src/jalview/ws/dbsources/PfamFull.java

   1 /*
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  18  */
  19 package jalview.ws.dbsources;
  20
  21 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy;
  22
  23 /**
  24  * flyweight class specifying retrieval of Full family alignments from PFAM
  25  *
  26  */
  27 public class PfamFull extends Pfam implements DbSourceProxy
  28 {
  29   public PfamFull()
  30   {
  31     super();
  32   }
  33
  34   /*
  35    * (non-Javadoc)
  36    *
  37    * @see jalview.ws.dbsources.Pfam#getPFAMURL()
  38    */
  39   protected String getXFAMURL()
  40   {
  41     return "http://pfam.sanger.ac.uk/family/alignment/download/format?alnType=full&format=stockholm&order=t&case=l&gaps=default&entry=";
  42   }
  43
  44   /*
  45    * (non-Javadoc)
  46    *
  47    * @see jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy#getDbName()
  48    */
  49   public String getDbName()
  50   {
  51     return "PFAM (Full)";
  52   }
  53
  54   public String getDbSource()
  55   {
  56     return getDbName(); // so we have unique DbSource string.
  57   }
  58
  59   public String getTestQuery()
  60   {
  61     return "PF03760";
  62   }
  63
  64   public String getDbVersion()
  65   {
  66     return null;
  67   }
  68
  69    @Override
  70   public int getTier()
  71   {
  72     return 0;
  73   }
  74 }