src/jalview/workers/AlignCalcWorker.java

   1 /**
   2  *
   3  */
   4 package jalview.workers;
   5
   6 import jalview.api.AlignCalcManagerI;
   7 import jalview.api.AlignCalcWorkerI;
   8 import jalview.api.AlignViewportI;
   9 import jalview.api.AlignmentViewPanel;
  10
  11 /**
  12  * Base class for alignment calculation workers
  13  * @author jimp
  14  *
  15  */
  16 public abstract class AlignCalcWorker implements AlignCalcWorkerI
  17 {
  18   /**
  19    * manager and data source for calculations
  20    */
  21   protected AlignViewportI alignViewport;
  22   protected AlignCalcManagerI calcMan;
  23   protected AlignmentViewPanel ap;
  24
  25   public AlignCalcWorker(AlignViewportI alignViewport,
  26           AlignmentViewPanel alignPanel)
  27   {
  28     this.alignViewport = alignViewport;
  29     calcMan=alignViewport.getCalcManager();
  30     ap = alignPanel;
  31   }
  32   protected void abortAndDestroy()
  33   {
  34     if (calcMan!=null) {
  35       calcMan.workerComplete(this);
  36     }
  37     alignViewport=null;
  38     calcMan=null;
  39     ap=null;
  40
  41   }
  42
  43
  44 }