src/jalview/viewmodel/seqfeatures/FeaturesDisplayed.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.viewmodel.seqfeatures;
  22
  23 import jalview.api.FeaturesDisplayedI;
  24
  25 import java.util.Collection;
  26 import java.util.Collections;
  27 import java.util.HashSet;
  28 import java.util.Set;
  29
  30 public class FeaturesDisplayed implements FeaturesDisplayedI
  31 {
  32   private Set<String> featuresDisplayed = new HashSet<String>();
  33
  34   private Set<String> featuresRegistered = new HashSet<String>();
  35
  36   public FeaturesDisplayed(FeaturesDisplayedI featuresDisplayed2)
  37   {
  38     Set<String> fdisp = featuresDisplayed2.getVisibleFeatures();
  39     for (String ftype : fdisp)
  40     {
  41       featuresDisplayed.add(ftype);
  42       featuresRegistered.add(ftype);
  43     }
  44   }
  45
  46   public FeaturesDisplayed()
  47   {
  48   }
  49
  50   @Override
  51   public Set<String> getVisibleFeatures()
  52   {
  53     return Collections.unmodifiableSet(featuresDisplayed);
  54   }
  55
  56   @Override
  57   public boolean isVisible(String featureType)
  58   {
  59     return featuresDisplayed.contains(featureType);
  60   }
  61
  62   @Override
  63   public boolean areVisible(Collection<String> featureTypes)
  64   {
  65     return featuresDisplayed.containsAll(featureTypes);
  66   }
  67
  68   @Override
  69   public void clear()
  70   {
  71     featuresDisplayed.clear();
  72     featuresRegistered.clear();
  73   }
  74
  75   @Override
  76   public void setAllVisible(Collection<String> makeVisible)
  77   {
  78     featuresDisplayed.addAll(makeVisible);
  79     featuresRegistered.addAll(makeVisible);
  80   }
  81
  82   @Override
  83   public void setAllRegisteredVisible()
  84   {
  85     featuresDisplayed.addAll(featuresRegistered);
  86   }
  87
  88   @Override
  89   public void setVisible(String featureType)
  90   {
  91     featuresDisplayed.add(featureType);
  92     featuresRegistered.add(featureType);
  93   }
  94
  95   @Override
  96   public boolean isRegistered(String type)
  97   {
  98     return featuresRegistered.contains(type);
  99   }
 100
 101   @Override
 102   public int getVisibleFeatureCount()
 103   {
 104     return featuresDisplayed.size();
 105   }
 106
 107   @Override
 108   public int getRegisteredFeaturesCount()
 109   {
 110     return featuresRegistered.size();
 111   }
 112 }