src/jalview/ws/dbsources/PfamSeed.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ws.dbsources;
  22
  23 import jalview.datamodel.DBRefSource;
  24
  25 /**
  26  * flyweight class specifying retrieval of Seed alignments from PFAM
  27  *
  28  * @author JimP
  29  *
  30  */
  31 public class PfamSeed extends Pfam
  32 {
  33   public PfamSeed()
  34   {
  35     super();
  36   }
  37
  38   @Override
  39   public String getURLSuffix()
  40   {
  41     return "/alignment/seed";
  42   }
  43
  44   /*
  45    * (non-Javadoc)
  46    *
  47    * @see jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy#getDbName()
  48    */
  49   @Override
  50   public String getDbName()
  51   {
  52     return DBRefSource.PFAM_SEED;
  53   }
  54
  55   @Override
  56   public String getDbSource()
  57   {
  58     return jalview.datamodel.DBRefSource.PFAM; // archetype source
  59   }
  60
  61   @Override
  62   public String getTestQuery()
  63   {
  64     return "PF03760";
  65   }
  66
  67   @Override
  68   public int getTier()
  69   {
  70     return 0;
  71   }
  72 }