src/jalview/ws/dbsources/EbiFileRetrievedProxy.java

   1 /*
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  18  */
  19 package jalview.ws.dbsources;
  20
  21 import java.io.BufferedReader;
  22 import java.io.File;
  23 import java.io.FileReader;
  24 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxyImpl;
  25
  26 public abstract class EbiFileRetrievedProxy extends DbSourceProxyImpl
  27 {
  28
  29   /**
  30    * temp path to retrieved file
  31    */
  32   protected String file = null;
  33
  34   public StringBuffer getRawRecords()
  35   {
  36     if (file == null)
  37       return null;
  38     StringBuffer bf = null;
  39     try
  40     {
  41       File f = new File(file);
  42       if (f.exists())
  43       {
  44         bf = new StringBuffer();
  45         BufferedReader breader = new BufferedReader(new FileReader(f));
  46         String line = null;
  47         while (breader.ready() && (line = breader.readLine()) != null)
  48         {
  49           bf.append(line);
  50         }
  51         breader.close();
  52       }
  53     } catch (Exception e)
  54     {
  55       System.err.println("Warning: problems reading temp file " + file);
  56       return null;
  57     }
  58     return bf;
  59   }
  60
  61 }