src/jalview/ws/dbsources/das/api/DasSourceRegistryI.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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  17  */
  18 package jalview.ws.dbsources.das.api;
  19
  20 import java.util.List;
  21
  22 import org.biodas.jdas.client.threads.MultipleConnectionPropertyProviderI;
  23
  24 /**
  25  * API for a registry that provides datasources that jalview can access
  26  *
  27  * @author jprocter
  28  *
  29  */
  30 public interface DasSourceRegistryI
  31 {
  32
  33   List<jalviewSourceI> getSources();
  34
  35   String getDasRegistryURL();
  36
  37   jalviewSourceI getSource(String nickname);
  38
  39   // TODO: re JAL-424 - introduce form where local source is queried for
  40   // metadata, rather than have it all provided by caller.
  41   jalviewSourceI createLocalSource(String uri, String name,
  42           boolean sequence, boolean features);
  43
  44   boolean removeLocalSource(jalviewSourceI source);
  45
  46   void refreshSources();
  47
  48   String getLocalSourceString();
  49
  50   List<jalviewSourceI> resolveSourceNicknames(List<String> sources);
  51
  52   // TODO: refactor to jDAS specific interface
  53   MultipleConnectionPropertyProviderI getSessionHandler();
  54 }