src/jalview/structure/StructureMappingcommandSet.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package jalview.structure;
  20
  21 /**
  22  * holder for script commands generated for a particular structure mapping
  23  *
  24  * @author jimp
  25  *
  26  */
  27 public class StructureMappingcommandSet
  28 {
  29   /**
  30    * structure file for which these commands were generated
  31    */
  32   public String mapping;
  33
  34   /**
  35    * set of commands
  36    */
  37   public String[] commands;
  38
  39   /**
  40    * some object that indicates what the commands can be parsed by (eg
  41    * JmolCommands.class implies these are Jmol commands)
  42    */
  43   public Object handledBy;
  44
  45   /**
  46    * record the originating command generator, the structure mapping involved,
  47    * and the set of commands to be passed.
  48    *
  49    * @param handledBy
  50    * @param files
  51    * @param commands
  52    */
  53   public StructureMappingcommandSet(Object handledBy, String files,
  54           String[] commands)
  55   {
  56     this.mapping = files;
  57     this.handledBy = handledBy;
  58     this.commands = commands;
  59   }
  60 }