src/jalview/structure/StructureMappingcommandSet.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.structure;
  19
  20 /**
  21  * holder for script commands generated for a particular structure mapping
  22  *
  23  * @author jimp
  24  *
  25  */
  26 public class StructureMappingcommandSet
  27 {
  28   /**
  29    * structure file for which these commands were generated
  30    */
  31   public String mapping;
  32
  33   /**
  34    * set of commands
  35    */
  36   public String[] commands;
  37
  38   /**
  39    * some object that indicates what the commands can be parsed by (eg
  40    * JmolCommands.class implies these are Jmol commands)
  41    */
  42   public Object handledBy;
  43
  44   /**
  45    * record the originating command generator, the structure mapping involved,
  46    * and the set of commands to be passed.
  47    *
  48    * @param handledBy
  49    * @param files
  50    * @param commands
  51    */
  52   public StructureMappingcommandSet(Object handledBy, String files,
  53           String[] commands)
  54   {
  55     this.mapping = files;
  56     this.handledBy = handledBy;
  57     this.commands = commands;
  58   }
  59 }