src/jalview/schemes/ZappoColourScheme.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.schemes;
  22
  23 import jalview.api.AlignViewportI;
  24 import jalview.datamodel.AnnotatedCollectionI;
  25 import jalview.datamodel.SequenceCollectionI;
  26 import jalview.datamodel.SequenceI;
  27
  28 import java.util.Map;
  29
  30 /**
  31  * DOCUMENT ME!
  32  *
  33  * @author $author$
  34  * @version $Revision$
  35  */
  36 public class ZappoColourScheme extends ResidueColourScheme
  37 {
  38   /**
  39    * Creates a new ZappoColourScheme object.
  40    */
  41   public ZappoColourScheme()
  42   {
  43     super(ResidueProperties.aaIndex, ResidueProperties.zappo);
  44   }
  45
  46   @Override
  47   public boolean isPeptideSpecific()
  48   {
  49     return true;
  50   }
  51
  52   @Override
  53   public String getSchemeName()
  54   {
  55     return JalviewColourScheme.Zappo.toString();
  56   }
  57
  58   /**
  59    * Returns a new instance of this colour scheme with which the given data may
  60    * be coloured
  61    */
  62   @Override
  63   public ColourSchemeI getInstance(AlignViewportI view,
  64           AnnotatedCollectionI coll,
  65           Map<SequenceI, SequenceCollectionI> hrs)
  66   {
  67     return new ZappoColourScheme();
  68   }
  69 }