src/jalview/structure/StructureMappingcommandSet.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
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  15  *
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  17  *******************************************************************************/
  18 package jalview.structure;
  19
  20
  21 /**
  22  * holder for script commands generated for a particular structure mapping
  23  * @author jimp
  24  *
  25  */
  26 public class StructureMappingcommandSet {
  27   /**
  28    * structure file for which these commands were generated
  29    */
  30   public String mapping;
  31   /**
  32    * set of commands
  33    */
  34   public String[] commands;
  35   /**
  36    * some object that indicates what the commands can be parsed by (eg JmolCommands.class implies these are Jmol commands)
  37    */
  38   public Object handledBy;
  39   /**
  40    * record the originating command generator, the structure mapping involved, and the set of commands to be passed.
  41    * @param handledBy
  42    * @param files
  43    * @param commands
  44    */
  45   public StructureMappingcommandSet(Object handledBy, String files, String[] commands)
  46   {
  47     this.mapping=files;
  48     this.handledBy=handledBy;
  49     this.commands=commands;
  50   }
  51 }