = name;\r
  60   }\r
  61 \r
  62   public String getName()\r
  63   {\r
  64     return schemeName;\r
  65   }\r
  66 \r
  67   public Color getColourFromString(String colour)\r
  68   {\r
  69     colour = colour.trim();\r
  70 \r
  71     Color col = null;\r
  72     try\r
  73     {\r
  74       int value = Integer.parseInt(colour, 16);\r
  75       col = new Color(value);\r
  76     }\r
  77     catch (NumberFormatException ex)\r
  78     {}\r
  79 \r
  80     if (col == null)\r
  81       col = ColourSchemeProperty.getAWTColorFromName(colour);\r
  82 \r
  83     if (col == null)\r
  84     {\r
  85       try\r
  86       {\r
  87         java.util.StringTokenizer st = new java.util.StringTokenizer(colour,\r
  88             ",");\r
  89         int r = Integer.parseInt(st.nextToken());\r
  90         int g = Integer.parseInt(st.nextToken());\r
  91         int b = Integer.parseInt(st.nextToken());\r
  92         col = new Color(r, g, b);\r
  93       }\r
  94       catch (Exception ex)\r
  95       {}\r
  96     }\r
  97 \r
  98     return col;\r
  99 \r
 100   }\r
 101 \r
 102   public Color createColourFromName(String name)\r
 103   {\r
 104     int r, g, b;\r
 105 \r
 106     int lsize = name.length();\r
 107     int start = 0, end = lsize / 3;\r
 108 \r
 109     int rgbOffset = Math.abs(name.hashCode() % 10) * 15;\r
 110 \r
 111     r = Math.abs(name.substring(start, end).hashCode() + rgbOffset) % 210 + 20;\r
 112     start = end;\r
 113     end += lsize / 3;\r
 114     if (end > lsize)\r
 115       end = lsize;\r
 116 \r
 117     g = Math.abs(name.substring(start, end).hashCode() + rgbOffset) % 210 + 20;\r
 118 \r
 119     b = Math.abs(name.substring(end).hashCode() + rgbOffset) % 210 + 20;\r
 120 \r
 121     Color color = new Color(r, g, b);\r
 122 \r
 123     return color;\r
 124   }\r
 125 \r
 126   public void parseAppletParameter(String paramValue)\r
 127   {\r
 128     StringTokenizer st = new StringTokenizer(paramValue, ";");\r
 129     StringTokenizer st2;\r
 130     String token=null, colour, residues;\r
 131     try{\r
 132       while (st.hasMoreElements())\r
 133       {\r
 134         token = st.nextToken().trim();\r
 135         residues = token.substring(0, token.indexOf("="));\r
 136         colour = token.substring(token.indexOf("=") + 1);\r
 137 \r
 138         st2 = new StringTokenizer(residues, " ,");\r
 139         while (st2.hasMoreTokens())\r
 140         {\r
 141           int colIndex =\r
 142               ( (Integer) ResidueProperties.aaHash.\r
 143                get(st2.nextToken())).intValue();\r
 144 \r
 145           colors[colIndex] = getColourFromString(colour);\r
 146         }\r
 147       }\r
 148     }\r
 149     catch(Exception ex)\r
 150   {\r
 151     System.out.println("Error parsing userDefinedColours:\n"\r
 152                        +token+"\n"+ex);\r
 153   }\r
 154 \r
 155   }\r
 156 \r
 157 }\r