src/jalview/ws/dbsources/PfamFull.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ws.dbsources;
  22
  23 /**
  24  * flyweight class specifying retrieval of Full family alignments from PFAM
  25  *
  26  */
  27 public class PfamFull extends Pfam
  28 {
  29   public PfamFull()
  30   {
  31     super();
  32     alignmentType = FULL;
  33   }
  34
  35   /*
  36    * (non-Javadoc)
  37    *
  38    * @see jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy#getDbName()
  39    */
  40   @Override
  41   public String getDbName()
  42   {
  43     return "PFAM (Full)";
  44   }
  45
  46   @Override
  47   public String getDbSource()
  48   {
  49     return getDbName(); // so we have unique DbSource string.
  50   }
  51
  52   @Override
  53   public String getTestQuery()
  54   {
  55     return "PF03760";
  56   }
  57
  58   @Override
  59   public String getDbVersion()
  60   {
  61     return null;
  62   }
  63
  64   @Override
  65   public int getTier()
  66   {
  67     return 0;
  68   }
  69 }