src/jalview/viewmodel/seqfeatures/FeaturesDisplayed.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.viewmodel.seqfeatures;
  22
  23 import jalview.api.FeaturesDisplayedI;
  24
  25 import java.util.Collection;
  26 import java.util.HashSet;
  27 import java.util.Iterator;
  28
  29 public class FeaturesDisplayed implements FeaturesDisplayedI
  30 {
  31   private HashSet<String> featuresDisplayed = new HashSet<String>();
  32
  33   private HashSet<String> featuresRegistered = new HashSet<String>();
  34
  35   public FeaturesDisplayed(FeaturesDisplayedI featuresDisplayed2)
  36   {
  37     Iterator<String> fdisp = featuresDisplayed2.getVisibleFeatures();
  38     String ftype;
  39     while (fdisp.hasNext())
  40     {
  41       ftype = fdisp.next();
  42       featuresDisplayed.add(ftype);
  43       featuresRegistered.add(ftype);
  44     }
  45   }
  46
  47   public FeaturesDisplayed()
  48   {
  49     // TODO Auto-generated constructor stub
  50   }
  51
  52   @Override
  53   public Iterator<String> getVisibleFeatures()
  54   {
  55     return featuresDisplayed.iterator();
  56   }
  57
  58   @Override
  59   public boolean isVisible(String featureType)
  60   {
  61     return featuresDisplayed.contains(featureType);
  62   }
  63
  64   @Override
  65   public boolean areVisible(Collection featureTypes)
  66   {
  67     return featuresDisplayed.containsAll(featureTypes);
  68   }
  69
  70   @Override
  71   public void clear()
  72   {
  73     featuresDisplayed.clear();
  74     featuresRegistered.clear();
  75   }
  76
  77   @Override
  78   public void setAllVisible(Collection makeVisible)
  79   {
  80     featuresDisplayed.addAll(makeVisible);
  81     featuresRegistered.addAll(makeVisible);
  82   }
  83
  84   @Override
  85   public void setAllRegisteredVisible()
  86   {
  87     featuresDisplayed.addAll(featuresRegistered);
  88   }
  89
  90   @Override
  91   public void setVisible(String featureType)
  92   {
  93     featuresDisplayed.add(featureType);
  94     featuresRegistered.add(featureType);
  95   }
  96
  97   @Override
  98   public boolean isRegistered(String type)
  99   {
 100     return featuresRegistered.contains(type);
 101   }
 102
 103   @Override
 104   public int getVisibleFeatureCount()
 105   {
 106     return featuresDisplayed.size();
 107   }
 108
 109   @Override
 110   public int getRegisterdFeaturesCount()
 111   {
 112     return featuresRegistered.size();
 113   }
 114 }