src/jalview/viewmodel/OverviewDimensions.java

   1 package jalview.viewmodel;
   2
   3 import jalview.api.AlignmentColsCollectionI;
   4 import jalview.api.AlignmentRowsCollectionI;
   5 import jalview.datamodel.AlignmentI;
   6 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
   7 import jalview.datamodel.HiddenSequences;
   8
   9 import java.awt.Graphics;
  10
  11 public abstract class OverviewDimensions
  12 {
  13
  14   private static final int DEFAULT_GRAPH_HEIGHT = 20;
  15   protected static final int MAX_WIDTH = 400;
  16   protected static final int MIN_WIDTH = 120;
  17   protected static final int MIN_SEQ_HEIGHT = 40;
  18   protected static final int MAX_SEQ_HEIGHT = 300;
  19   protected int width;
  20   protected int sequencesHeight;
  21   protected int graphHeight = DEFAULT_GRAPH_HEIGHT;
  22   protected int boxX = -1;
  23   protected int boxY = -1;
  24   protected int boxWidth = -1;
  25   protected int boxHeight = -1;
  26   protected int scrollCol = -1;
  27   protected int scrollRow = -1;
  28
  29   protected int alwidth;
  30
  31   protected int alheight;
  32
  33   public OverviewDimensions(ViewportRanges ranges,
  34           boolean showAnnotationPanel)
  35   {
  36     // scale the initial size of overviewpanel to shape of alignment
  37     float initialScale = (float) ranges.getAbsoluteAlignmentWidth()
  38             / (float) ranges.getAbsoluteAlignmentHeight();
  39
  40     if (!showAnnotationPanel)
  41     {
  42       graphHeight = 0;
  43     }
  44
  45     if (ranges.getAbsoluteAlignmentWidth() > ranges
  46             .getAbsoluteAlignmentHeight())
  47     {
  48       // wider
  49       width = MAX_WIDTH;
  50       sequencesHeight = Math.round(MAX_WIDTH / initialScale);
  51       if (sequencesHeight < MIN_SEQ_HEIGHT)
  52       {
  53         sequencesHeight = MIN_SEQ_HEIGHT;
  54       }
  55     }
  56     else
  57     {
  58       // taller
  59       width = Math.round(MAX_WIDTH * initialScale);
  60       sequencesHeight = MAX_SEQ_HEIGHT;
  61
  62       if (width < MIN_WIDTH)
  63       {
  64         width = MIN_WIDTH;
  65       }
  66     }
  67   }
  68
  69   /**
  70    * Draw the overview panel's viewport box on a graphics object
  71    *
  72    * @param g
  73    *          the graphics object to draw on
  74    */
  75   public void drawBox(Graphics g)
  76   {
  77     g.drawRect(boxX, boxY, boxWidth, boxHeight);
  78     g.drawRect(boxX + 1, boxY + 1, boxWidth - 2, boxHeight - 2);
  79   }
  80
  81   public int getScrollCol()
  82   {
  83     return scrollCol;
  84   }
  85
  86   public int getScrollRow()
  87   {
  88     return scrollRow;
  89   }
  90
  91   public int getBoxX()
  92   {
  93     return boxX;
  94   }
  95
  96   public int getBoxY()
  97   {
  98     return boxY;
  99   }
 100
 101   public int getBoxWidth()
 102   {
 103     return boxWidth;
 104   }
 105
 106   public int getBoxHeight()
 107   {
 108     return boxHeight;
 109   }
 110
 111   public int getWidth()
 112   {
 113     return width;
 114   }
 115
 116   public int getHeight()
 117   {
 118     return sequencesHeight + graphHeight;
 119   }
 120
 121   public int getSequencesHeight()
 122   {
 123     return sequencesHeight;
 124   }
 125
 126   public int getGraphHeight()
 127   {
 128     return graphHeight;
 129   }
 130
 131   public float getPixelsPerCol()
 132   {
 133     return (float) width / alwidth;
 134   }
 135
 136   public float getPixelsPerSeq()
 137   {
 138     return (float) sequencesHeight / alheight;
 139   }
 140
 141   public void setWidth(int w)
 142   {
 143     width = w;
 144   }
 145
 146   public void setHeight(int h)
 147   {
 148     sequencesHeight = h - graphHeight;
 149   }
 150
 151   public abstract void updateViewportFromMouse(int mousex, int mousey,
 152           HiddenSequences hiddenSeqs, ColumnSelection hiddenCols,
 153           ViewportRanges ranges);
 154
 155   public abstract void setBoxPosition(HiddenSequences hiddenSeqs,
 156           ColumnSelection hiddenCols, ViewportRanges ranges);
 157
 158   public abstract AlignmentColsCollectionI getColumns(
 159           ViewportRanges ranges, ColumnSelection hiddenCols);
 160
 161   public abstract AlignmentRowsCollectionI getRows(
 162           ViewportRanges ranges, AlignmentI al);
 163 }